MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008148	CGGT	2	8	604930	604937	0 %	25 %	50 %	25 %	108803422
18502	NC_008148	CGC	2	6	604955	604960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
18503	NC_008148	GGC	2	6	604967	604972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803422
18504	NC_008148	GCCT	2	8	604992	604999	0 %	25 %	25 %	50 %	108803422
18505	NC_008148	GCC	2	6	605004	605009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
18506	NC_008148	CTT	2	6	605042	605047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803422
18507	NC_008148	CCG	2	6	605062	605067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
18508	NC_008148	TCA	2	6	605086	605091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803422
18509	NC_008148	CTC	2	6	605094	605099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803422
18510	NC_008148	CTGT	2	8	605154	605161	0 %	50 %	25 %	25 %	108803422
18511	NC_008148	CTG	2	6	605172	605177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803422
18512	NC_008148	GGC	2	6	605218	605223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803422
18513	NC_008148	GCC	2	6	605247	605252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
18514	NC_008148	TCG	2	6	605353	605358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803422
18515	NC_008148	CCT	2	6	605366	605371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803422
18516	NC_008148	CGC	2	6	605374	605379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
18517	NC_008148	C	6	6	605379	605384	0 %	0 %	0 %	100 %	108803422
18518	NC_008148	C	6	6	605386	605391	0 %	0 %	0 %	100 %	108803422
18519	NC_008148	GGA	2	6	605399	605404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803422
18520	NC_008148	GGA	2	6	605420	605425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803422
18521	NC_008148	GCCG	2	8	605426	605433	0 %	0 %	50 %	50 %	108803422
18522	NC_008148	CG	3	6	605435	605440	0 %	0 %	50 %	50 %	108803422
18523	NC_008148	G	6	6	605445	605450	0 %	0 %	100 %	0 %	108803422
18524	NC_008148	CGC	2	6	605544	605549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18525	NC_008148	GC	4	8	605551	605558	0 %	0 %	50 %	50 %	108803423
18526	NC_008148	CGG	2	6	605572	605577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803423
18527	NC_008148	CG	3	6	605578	605583	0 %	0 %	50 %	50 %	108803423
18528	NC_008148	GC	3	6	605615	605620	0 %	0 %	50 %	50 %	108803423
18529	NC_008148	GAG	2	6	605631	605636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
18530	NC_008148	CAC	2	6	605651	605656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803423
18531	NC_008148	GC	3	6	605665	605670	0 %	0 %	50 %	50 %	108803423
18532	NC_008148	CCG	2	6	605689	605694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18533	NC_008148	GCA	2	6	605711	605716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18534	NC_008148	CGC	2	6	605735	605740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18535	NC_008148	GGT	2	6	605768	605773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803423
18536	NC_008148	GAT	2	6	605780	605785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803423
18537	NC_008148	GCT	2	6	605837	605842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18538	NC_008148	TCG	2	6	605851	605856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18539	NC_008148	CCT	2	6	605858	605863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803423
18540	NC_008148	CCG	2	6	605881	605886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18541	NC_008148	GCG	2	6	605914	605919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803423
18542	NC_008148	C	6	6	605926	605931	0 %	0 %	0 %	100 %	108803423
18543	NC_008148	CGC	2	6	605939	605944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18544	NC_008148	GCCC	2	8	605993	606000	0 %	0 %	25 %	75 %	108803423
18545	NC_008148	CG	3	6	606011	606016	0 %	0 %	50 %	50 %	108803423
18546	NC_008148	AGG	2	6	606049	606054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
18547	NC_008148	GGA	2	6	606110	606115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
18548	NC_008148	GCT	2	6	606122	606127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18549	NC_008148	CGG	2	6	606148	606153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803423
18550	NC_008148	GACC	2	8	606179	606186	25 %	0 %	25 %	50 %	108803423
18551	NC_008148	GAG	2	6	606198	606203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
18552	NC_008148	CCT	2	6	606260	606265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803423
18553	NC_008148	TCG	2	6	606280	606285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18554	NC_008148	CGC	2	6	606301	606306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18555	NC_008148	CGCTG	2	10	606328	606337	0 %	20 %	40 %	40 %	108803423
18556	NC_008148	GCG	2	6	606352	606357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803423
18557	NC_008148	GGA	2	6	606383	606388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
18558	NC_008148	GC	3	6	606393	606398	0 %	0 %	50 %	50 %	108803423
18559	NC_008148	CCA	2	6	606412	606417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803423
18560	NC_008148	GGA	2	6	606437	606442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
18561	NC_008148	GCC	2	6	606513	606518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18562	NC_008148	GACC	2	8	606548	606555	25 %	0 %	25 %	50 %	108803423
18563	NC_008148	GCC	2	6	606587	606592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18564	NC_008148	CCG	2	6	606646	606651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18565	NC_008148	CTCG	2	8	606653	606660	0 %	25 %	25 %	50 %	108803423
18566	NC_008148	GAG	2	6	606663	606668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803423
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18569	NC_008148	TGC	2	6	606775	606780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18570	NC_008148	GCC	2	6	606819	606824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18571	NC_008148	C	6	6	606844	606849	0 %	0 %	0 %	100 %	108803423
18572	NC_008148	GCCCGC	2	12	606854	606865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18573	NC_008148	CGG	2	6	606891	606896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803423
18574	NC_008148	CGC	2	6	606929	606934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18575	NC_008148	GCC	2	6	606945	606950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803423
18576	NC_008148	GCT	2	6	606984	606989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803423
18577	NC_008148	AAT	3	9	607150	607158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_008148	GAT	2	6	607281	607286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803424
18579	NC_008148	ACC	3	9	607408	607416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803424
18580	NC_008148	GAT	2	6	607422	607427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803424
18581	NC_008148	CGG	2	6	607467	607472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803424
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18585	NC_008148	CGG	3	9	607618	607626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803424
18586	NC_008148	GCT	2	6	607635	607640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803424
18587	NC_008148	TCG	2	6	607646	607651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803424
18588	NC_008148	CCG	2	6	607661	607666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803424
18589	NC_008148	CGG	2	6	607685	607690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803424
18590	NC_008148	CAG	3	9	607705	607713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803424
18591	NC_008148	C	7	7	607746	607752	0 %	0 %	0 %	100 %	108803424
18592	NC_008148	CAG	2	6	607831	607836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803424
18593	NC_008148	AGA	2	6	607844	607849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803424
18594	NC_008148	AGG	2	6	607916	607921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803424
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18596	NC_008148	GAG	2	6	608041	608046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803424
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18598	NC_008148	CGG	2	6	608073	608078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803424
18599	NC_008148	CCTC	2	8	608102	608109	0 %	25 %	0 %	75 %	108803424
18600	NC_008148	GAT	2	6	608127	608132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803424
18601	NC_008148	GGTGCT	2	12	608151	608162	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	108803424
18602	NC_008148	CGG	2	6	608172	608177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803424
18603	NC_008148	GCG	2	6	608208	608213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803424
18604	NC_008148	GCCC	2	8	608244	608251	0 %	0 %	25 %	75 %	108803425
18605	NC_008148	TCG	2	6	608345	608350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803425
18606	NC_008148	GGT	2	6	608448	608453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803425
18607	NC_008148	GCT	2	6	608466	608471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803425
18608	NC_008148	TCA	2	6	608546	608551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803425
18609	NC_008148	TGG	2	6	608558	608563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803425
18610	NC_008148	CCCG	2	8	608616	608623	0 %	0 %	25 %	75 %	108803425
18611	NC_008148	CGC	2	6	608634	608639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803425
18612	NC_008148	C	6	6	608657	608662	0 %	0 %	0 %	100 %	108803425
18613	NC_008148	GGCG	2	8	608712	608719	0 %	0 %	75 %	25 %	108803425
18614	NC_008148	CCA	2	6	608753	608758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803425
18615	NC_008148	CGGG	2	8	608774	608781	0 %	0 %	75 %	25 %	108803425
18616	NC_008148	ATC	2	6	608833	608838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803425
18617	NC_008148	GCG	2	6	608845	608850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803425
18618	NC_008148	TGGCCG	2	12	608864	608875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108803425
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18620	NC_008148	GGC	2	6	608937	608942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803425
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18986	NC_008148	CCT	2	6	622903	622908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803439
18987	NC_008148	AGG	2	6	622983	622988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803439
18988	NC_008148	C	6	6	622998	623003	0 %	0 %	0 %	100 %	108803439
18989	NC_008148	CGC	2	6	623038	623043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
18990	NC_008148	GCC	2	6	623052	623057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
18991	NC_008148	ACC	2	6	623070	623075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803439
18992	NC_008148	CGAG	2	8	623095	623102	25 %	0 %	50 %	25 %	108803439
18993	NC_008148	AGC	2	6	623121	623126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803439
18994	NC_008148	CCG	2	6	623160	623165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803439
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18997	NC_008148	CCA	3	9	623203	623211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803439
18998	NC_008148	CGG	2	6	623251	623256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803439
18999	NC_008148	CTG	2	6	623262	623267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803439
19000	NC_008148	GCCTGC	2	12	623268	623279	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803439

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