MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008148	CCG	2	6	585106	585111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803407
18002	NC_008148	GGAG	2	8	585129	585136	25 %	0 %	75 %	0 %	108803407
18003	NC_008148	CCG	2	6	585146	585151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803407
18004	NC_008148	GCC	2	6	585175	585180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803407
18005	NC_008148	GCC	2	6	585183	585188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803407
18006	NC_008148	CCA	2	6	585215	585220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803407
18007	NC_008148	TGA	2	6	585266	585271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803407
18008	NC_008148	CGG	2	6	585278	585283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803407
18009	NC_008148	ACG	2	6	585295	585300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803407
18010	NC_008148	CTC	2	6	585306	585311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803407
18011	NC_008148	GGCGTC	2	12	585351	585362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108803407
18012	NC_008148	CAC	2	6	585432	585437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803407
18013	NC_008148	CCG	3	9	585530	585538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803407
18014	NC_008148	GGC	2	6	585540	585545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803407
18015	NC_008148	GGC	2	6	585555	585560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803407
18016	NC_008148	CCG	2	6	585566	585571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803407
18017	NC_008148	GAAC	2	8	585578	585585	50 %	0 %	25 %	25 %	108803407
18018	NC_008148	TCA	2	6	585640	585645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_008148	T	6	6	585736	585741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_008148	CGG	2	6	585762	585767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
18021	NC_008148	AGCC	2	8	585776	585783	25 %	0 %	25 %	50 %	108803408
18022	NC_008148	CTTT	2	8	585787	585794	0 %	75 %	0 %	25 %	108803408
18023	NC_008148	CTC	2	6	585799	585804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803408
18024	NC_008148	TCC	2	6	585851	585856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803408
18025	NC_008148	GCC	2	6	585858	585863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
18026	NC_008148	GTA	2	6	585874	585879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803408
18027	NC_008148	CCGC	2	8	585948	585955	0 %	0 %	25 %	75 %	108803408
18028	NC_008148	CTCCCG	2	12	585988	585999	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	108803408
18029	NC_008148	CGG	2	6	586041	586046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
18030	NC_008148	CGG	3	9	586125	586133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
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18032	NC_008148	CG	3	6	586156	586161	0 %	0 %	50 %	50 %	108803408
18033	NC_008148	G	6	6	586176	586181	0 %	0 %	100 %	0 %	108803408
18034	NC_008148	GC	3	6	586186	586191	0 %	0 %	50 %	50 %	108803408
18035	NC_008148	AGG	2	6	586211	586216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803408
18036	NC_008148	CGG	2	6	586269	586274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
18037	NC_008148	CCG	3	9	586299	586307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
18038	NC_008148	CGC	2	6	586335	586340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
18039	NC_008148	AGC	2	6	586400	586405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803408
18040	NC_008148	CAC	2	6	586414	586419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803408
18041	NC_008148	GTA	2	6	586495	586500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803408
18042	NC_008148	GCG	2	6	586540	586545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
18043	NC_008148	TCC	2	6	586553	586558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803408
18044	NC_008148	TCGT	2	8	586634	586641	0 %	50 %	25 %	25 %	108803408
18045	NC_008148	CGG	2	6	586698	586703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
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18047	NC_008148	C	7	7	586719	586725	0 %	0 %	0 %	100 %	108803408
18048	NC_008148	CGC	2	6	586756	586761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
18049	NC_008148	CAC	2	6	586765	586770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803408
18050	NC_008148	CGG	2	6	586797	586802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
18051	NC_008148	C	6	6	586803	586808	0 %	0 %	0 %	100 %	108803408
18052	NC_008148	GGCC	2	8	586824	586831	0 %	0 %	50 %	50 %	108803408
18053	NC_008148	CGC	2	6	586834	586839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
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18055	NC_008148	GCC	2	6	586862	586867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
18056	NC_008148	GA	5	10	586934	586943	50 %	0 %	50 %	0 %	108803408
18057	NC_008148	CCG	2	6	586944	586949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803408
18058	NC_008148	CGCGAG	2	12	586960	586971	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803408
18059	NC_008148	GAA	2	6	587002	587007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803408
18060	NC_008148	GGC	2	6	587020	587025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803408
18061	NC_008148	CG	3	6	587043	587048	0 %	0 %	50 %	50 %	108803408
18062	NC_008148	C	6	6	587100	587105	0 %	0 %	0 %	100 %	108803408
18063	NC_008148	GCA	2	6	587106	587111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803408
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18065	NC_008148	CAG	3	9	587164	587172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803408
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18082	NC_008148	CCCCG	2	10	587483	587492	0 %	0 %	20 %	80 %	108803408
18083	NC_008148	CGAG	2	8	587505	587512	25 %	0 %	50 %	25 %	108803408
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18087	NC_008148	GAGCGC	2	12	587605	587616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803408
18088	NC_008148	GAG	2	6	587635	587640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803408
18089	NC_008148	GGC	2	6	587701	587706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_008148	CCG	2	6	587707	587712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18091	NC_008148	TTC	2	6	587732	587737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_008148	CG	3	6	587738	587743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18093	NC_008148	CGA	2	6	587832	587837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803409
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18103	NC_008148	TCCA	2	8	588031	588038	25 %	25 %	0 %	50 %	108803409
18104	NC_008148	GCGCC	2	10	588062	588071	0 %	0 %	40 %	60 %	108803409
18105	NC_008148	GCA	2	6	588102	588107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803409
18106	NC_008148	GACCCC	2	12	588262	588273	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108803409
18107	NC_008148	GCA	2	6	588282	588287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803409
18108	NC_008148	TCT	2	6	588311	588316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803409
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18111	NC_008148	TCG	2	6	588476	588481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803409
18112	NC_008148	CGA	2	6	588489	588494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803409
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18114	NC_008148	GCT	2	6	588597	588602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803409
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18118	NC_008148	TGG	2	6	588662	588667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803409
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18235	NC_008148	TCTT	2	8	593881	593888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18364	NC_008148	TGG	2	6	600219	600224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803418
18365	NC_008148	CGGGGA	2	12	600235	600246	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108803418
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18367	NC_008148	CCGG	2	8	600289	600296	0 %	0 %	50 %	50 %	108803418
18368	NC_008148	CGA	3	9	600307	600315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803418
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18484	NC_008148	CTC	2	6	604506	604511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803422
18485	NC_008148	GGCG	2	8	604520	604527	0 %	0 %	75 %	25 %	108803422
18486	NC_008148	CAT	2	6	604553	604558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803422
18487	NC_008148	TCG	2	6	604564	604569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803422
18488	NC_008148	TGA	2	6	604570	604575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803422
18489	NC_008148	TCT	2	6	604585	604590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803422
18490	NC_008148	CTG	3	9	604593	604601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803422
18491	NC_008148	CGG	2	6	604622	604627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803422
18492	NC_008148	G	6	6	604683	604688	0 %	0 %	100 %	0 %	108803422
18493	NC_008148	TC	3	6	604709	604714	0 %	50 %	0 %	50 %	108803422
18494	NC_008148	TTC	2	6	604716	604721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803422
18495	NC_008148	GCAGCG	2	12	604771	604782	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803422
18496	NC_008148	GC	3	6	604840	604845	0 %	0 %	50 %	50 %	108803422
18497	NC_008148	TGG	2	6	604846	604851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803422
18498	NC_008148	GCC	2	6	604857	604862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
18499	NC_008148	CGA	2	6	604915	604920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803422
18500	NC_008148	TGC	2	6	604924	604929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803422

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