MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16004	NC_008148	TCG	2	6	520416	520421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803333
16005	NC_008148	C	6	6	520468	520473	0 %	0 %	0 %	100 %	108803333
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16240	NC_008148	GCT	2	6	527197	527202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16241	NC_008148	CGC	2	6	527203	527208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16242	NC_008148	TCC	2	6	527217	527222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803341
16243	NC_008148	CGG	2	6	527230	527235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16244	NC_008148	GCT	2	6	527236	527241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16245	NC_008148	GCT	3	9	527308	527316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16246	NC_008148	CCG	2	6	527334	527339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16247	NC_008148	GGCT	2	8	527348	527355	0 %	25 %	50 %	25 %	108803341
16248	NC_008148	GCGGG	2	10	527410	527419	0 %	0 %	80 %	20 %	108803341
16249	NC_008148	GTG	2	6	527456	527461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803341
16250	NC_008148	GCC	2	6	527488	527493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16251	NC_008148	GCC	2	6	527503	527508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16252	NC_008148	GCC	3	9	527546	527554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16253	NC_008148	CCG	2	6	527556	527561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16254	NC_008148	TGC	2	6	527565	527570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16255	NC_008148	GCG	2	6	527624	527629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16256	NC_008148	GAG	2	6	527630	527635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16257	NC_008148	ACG	2	6	527664	527669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16258	NC_008148	TGGGAC	2	12	527675	527686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108803341
16259	NC_008148	CGG	2	6	527690	527695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16260	NC_008148	CTA	2	6	527704	527709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803341
16261	NC_008148	CTC	2	6	527710	527715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803341
16262	NC_008148	GGA	2	6	527743	527748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16263	NC_008148	GAG	2	6	527759	527764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16264	NC_008148	CGA	2	6	527767	527772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16265	NC_008148	CGG	2	6	527780	527785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16266	NC_008148	GCT	2	6	527809	527814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16267	NC_008148	GAG	2	6	527816	527821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16268	NC_008148	GCC	2	6	527841	527846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16269	NC_008148	CGC	2	6	527981	527986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16270	NC_008148	GAG	2	6	527996	528001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16271	NC_008148	GCT	2	6	528004	528009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16272	NC_008148	ACG	2	6	528024	528029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16273	NC_008148	CTT	2	6	528055	528060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803341
16274	NC_008148	GGGGAC	2	12	528095	528106	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108803341
16275	NC_008148	GAT	2	6	528145	528150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803341
16276	NC_008148	GCT	2	6	528184	528189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16277	NC_008148	CGA	2	6	528256	528261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16278	NC_008148	CTC	2	6	528272	528277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803341
16279	NC_008148	TCC	2	6	528287	528292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803341
16280	NC_008148	GAG	2	6	528293	528298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16281	NC_008148	GCC	2	6	528299	528304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16282	NC_008148	GCT	2	6	528319	528324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16283	NC_008148	CGG	2	6	528372	528377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16284	NC_008148	CGG	2	6	528397	528402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16285	NC_008148	GCCGG	2	10	528413	528422	0 %	0 %	60 %	40 %	108803341
16286	NC_008148	G	6	6	528476	528481	0 %	0 %	100 %	0 %	108803341
16287	NC_008148	GCG	2	6	528550	528555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16288	NC_008148	GAG	2	6	528569	528574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16289	NC_008148	GGC	2	6	528648	528653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803341
16290	NC_008148	GAG	2	6	528701	528706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803341
16291	NC_008148	GGT	2	6	528736	528741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803341
16292	NC_008148	CCGG	2	8	528838	528845	0 %	0 %	50 %	50 %	108803341
16293	NC_008148	CTG	2	6	528872	528877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16294	NC_008148	CGCT	2	8	528896	528903	0 %	25 %	25 %	50 %	108803341
16295	NC_008148	GCC	2	6	528953	528958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16296	NC_008148	CGA	2	6	529000	529005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16297	NC_008148	CTC	2	6	529021	529026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803341
16298	NC_008148	CCA	2	6	529039	529044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803341
16299	NC_008148	TCGT	2	8	529076	529083	0 %	50 %	25 %	25 %	108803341
16300	NC_008148	GGAT	2	8	529089	529096	25 %	25 %	50 %	0 %	108803341
16301	NC_008148	ACG	3	9	529104	529112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803341
16302	NC_008148	GTG	2	6	529163	529168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803341
16303	NC_008148	GAGG	2	8	529183	529190	25 %	0 %	75 %	0 %	108803341
16304	NC_008148	GGCTG	2	10	529212	529221	0 %	20 %	60 %	20 %	108803341
16305	NC_008148	CGC	2	6	529261	529266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803341
16306	NC_008148	CTC	2	6	529280	529285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803341
16307	NC_008148	GC	3	6	529338	529343	0 %	0 %	50 %	50 %	108803342
16308	NC_008148	GTCCA	2	10	529354	529363	20 %	20 %	20 %	40 %	108803342
16309	NC_008148	GGCC	2	8	529422	529429	0 %	0 %	50 %	50 %	108803342
16310	NC_008148	G	6	6	529434	529439	0 %	0 %	100 %	0 %	108803342
16311	NC_008148	GGC	2	6	529491	529496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803342
16312	NC_008148	GTG	2	6	529516	529521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803342
16313	NC_008148	CG	3	6	529533	529538	0 %	0 %	50 %	50 %	108803342
16314	NC_008148	AGGACC	2	12	529540	529551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16315	NC_008148	CGC	2	6	529565	529570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803342
16316	NC_008148	GCGA	2	8	529585	529592	25 %	0 %	50 %	25 %	108803342
16317	NC_008148	GAT	2	6	529593	529598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803342
16318	NC_008148	CAG	2	6	529609	529614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16319	NC_008148	GTT	2	6	529620	529625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803342
16320	NC_008148	GGC	2	6	529672	529677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803342
16321	NC_008148	GGA	2	6	529689	529694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803342
16322	NC_008148	CCG	2	6	529726	529731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803342
16323	NC_008148	AGGT	2	8	529750	529757	25 %	25 %	50 %	0 %	108803342
16324	NC_008148	GAC	2	6	529770	529775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16325	NC_008148	TGG	2	6	529790	529795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803342
16326	NC_008148	CTC	2	6	529821	529826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803342
16327	NC_008148	GCG	2	6	529856	529861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803342
16328	NC_008148	GCA	2	6	529874	529879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16329	NC_008148	GCCC	2	8	529903	529910	0 %	0 %	25 %	75 %	108803342
16330	NC_008148	GTC	2	6	530022	530027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16331	NC_008148	CTC	2	6	530070	530075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803342
16332	NC_008148	GCC	2	6	530108	530113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803342
16333	NC_008148	CAT	2	6	530130	530135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803342
16334	NC_008148	AGC	2	6	530158	530163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16335	NC_008148	TCG	2	6	530203	530208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803342
16336	NC_008148	CGC	2	6	530223	530228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803342
16337	NC_008148	CCT	3	9	530287	530295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16338	NC_008148	GAG	2	6	530538	530543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803343
16339	NC_008148	ACC	2	6	530608	530613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803343
16340	NC_008148	CCG	2	6	530658	530663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803343
16341	NC_008148	GAG	2	6	530706	530711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803343
16342	NC_008148	CGTCC	2	10	530772	530781	0 %	20 %	20 %	60 %	108803343
16343	NC_008148	AGG	2	6	530800	530805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803343
16344	NC_008148	GCG	2	6	530865	530870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803343
16345	NC_008148	CTCCG	2	10	530877	530886	0 %	20 %	20 %	60 %	108803343
16346	NC_008148	CCT	2	6	530918	530923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803343
16347	NC_008148	CAG	2	6	530946	530951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803343
16348	NC_008148	CCG	2	6	530953	530958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803343
16349	NC_008148	GCC	2	6	531017	531022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803343
16350	NC_008148	GC	3	6	531040	531045	0 %	0 %	50 %	50 %	108803343
16351	NC_008148	GGTAGG	2	12	531068	531079	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803343
16352	NC_008148	TCG	2	6	531089	531094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803343
16353	NC_008148	GCC	2	6	531117	531122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803343
16354	NC_008148	GAT	2	6	531141	531146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803343
16355	NC_008148	CCA	2	6	531185	531190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803343
16356	NC_008148	CGG	2	6	531200	531205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803343
16357	NC_008148	GCC	2	6	531223	531228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803343
16358	NC_008148	CCT	2	6	531270	531275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803343
16359	NC_008148	CAGGCC	2	12	531283	531294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108803343
16360	NC_008148	GCG	2	6	531332	531337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803343
16361	NC_008148	CGTT	2	8	531350	531357	0 %	50 %	25 %	25 %	108803343
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16483	NC_008148	GCC	2	6	534863	534868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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