MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008148	GAGGG	2	10	423336	423345	20 %	0 %	80 %	0 %	108803245
13002	NC_008148	CGCCC	2	10	423398	423407	0 %	0 %	20 %	80 %	108803245
13003	NC_008148	GCG	2	6	423411	423416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803245
13004	NC_008148	CGG	2	6	423451	423456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803245
13005	NC_008148	GGT	2	6	423482	423487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803245
13006	NC_008148	CTGC	2	8	423512	423519	0 %	25 %	25 %	50 %	108803245
13007	NC_008148	CAG	2	6	423551	423556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803245
13008	NC_008148	GCC	2	6	423564	423569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803245
13009	NC_008148	ACC	2	6	423579	423584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803245
13010	NC_008148	GCGA	2	8	423600	423607	25 %	0 %	50 %	25 %	108803245
13011	NC_008148	GGCC	2	8	423619	423626	0 %	0 %	50 %	50 %	108803245
13012	NC_008148	AGG	2	6	423627	423632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803245
13013	NC_008148	CGC	2	6	423643	423648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803245
13014	NC_008148	CGC	2	6	423655	423660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803245
13015	NC_008148	ACC	2	6	423666	423671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803245
13016	NC_008148	CAC	2	6	423686	423691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803245
13017	NC_008148	TCA	2	6	423709	423714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803245
13018	NC_008148	G	6	6	423720	423725	0 %	0 %	100 %	0 %	108803245
13019	NC_008148	AGC	2	6	423732	423737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803245
13020	NC_008148	CGC	2	6	423755	423760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803245
13021	NC_008148	GAG	2	6	423767	423772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803245
13022	NC_008148	CAG	2	6	423800	423805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803245
13023	NC_008148	CGCCC	2	10	423806	423815	0 %	0 %	20 %	80 %	108803245
13024	NC_008148	ACC	2	6	423861	423866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803245
13025	NC_008148	TCCCC	2	10	423886	423895	0 %	20 %	0 %	80 %	108803245
13026	NC_008148	ATG	2	6	423903	423908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803245
13027	NC_008148	CGG	2	6	423922	423927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803245
13028	NC_008148	CGA	2	6	423928	423933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803245
13029	NC_008148	AGG	2	6	423999	424004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803245
13030	NC_008148	CGG	2	6	424024	424029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803245
13031	NC_008148	AGC	2	6	424032	424037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803245
13032	NC_008148	GCC	2	6	424077	424082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803246
13033	NC_008148	GCA	2	6	424092	424097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13034	NC_008148	CCA	3	9	424125	424133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803246
13035	NC_008148	TGA	2	6	424146	424151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803246
13036	NC_008148	CCA	2	6	424159	424164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803246
13037	NC_008148	ACG	2	6	424211	424216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13038	NC_008148	CGC	2	6	424239	424244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803246
13039	NC_008148	GCC	2	6	424249	424254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803246
13040	NC_008148	GAC	2	6	424276	424281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13041	NC_008148	CGA	2	6	424284	424289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13042	NC_008148	TGAGGG	2	12	424296	424307	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803246
13043	NC_008148	AGG	2	6	424392	424397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803246
13044	NC_008148	CCG	2	6	424451	424456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803246
13045	NC_008148	GCA	2	6	424491	424496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13046	NC_008148	AGCACC	2	12	424511	424522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108803246
13047	NC_008148	AGA	2	6	424530	424535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803246
13048	NC_008148	GGT	2	6	424654	424659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803246
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13050	NC_008148	GAT	2	6	424792	424797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803246
13051	NC_008148	CCG	2	6	424844	424849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803246
13052	NC_008148	ACC	2	6	424853	424858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803246
13053	NC_008148	AGC	3	9	424880	424888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13054	NC_008148	AGGT	2	8	424892	424899	25 %	25 %	50 %	0 %	108803246
13055	NC_008148	GCC	2	6	424909	424914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803246
13056	NC_008148	CGG	2	6	424920	424925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803246
13057	NC_008148	GAA	2	6	424930	424935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803246
13058	NC_008148	GCGGCC	2	12	424958	424969	0 %	0 %	50 %	50 %	108803246
13059	NC_008148	AGC	2	6	424976	424981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803246
13060	NC_008148	CG	3	6	425031	425036	0 %	0 %	50 %	50 %	108803246
13061	NC_008148	G	6	6	425036	425041	0 %	0 %	100 %	0 %	108803246
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13064	NC_008148	GTC	2	6	425190	425195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803247
13065	NC_008148	GCT	2	6	425196	425201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803247
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13067	NC_008148	GGTCG	2	10	425286	425295	0 %	20 %	60 %	20 %	108803247
13068	NC_008148	AGC	2	6	425299	425304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803247
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13071	NC_008148	CAG	2	6	425322	425327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803247
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13076	NC_008148	CGG	2	6	425437	425442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803247
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13078	NC_008148	AGC	2	6	425458	425463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803247
13079	NC_008148	GCC	2	6	425474	425479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803247
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13082	NC_008148	CCTC	2	8	425600	425607	0 %	25 %	0 %	75 %	108803247
13083	NC_008148	CCG	2	6	425608	425613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803247
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13087	NC_008148	CTGCCC	2	12	425670	425681	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	108803247
13088	NC_008148	GCC	2	6	425688	425693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803247
13089	NC_008148	GC	3	6	425749	425754	0 %	0 %	50 %	50 %	108803247
13090	NC_008148	GGA	3	9	425768	425776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803247
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13092	NC_008148	C	6	6	425784	425789	0 %	0 %	0 %	100 %	108803247
13093	NC_008148	G	6	6	425799	425804	0 %	0 %	100 %	0 %	108803247
13094	NC_008148	CGC	2	6	425828	425833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803247
13095	NC_008148	GTC	2	6	425866	425871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803247
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13099	NC_008148	GGCG	2	8	426014	426021	0 %	0 %	75 %	25 %	108803247
13100	NC_008148	CGAG	2	8	426152	426159	25 %	0 %	50 %	25 %	108803247
13101	NC_008148	CAC	2	6	426165	426170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803247
13102	NC_008148	C	6	6	426170	426175	0 %	0 %	0 %	100 %	108803247
13103	NC_008148	CAG	2	6	426186	426191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803247
13104	NC_008148	CGC	2	6	426208	426213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803247
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13106	NC_008148	GCCA	2	8	426253	426260	25 %	0 %	25 %	50 %	108803247
13107	NC_008148	CGG	2	6	426311	426316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803247
13108	NC_008148	GCCC	2	8	426321	426328	0 %	0 %	25 %	75 %	108803247
13109	NC_008148	GCGG	2	8	426330	426337	0 %	0 %	75 %	25 %	108803247
13110	NC_008148	GAG	2	6	426346	426351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803247
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13112	NC_008148	GAG	2	6	426372	426377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803247
13113	NC_008148	GAC	2	6	426396	426401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803247
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13118	NC_008148	CCG	2	6	426514	426519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803247
13119	NC_008148	TGA	2	6	426604	426609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803248
13120	NC_008148	TCG	2	6	426660	426665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13121	NC_008148	ACC	2	6	426681	426686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803248
13122	NC_008148	GTT	2	6	426710	426715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803248
13123	NC_008148	CCT	2	6	426736	426741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803248
13124	NC_008148	GCA	2	6	426757	426762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13125	NC_008148	CGGG	2	8	426799	426806	0 %	0 %	75 %	25 %	108803248
13126	NC_008148	AGG	2	6	426820	426825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803248
13127	NC_008148	CTG	2	6	426839	426844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13128	NC_008148	ACC	2	6	426894	426899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803248
13129	NC_008148	CGA	2	6	426922	426927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13130	NC_008148	GCA	2	6	426934	426939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13131	NC_008148	TCT	2	6	427009	427014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803248
13132	NC_008148	GTTGGC	2	12	427037	427048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	108803248
13133	NC_008148	CCT	2	6	427087	427092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803248
13134	NC_008148	CGT	2	6	427099	427104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13135	NC_008148	ACC	2	6	427146	427151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803248
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13141	NC_008148	TGA	2	6	427300	427305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803248
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13143	NC_008148	TGA	2	6	427363	427368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803248
13144	NC_008148	CTG	2	6	427379	427384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13145	NC_008148	CACGTC	2	12	427397	427408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108803248
13146	NC_008148	CTC	2	6	427427	427432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803248
13147	NC_008148	CTC	2	6	427442	427447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803248
13148	NC_008148	TTG	2	6	427458	427463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803248
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13151	NC_008148	GCT	2	6	427502	427507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803248
13152	NC_008148	GCC	2	6	427544	427549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803248
13153	NC_008148	CTG	2	6	427559	427564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803248
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13156	NC_008148	CCG	2	6	427600	427605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803248
13157	NC_008148	CGG	2	6	427609	427614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803248
13158	NC_008148	GCC	2	6	427623	427628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803248
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13160	NC_008148	AGA	2	6	427652	427657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803248
13161	NC_008148	CTC	2	6	427676	427681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13162	NC_008148	TC	4	8	427715	427722	0 %	50 %	0 %	50 %	108803249
13163	NC_008148	GCCG	2	8	427728	427735	0 %	0 %	50 %	50 %	108803249
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13192	NC_008148	CCG	2	6	428690	428695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803249
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13200	NC_008148	CTC	2	6	429087	429092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13201	NC_008148	CGG	2	6	429116	429121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13203	NC_008148	TGG	2	6	429167	429172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13204	NC_008148	GAG	2	6	429213	429218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13205	NC_008148	GC	3	6	429243	429248	0 %	0 %	50 %	50 %	108803250
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13225	NC_008148	G	6	6	429897	429902	0 %	0 %	100 %	0 %	108803250
13226	NC_008148	G	6	6	429906	429911	0 %	0 %	100 %	0 %	108803250
13227	NC_008148	CCT	2	6	429914	429919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803250
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13230	NC_008148	CGT	2	6	430005	430010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803250
13231	NC_008148	CGG	2	6	430047	430052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803250
13232	NC_008148	GCCC	2	8	430114	430121	0 %	0 %	25 %	75 %	108803250
13233	NC_008148	GAG	2	6	430183	430188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803250
13234	NC_008148	CGC	2	6	430197	430202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803250
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13236	NC_008148	CGG	2	6	430338	430343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803251
13237	NC_008148	C	7	7	430357	430363	0 %	0 %	0 %	100 %	108803251
13238	NC_008148	ACC	2	6	430368	430373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803251
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13240	NC_008148	GTG	2	6	430535	430540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803251
13241	NC_008148	TCA	2	6	430671	430676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803251
13242	NC_008148	GGCG	2	8	430734	430741	0 %	0 %	75 %	25 %	108803251
13243	NC_008148	TGA	2	6	430839	430844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803251
13244	NC_008148	GGA	2	6	430882	430887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803251
13245	NC_008148	GCA	2	6	430930	430935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803251
13246	NC_008148	GCT	2	6	430975	430980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803251
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13261	NC_008148	TCG	2	6	431375	431380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803252
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13280	NC_008148	CCGG	2	8	432040	432047	0 %	0 %	50 %	50 %	108803252
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13359	NC_008148	CCG	2	6	434791	434796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13360	NC_008148	CTT	2	6	434947	434952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13361	NC_008148	CGG	2	6	434968	434973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13362	NC_008148	GCA	2	6	434974	434979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13363	NC_008148	CGGT	2	8	434982	434989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13364	NC_008148	ACC	2	6	435058	435063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803254
13365	NC_008148	GGA	2	6	435079	435084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803254
13366	NC_008148	GGC	2	6	435143	435148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803254
13367	NC_008148	GAG	2	6	435165	435170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803254
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13369	NC_008148	TGG	2	6	435263	435268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
13370	NC_008148	AGG	2	6	435304	435309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
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13372	NC_008148	GGT	2	6	435321	435326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
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13374	NC_008148	GGT	2	6	435369	435374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
13375	NC_008148	CTT	2	6	435537	435542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803255
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13384	NC_008148	CTG	2	6	435847	435852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803255
13385	NC_008148	GAG	2	6	435877	435882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
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13390	NC_008148	GCC	2	6	436003	436008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803255
13391	NC_008148	GAG	2	6	436024	436029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
13392	NC_008148	GGA	2	6	436038	436043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
13393	NC_008148	CGGGG	2	10	436059	436068	0 %	0 %	80 %	20 %	108803256
13394	NC_008148	ACT	2	6	436123	436128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803256
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13396	NC_008148	CG	3	6	436247	436252	0 %	0 %	50 %	50 %	108803256
13397	NC_008148	TGA	2	6	436255	436260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803256
13398	NC_008148	CTG	2	6	436266	436271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
13399	NC_008148	CACC	2	8	436391	436398	25 %	0 %	0 %	75 %	108803256
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13402	NC_008148	CTG	2	6	436515	436520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
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13428	NC_008148	CGT	2	6	437331	437336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803257
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13432	NC_008148	GAA	2	6	437470	437475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803257
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13464	NC_008148	CTC	2	6	438622	438627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
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13467	NC_008148	CTC	2	6	438736	438741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13468	NC_008148	CTG	2	6	438760	438765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803258
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13470	NC_008148	GCCGAG	2	12	438841	438852	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803258
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13472	NC_008148	CCCG	2	8	438963	438970	0 %	0 %	25 %	75 %	108803258
13473	NC_008148	CAC	3	9	439039	439047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803258
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13480	NC_008148	GAA	2	6	439354	439359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803258
13481	NC_008148	GC	3	6	439407	439412	0 %	0 %	50 %	50 %	108803258
13482	NC_008148	AGA	2	6	439425	439430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803258
13483	NC_008148	GGC	2	6	439471	439476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803258
13484	NC_008148	CCG	2	6	439509	439514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803258
13485	NC_008148	TCC	2	6	439526	439531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803258
13486	NC_008148	GCG	2	6	439563	439568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803258
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13488	NC_008148	AGT	2	6	439728	439733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803258
13489	NC_008148	CCG	2	6	439744	439749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803258
13490	NC_008148	GGC	2	6	439788	439793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803258
13491	NC_008148	GTC	2	6	439880	439885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803258
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