MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_008148	GC	3	6	623288	623293	0 %	0 %	50 %	50 %	108803439
19002	NC_008148	CCG	2	6	623321	623326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19003	NC_008148	CGGCCC	2	12	623344	623355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19004	NC_008148	GC	3	6	623404	623409	0 %	0 %	50 %	50 %	108803439
19005	NC_008148	TCG	2	6	623430	623435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803439
19006	NC_008148	ACC	2	6	623454	623459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803439
19007	NC_008148	ACC	2	6	623493	623498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803439
19008	NC_008148	CGG	2	6	623524	623529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803439
19009	NC_008148	CCT	2	6	623566	623571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803439
19010	NC_008148	C	6	6	623602	623607	0 %	0 %	0 %	100 %	108803439
19011	NC_008148	TCC	2	6	623611	623616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803439
19012	NC_008148	AG	3	6	623634	623639	50 %	0 %	50 %	0 %	108803439
19013	NC_008148	C	6	6	623640	623645	0 %	0 %	0 %	100 %	108803439
19014	NC_008148	CAC	3	9	623657	623665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803439
19015	NC_008148	GCC	2	6	623670	623675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19016	NC_008148	CGG	2	6	623695	623700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803439
19017	NC_008148	CCG	2	6	623710	623715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19018	NC_008148	GCC	2	6	623766	623771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19019	NC_008148	CGC	3	9	623801	623809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19020	NC_008148	CGC	2	6	623825	623830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19021	NC_008148	GCC	2	6	623837	623842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19022	NC_008148	GCC	2	6	623856	623861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19023	NC_008148	CGC	2	6	623864	623869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19024	NC_008148	CAG	2	6	623873	623878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803439
19025	NC_008148	CGC	2	6	623879	623884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19026	NC_008148	C	6	6	623886	623891	0 %	0 %	0 %	100 %	108803439
19027	NC_008148	C	6	6	623923	623928	0 %	0 %	0 %	100 %	108803439
19028	NC_008148	CCG	2	6	623936	623941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19029	NC_008148	CGC	2	6	623963	623968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19030	NC_008148	CG	3	6	623992	623997	0 %	0 %	50 %	50 %	108803439
19031	NC_008148	CGT	2	6	624007	624012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803439
19032	NC_008148	GCC	2	6	624025	624030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19033	NC_008148	CCG	2	6	624031	624036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19034	NC_008148	GCC	2	6	624070	624075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19035	NC_008148	CGCTC	2	10	624079	624088	0 %	20 %	20 %	60 %	108803439
19036	NC_008148	CGC	2	6	624095	624100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19037	NC_008148	CGC	2	6	624104	624109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
19038	NC_008148	GCA	2	6	624130	624135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803439
19039	NC_008148	GCGCC	2	10	624140	624149	0 %	0 %	40 %	60 %	108803439
19040	NC_008148	C	6	6	624167	624172	0 %	0 %	0 %	100 %	108803439
19041	NC_008148	CTCC	2	8	624188	624195	0 %	25 %	0 %	75 %	108803439
19042	NC_008148	TG	3	6	624254	624259	0 %	50 %	50 %	0 %	108803440
19043	NC_008148	G	6	6	624259	624264	0 %	0 %	100 %	0 %	108803440
19044	NC_008148	GGA	2	6	624292	624297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803440
19045	NC_008148	GCG	2	6	624312	624317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803440
19046	NC_008148	GGT	2	6	624344	624349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803440
19047	NC_008148	GCA	2	6	624373	624378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803440
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19049	NC_008148	CGG	2	6	624418	624423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803440
19050	NC_008148	CGC	2	6	624499	624504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803440
19051	NC_008148	TGG	2	6	624505	624510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803440
19052	NC_008148	GCG	2	6	624518	624523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803440
19053	NC_008148	G	6	6	624550	624555	0 %	0 %	100 %	0 %	108803440
19054	NC_008148	GAG	2	6	624563	624568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803440
19055	NC_008148	GCA	2	6	624586	624591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803440
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19057	NC_008148	GAG	2	6	624614	624619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803440
19058	NC_008148	AGC	2	6	624666	624671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803440
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19061	NC_008148	CGC	2	6	624788	624793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803440
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19063	NC_008148	CGC	3	9	624809	624817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803440
19064	NC_008148	CCG	2	6	624820	624825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803440
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19072	NC_008148	CCGC	2	8	624940	624947	0 %	0 %	25 %	75 %	108803440
19073	NC_008148	GGA	2	6	624983	624988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803440
19074	NC_008148	CGC	2	6	625043	625048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803440
19075	NC_008148	CAG	2	6	625055	625060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803440
19076	NC_008148	C	7	7	625082	625088	0 %	0 %	0 %	100 %	108803440
19077	NC_008148	CAGC	2	8	625132	625139	25 %	0 %	25 %	50 %	108803440
19078	NC_008148	CCG	2	6	625142	625147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803440
19079	NC_008148	GGCGG	2	10	625215	625224	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19080	NC_008148	AGG	2	6	625272	625277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803441
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19083	NC_008148	GT	3	6	625300	625305	0 %	50 %	50 %	0 %	108803441
19084	NC_008148	CGG	2	6	625326	625331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803441
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19086	NC_008148	TGG	2	6	625368	625373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803441
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19088	NC_008148	CGGGT	2	10	625461	625470	0 %	20 %	60 %	20 %	108803441
19089	NC_008148	CAG	2	6	625484	625489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803441
19090	NC_008148	CTG	2	6	625547	625552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803441
19091	NC_008148	CGC	2	6	625606	625611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803441
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19097	NC_008148	CCT	2	6	625807	625812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803442
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19101	NC_008148	CCGG	2	8	625903	625910	0 %	0 %	50 %	50 %	108803442
19102	NC_008148	GGA	2	6	625930	625935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803442
19103	NC_008148	GGC	2	6	625937	625942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803442
19104	NC_008148	CCA	2	6	625957	625962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803442
19105	NC_008148	CGC	2	6	625997	626002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803442
19106	NC_008148	CGAG	2	8	626017	626024	25 %	0 %	50 %	25 %	108803442
19107	NC_008148	TGC	2	6	626046	626051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803442
19108	NC_008148	GCG	2	6	626067	626072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803442
19109	NC_008148	CCGA	2	8	626088	626095	25 %	0 %	25 %	50 %	108803442
19110	NC_008148	GCC	2	6	626109	626114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803442
19111	NC_008148	CGC	3	9	626135	626143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803442
19112	NC_008148	CGCGC	2	10	626162	626171	0 %	0 %	40 %	60 %	108803442
19113	NC_008148	GAT	2	6	626234	626239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803442
19114	NC_008148	GCCGTA	2	12	626276	626287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108803442
19115	NC_008148	GCCA	2	8	626328	626335	25 %	0 %	25 %	50 %	108803442
19116	NC_008148	GCC	2	6	626391	626396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803442
19117	NC_008148	CGG	2	6	626431	626436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803442
19118	NC_008148	GCTC	2	8	626482	626489	0 %	25 %	25 %	50 %	108803442
19119	NC_008148	CCG	2	6	626524	626529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803443
19120	NC_008148	CGG	2	6	626547	626552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803443
19121	NC_008148	CGCA	2	8	626612	626619	25 %	0 %	25 %	50 %	108803443
19122	NC_008148	G	6	6	626676	626681	0 %	0 %	100 %	0 %	108803443
19123	NC_008148	GCG	2	6	626718	626723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803443
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19148	NC_008148	CTC	2	6	627479	627484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803445
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19221	NC_008148	CT	3	6	629648	629653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19229	NC_008148	GGGC	2	8	629915	629922	0 %	0 %	75 %	25 %	108803448
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19241	NC_008148	CTC	2	6	630415	630420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803450
19242	NC_008148	GCC	2	6	630426	630431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803450
19243	NC_008148	CTC	2	6	630469	630474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803450
19244	NC_008148	CCT	2	6	630480	630485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803450
19245	NC_008148	CGG	2	6	630502	630507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803450
19246	NC_008148	CCT	2	6	630513	630518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803450
19247	NC_008148	CTC	2	6	630526	630531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803450
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19260	NC_008148	AGCCC	2	10	630864	630873	20 %	0 %	20 %	60 %	108803450
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19271	NC_008148	CTCGGC	2	12	631264	631275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803450
19272	NC_008148	CGG	2	6	631320	631325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803450
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19344	NC_008148	TCG	2	6	633263	633268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803452
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19348	NC_008148	GC	4	8	633323	633330	0 %	0 %	50 %	50 %	108803452
19349	NC_008148	GGC	2	6	633340	633345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803452
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19359	NC_008148	GAGG	2	8	633553	633560	25 %	0 %	75 %	0 %	108803452
19360	NC_008148	GCG	3	9	633581	633589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803452
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19484	NC_008148	ACCTCC	2	12	637515	637526	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108803455
19485	NC_008148	CGG	2	6	637547	637552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803455
19486	NC_008148	TGG	2	6	637557	637562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803455
19487	NC_008148	CCGC	2	8	637564	637571	0 %	0 %	25 %	75 %	108803455
19488	NC_008148	GC	3	6	637611	637616	0 %	0 %	50 %	50 %	108803455
19489	NC_008148	CGG	2	6	637617	637622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803455
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