MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008148	GTCGTA	2	12	325190	325201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108803161
10002	NC_008148	CTG	2	6	325217	325222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803161
10003	NC_008148	GC	3	6	325238	325243	0 %	0 %	50 %	50 %	108803161
10004	NC_008148	GCT	2	6	325279	325284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803161
10005	NC_008148	G	6	6	325330	325335	0 %	0 %	100 %	0 %	108803161
10006	NC_008148	GCCG	2	8	325342	325349	0 %	0 %	50 %	50 %	108803161
10007	NC_008148	GTC	2	6	325358	325363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803161
10008	NC_008148	GAG	2	6	325382	325387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803161
10009	NC_008148	GCC	2	6	325403	325408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803161
10010	NC_008148	GAG	2	6	325455	325460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803161
10011	NC_008148	GTA	2	6	325481	325486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803161
10012	NC_008148	CTC	2	6	325520	325525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803161
10013	NC_008148	TCC	2	6	325545	325550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803161
10014	NC_008148	GCCC	2	8	325559	325566	0 %	0 %	25 %	75 %	108803161
10015	NC_008148	GTC	2	6	325586	325591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803161
10016	NC_008148	CGA	2	6	325600	325605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803161
10017	NC_008148	GGC	2	6	325613	325618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803161
10018	NC_008148	GGC	2	6	325663	325668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803161
10019	NC_008148	TCC	3	9	325692	325700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803161
10020	NC_008148	GAC	2	6	325724	325729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803161
10021	NC_008148	CTC	2	6	325739	325744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803161
10022	NC_008148	CCG	2	6	325754	325759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803161
10023	NC_008148	C	6	6	325776	325781	0 %	0 %	0 %	100 %	108803161
10024	NC_008148	AGG	2	6	325795	325800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803161
10025	NC_008148	CCTCC	2	10	325873	325882	0 %	20 %	0 %	80 %	108803161
10026	NC_008148	GTACCA	2	12	325895	325906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108803161
10027	NC_008148	CAC	2	6	325985	325990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803161
10028	NC_008148	CGC	3	9	326173	326181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803161
10029	NC_008148	GAGCGC	2	12	326201	326212	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803161
10030	NC_008148	CGC	2	6	326216	326221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803161
10031	NC_008148	GC	3	6	326220	326225	0 %	0 %	50 %	50 %	108803161
10032	NC_008148	ATCC	2	8	326240	326247	25 %	25 %	0 %	50 %	108803161
10033	NC_008148	GCC	2	6	326261	326266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_008148	GAC	2	6	326307	326312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10035	NC_008148	CGCGC	2	10	326424	326433	0 %	0 %	40 %	60 %	108803162
10036	NC_008148	CGA	3	9	326447	326455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10037	NC_008148	CTC	2	6	326457	326462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803162
10038	NC_008148	GGT	2	6	326484	326489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803162
10039	NC_008148	GAG	2	6	326569	326574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803162
10040	NC_008148	GAC	2	6	326592	326597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10041	NC_008148	CGC	2	6	326606	326611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10042	NC_008148	TGG	2	6	326641	326646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803162
10043	NC_008148	GCA	2	6	326684	326689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10044	NC_008148	GCT	2	6	326768	326773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10045	NC_008148	GCG	2	6	326794	326799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803162
10046	NC_008148	GCT	2	6	326819	326824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10047	NC_008148	CGG	2	6	326870	326875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803162
10048	NC_008148	TGC	2	6	326891	326896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10049	NC_008148	TCG	2	6	326923	326928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10050	NC_008148	GCTC	2	8	326931	326938	0 %	25 %	25 %	50 %	108803162
10051	NC_008148	GCC	2	6	326946	326951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10052	NC_008148	CGGT	2	8	326995	327002	0 %	25 %	50 %	25 %	108803162
10053	NC_008148	GCTCGC	2	12	327014	327025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803162
10054	NC_008148	GCG	2	6	327031	327036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803162
10055	NC_008148	ACC	2	6	327197	327202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803162
10056	NC_008148	CG	3	6	327228	327233	0 %	0 %	50 %	50 %	108803162
10057	NC_008148	TCG	2	6	327265	327270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10058	NC_008148	CTG	2	6	327274	327279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10059	NC_008148	TCG	2	6	327400	327405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10060	NC_008148	TCG	2	6	327454	327459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10061	NC_008148	CGT	2	6	327467	327472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10062	NC_008148	TCG	2	6	327523	327528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10063	NC_008148	GAC	2	6	327588	327593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10064	NC_008148	TGCCGC	2	12	327596	327607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803162
10065	NC_008148	GGT	2	6	327644	327649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803162
10066	NC_008148	CGG	2	6	327671	327676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803162
10067	NC_008148	GC	3	6	327753	327758	0 %	0 %	50 %	50 %	108803162
10068	NC_008148	TGCT	2	8	327856	327863	0 %	50 %	25 %	25 %	108803162
10069	NC_008148	GCC	2	6	327884	327889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10070	NC_008148	GCC	2	6	327932	327937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10071	NC_008148	AGC	2	6	327955	327960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10072	NC_008148	GCC	2	6	327979	327984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10073	NC_008148	CTC	2	6	327990	327995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803162
10074	NC_008148	CGG	2	6	328094	328099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803162
10075	NC_008148	GCC	2	6	328125	328130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10076	NC_008148	GTC	2	6	328152	328157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10077	NC_008148	CCT	2	6	328172	328177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803162
10078	NC_008148	CGGG	2	8	328199	328206	0 %	0 %	75 %	25 %	108803162
10079	NC_008148	TCC	2	6	328225	328230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803162
10080	NC_008148	GCTCG	2	10	328245	328254	0 %	20 %	40 %	40 %	108803162
10081	NC_008148	CGA	2	6	328265	328270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
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10083	NC_008148	TCT	2	6	328376	328381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803162
10084	NC_008148	GGT	2	6	328389	328394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803162
10085	NC_008148	CG	3	6	328494	328499	0 %	0 %	50 %	50 %	108803162
10086	NC_008148	G	6	6	328600	328605	0 %	0 %	100 %	0 %	108803162
10087	NC_008148	GAG	2	6	328641	328646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803162
10088	NC_008148	G	6	6	328654	328659	0 %	0 %	100 %	0 %	108803162
10089	NC_008148	CGC	2	6	328667	328672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10090	NC_008148	CGC	2	6	328679	328684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803162
10091	NC_008148	ACG	2	6	328729	328734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803162
10092	NC_008148	CGT	2	6	328749	328754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803162
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10094	NC_008148	GCTC	2	8	328778	328785	0 %	25 %	25 %	50 %	108803162
10095	NC_008148	GAA	2	6	328860	328865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803162
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10097	NC_008148	CCCG	2	8	328953	328960	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10098	NC_008148	GGC	2	6	328973	328978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_008148	TCG	2	6	328996	329001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803163
10100	NC_008148	AGG	2	6	329077	329082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803163
10101	NC_008148	CGC	3	9	329093	329101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803163
10102	NC_008148	CGA	2	6	329117	329122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803163
10103	NC_008148	CG	3	6	329147	329152	0 %	0 %	50 %	50 %	108803163
10104	NC_008148	GCG	2	6	329180	329185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803163
10105	NC_008148	CGAG	2	8	329246	329253	25 %	0 %	50 %	25 %	108803163
10106	NC_008148	CGG	2	6	329278	329283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803163
10107	NC_008148	GCG	2	6	329374	329379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803163
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10109	NC_008148	GCC	2	6	329403	329408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803163
10110	NC_008148	TCT	2	6	329420	329425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803163
10111	NC_008148	GCG	2	6	329452	329457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803163
10112	NC_008148	CCT	2	6	329487	329492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803163
10113	NC_008148	CGT	2	6	329495	329500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803163
10114	NC_008148	GGCG	2	8	329504	329511	0 %	0 %	75 %	25 %	108803163
10115	NC_008148	CCG	2	6	329626	329631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803163
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10117	NC_008148	TCC	2	6	329693	329698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803163
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10119	NC_008148	TGC	2	6	329741	329746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803163
10120	NC_008148	CGG	2	6	329756	329761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803163
10121	NC_008148	GCGCC	2	10	329778	329787	0 %	0 %	40 %	60 %	108803163
10122	NC_008148	GGTGAG	2	12	329838	329849	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803163
10123	NC_008148	GCC	2	6	329855	329860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803163
10124	NC_008148	GCC	2	6	329883	329888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803163
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10128	NC_008148	CGT	2	6	330023	330028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803163
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10131	NC_008148	CGGT	2	8	330103	330110	0 %	25 %	50 %	25 %	108803163
10132	NC_008148	GC	3	6	330144	330149	0 %	0 %	50 %	50 %	108803163
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10153	NC_008148	C	6	6	330805	330810	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10156	NC_008148	CT	3	6	330929	330934	0 %	50 %	0 %	50 %	108803164
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10174	NC_008148	AT	3	6	331569	331574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_008148	CAT	2	6	334162	334167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803166
10239	NC_008148	CTGG	2	8	334183	334190	0 %	25 %	50 %	25 %	108803166
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10241	NC_008148	TGC	2	6	334368	334373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803166
10242	NC_008148	CGA	2	6	334390	334395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803166
10243	NC_008148	AGG	2	6	334452	334457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803166
10244	NC_008148	GCA	2	6	334483	334488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803166
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10249	NC_008148	GCT	2	6	334684	334689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803166
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10253	NC_008148	ATC	2	6	334955	334960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803166
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10257	NC_008148	GAT	2	6	335149	335154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803166
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10352	NC_008148	CGGG	2	8	337894	337901	0 %	0 %	75 %	25 %	108803167
10353	NC_008148	CACC	2	8	337974	337981	25 %	0 %	0 %	75 %	108803167
10354	NC_008148	CGA	2	6	338097	338102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803167
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10374	NC_008148	TCG	2	6	338714	338719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803167
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10480	NC_008148	G	6	6	342004	342009	0 %	0 %	100 %	0 %	108803169
10481	NC_008148	CGG	2	6	342010	342015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803169
10482	NC_008148	CGA	2	6	342023	342028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803169
10483	NC_008148	TTC	2	6	342054	342059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803169
10484	NC_008148	GAG	2	6	342084	342089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803169
10485	NC_008148	GAC	2	6	342135	342140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803169
10486	NC_008148	GGC	2	6	342145	342150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803169
10487	NC_008148	CGGGCG	2	12	342191	342202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803169
10488	NC_008148	GAG	2	6	342228	342233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803169
10489	NC_008148	CTG	2	6	342246	342251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803169
10490	NC_008148	CGGC	2	8	342256	342263	0 %	0 %	50 %	50 %	108803169
10491	NC_008148	ACG	2	6	342280	342285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803169
10492	NC_008148	ACG	2	6	342295	342300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803169
10493	NC_008148	CCA	2	6	342305	342310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803169
10494	NC_008148	CGC	2	6	342341	342346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803169
10495	NC_008148	CTA	2	6	342347	342352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803169
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10500	NC_008148	GCGG	2	8	342572	342579	0 %	0 %	75 %	25 %	108803169

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