MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_008148	GAC	2	6	550993	550998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803366
17003	NC_008148	GC	3	6	551021	551026	0 %	0 %	50 %	50 %	108803366
17004	NC_008148	GGC	2	6	551079	551084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803366
17005	NC_008148	GAG	3	9	551089	551097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803366
17006	NC_008148	GCG	2	6	551114	551119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803366
17007	NC_008148	GCC	2	6	551123	551128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803366
17008	NC_008148	CCGGT	2	10	551141	551150	0 %	20 %	40 %	40 %	108803366
17009	NC_008148	GCC	2	6	551152	551157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803366
17010	NC_008148	CGC	2	6	551170	551175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803366
17011	NC_008148	CGGCC	2	10	551188	551197	0 %	0 %	40 %	60 %	108803366
17012	NC_008148	TCGCG	2	10	551277	551286	0 %	20 %	40 %	40 %	108803366
17013	NC_008148	CG	3	6	551302	551307	0 %	0 %	50 %	50 %	108803366
17014	NC_008148	GGC	2	6	551338	551343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803366
17015	NC_008148	GCGAGC	2	12	551357	551368	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803366
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17017	NC_008148	CGGTC	2	10	551427	551436	0 %	20 %	40 %	40 %	108803366
17018	NC_008148	CGC	2	6	551506	551511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803366
17019	NC_008148	GCCCCC	2	12	551513	551524	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	108803366
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17023	NC_008148	AGCGC	2	10	551613	551622	20 %	0 %	40 %	40 %	108803366
17024	NC_008148	CCCT	2	8	551712	551719	0 %	25 %	0 %	75 %	108803367
17025	NC_008148	CGG	2	6	551731	551736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803367
17026	NC_008148	TGA	2	6	551760	551765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803367
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17028	NC_008148	CG	3	6	551790	551795	0 %	0 %	50 %	50 %	108803367
17029	NC_008148	GGC	2	6	551800	551805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803367
17030	NC_008148	CGG	2	6	551826	551831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803367
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17033	NC_008148	GGA	2	6	551890	551895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803367
17034	NC_008148	CAG	2	6	552057	552062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803368
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17036	NC_008148	TCT	2	6	552266	552271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803368
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17039	NC_008148	CGAC	2	8	552428	552435	25 %	0 %	25 %	50 %	108803368
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17041	NC_008148	AGCC	2	8	552492	552499	25 %	0 %	25 %	50 %	108803368
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17053	NC_008148	GCGG	2	8	553169	553176	0 %	0 %	75 %	25 %	108803369
17054	NC_008148	C	6	6	553217	553222	0 %	0 %	0 %	100 %	108803369
17055	NC_008148	CCGC	2	8	553293	553300	0 %	0 %	25 %	75 %	108803370
17056	NC_008148	GGA	2	6	553311	553316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803370
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17063	NC_008148	CGA	2	6	553622	553627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803371
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17087	NC_008148	GAG	2	6	554463	554468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803372
17088	NC_008148	GC	3	6	554484	554489	0 %	0 %	50 %	50 %	108803372
17089	NC_008148	CGG	2	6	554536	554541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803372
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17093	NC_008148	A	6	6	554661	554666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_008148	GCC	2	6	554713	554718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17095	NC_008148	TCT	2	6	554774	554779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17103	NC_008148	AGA	2	6	554929	554934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803373
17104	NC_008148	CAC	2	6	554945	554950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803373
17105	NC_008148	GCGG	2	8	554954	554961	0 %	0 %	75 %	25 %	108803373
17106	NC_008148	CAGCCG	2	12	554967	554978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108803373
17107	NC_008148	T	6	6	555011	555016	0 %	100 %	0 %	0 %	108803373
17108	NC_008148	CTGAAC	2	12	555078	555089	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108803373
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17111	NC_008148	CGG	2	6	555130	555135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803373
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17118	NC_008148	CCG	2	6	555337	555342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803374
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17120	NC_008148	ACC	2	6	555356	555361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803374
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17122	NC_008148	CCCG	2	8	555489	555496	0 %	0 %	25 %	75 %	108803374
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17240	NC_008148	ATC	2	6	559526	559531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803378
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17243	NC_008148	GACCTC	2	12	559700	559711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108803379
17244	NC_008148	TCA	2	6	559773	559778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803379
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17248	NC_008148	GCT	2	6	559912	559917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803379
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17363	NC_008148	ACG	2	6	563621	563626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803382
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17366	NC_008148	ACC	2	6	563675	563680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803382
17367	NC_008148	CCA	2	6	563691	563696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803382
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17375	NC_008148	AGGTGA	2	12	564145	564156	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	108803383
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17382	NC_008148	GAGG	2	8	564437	564444	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17383	NC_008148	GCGG	2	8	564459	564466	0 %	0 %	75 %	25 %	108803385
17384	NC_008148	CGG	2	6	564526	564531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803385
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17390	NC_008148	GAC	2	6	564778	564783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803385
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17451	NC_008148	GGCGG	2	10	566895	566904	0 %	0 %	80 %	20 %	108803385
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17463	NC_008148	GC	3	6	567310	567315	0 %	0 %	50 %	50 %	108803386
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17476	NC_008148	GGC	2	6	567686	567691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803386
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17479	NC_008148	GCG	2	6	567795	567800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803386
17480	NC_008148	GCC	2	6	567855	567860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803386
17481	NC_008148	GCT	2	6	567947	567952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803387
17482	NC_008148	CGT	2	6	567989	567994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803387
17483	NC_008148	C	6	6	568065	568070	0 %	0 %	0 %	100 %	108803387
17484	NC_008148	CTC	2	6	568074	568079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803387
17485	NC_008148	CCA	3	9	568082	568090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803387
17486	NC_008148	CGG	2	6	568107	568112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803387
17487	NC_008148	C	6	6	568231	568236	0 %	0 %	0 %	100 %	108803387
17488	NC_008148	CGCC	2	8	568261	568268	0 %	0 %	25 %	75 %	108803387
17489	NC_008148	TCT	2	6	568328	568333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803387
17490	NC_008148	CGA	2	6	568370	568375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803387
17491	NC_008148	C	6	6	568435	568440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17492	NC_008148	ATC	2	6	568483	568488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17493	NC_008148	ACG	2	6	568568	568573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803388
17494	NC_008148	C	6	6	568642	568647	0 %	0 %	0 %	100 %	108803388
17495	NC_008148	GCT	2	6	568666	568671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803388
17496	NC_008148	GCCG	2	8	568680	568687	0 %	0 %	50 %	50 %	108803388
17497	NC_008148	GCTGC	2	10	568715	568724	0 %	20 %	40 %	40 %	108803388
17498	NC_008148	GACC	2	8	568774	568781	25 %	0 %	25 %	50 %	108803388
17499	NC_008148	CTG	2	6	568784	568789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803388
17500	NC_008148	AGC	2	6	568833	568838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803388

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