MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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91003	NC_008148	TTA	2	6	3046024	3046029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108805822
91004	NC_008148	GCT	2	6	3046041	3046046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805822
91005	NC_008148	TG	3	6	3046095	3046100	0 %	50 %	50 %	0 %	108805822
91006	NC_008148	AT	3	6	3046173	3046178	50 %	50 %	0 %	0 %	108805822
91007	NC_008148	CAGC	2	8	3046186	3046193	25 %	0 %	25 %	50 %	108805822
91008	NC_008148	GAT	2	6	3046368	3046373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805822
91009	NC_008148	TACG	2	8	3046436	3046443	25 %	25 %	25 %	25 %	108805822
91010	NC_008148	ACT	2	6	3046465	3046470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805822
91011	NC_008148	TACCG	2	10	3046560	3046569	20 %	20 %	20 %	40 %	108805822
91012	NC_008148	GCC	2	6	3046677	3046682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805822
91013	NC_008148	TGG	2	6	3046885	3046890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91014	NC_008148	GAG	2	6	3046956	3046961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805823
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91042	NC_008148	CCTT	2	8	3047703	3047710	0 %	50 %	0 %	50 %	108805823
91043	NC_008148	GCGA	2	8	3047776	3047783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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91237	NC_008148	CGA	2	6	3055174	3055179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805829
91238	NC_008148	GGC	2	6	3055181	3055186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805829
91239	NC_008148	TCC	3	9	3055191	3055199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805829
91240	NC_008148	C	6	6	3055233	3055238	0 %	0 %	0 %	100 %	108805829
91241	NC_008148	CTC	2	6	3055274	3055279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805829
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91247	NC_008148	CAT	2	6	3055597	3055602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805830
91248	NC_008148	GCG	2	6	3055650	3055655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805830
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91250	NC_008148	CGA	2	6	3055677	3055682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805830
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91253	NC_008148	CGC	2	6	3055736	3055741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805830
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91266	NC_008148	CCA	2	6	3056496	3056501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805832
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91268	NC_008148	GA	3	6	3056575	3056580	50 %	0 %	50 %	0 %	108805832
91269	NC_008148	CCT	2	6	3056589	3056594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805832
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91271	NC_008148	TCGC	2	8	3056615	3056622	0 %	25 %	25 %	50 %	108805832
91272	NC_008148	GAC	2	6	3056653	3056658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805832
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91277	NC_008148	CCCA	2	8	3056893	3056900	25 %	0 %	0 %	75 %	108805832
91278	NC_008148	AGC	2	6	3057046	3057051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805832
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91287	NC_008148	GCC	2	6	3057411	3057416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805832
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91290	NC_008148	AGA	2	6	3057467	3057472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108805833
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91293	NC_008148	CGA	2	6	3057599	3057604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805833
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91297	NC_008148	CGT	2	6	3057803	3057808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805833
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91302	NC_008148	GCC	2	6	3058071	3058076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805833
91303	NC_008148	CGA	2	6	3058079	3058084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805833
91304	NC_008148	CGAG	2	8	3058106	3058113	25 %	0 %	50 %	25 %	108805833
91305	NC_008148	GCC	2	6	3058134	3058139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805833
91306	NC_008148	CCT	2	6	3058160	3058165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805833
91307	NC_008148	CAT	2	6	3058182	3058187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805833
91308	NC_008148	GTC	2	6	3058251	3058256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805833
91309	NC_008148	CCT	2	6	3058292	3058297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805833
91310	NC_008148	GCA	2	6	3058379	3058384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805833
91311	NC_008148	GCA	2	6	3058391	3058396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805833
91312	NC_008148	CTTCT	2	10	3058407	3058416	0 %	60 %	0 %	40 %	108805833
91313	NC_008148	CCCT	2	8	3058455	3058462	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91314	NC_008148	CAG	2	6	3058524	3058529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91315	NC_008148	TCC	2	6	3058549	3058554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91316	NC_008148	AT	3	6	3058566	3058571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91317	NC_008148	GGAAA	2	10	3058599	3058608	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91318	NC_008148	CGC	2	6	3058659	3058664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91319	NC_008148	TCGCC	2	10	3058703	3058712	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91320	NC_008148	AGC	2	6	3058734	3058739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91321	NC_008148	CTT	3	9	3058766	3058774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91322	NC_008148	T	6	6	3058804	3058809	0 %	100 %	0 %	0 %	108805834
91323	NC_008148	CCA	2	6	3058851	3058856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805834
91324	NC_008148	CTT	2	6	3058915	3058920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805834
91325	NC_008148	CT	3	6	3058985	3058990	0 %	50 %	0 %	50 %	108805834
91326	NC_008148	CCA	2	6	3059001	3059006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805834
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91328	NC_008148	C	6	6	3059094	3059099	0 %	0 %	0 %	100 %	108805834
91329	NC_008148	GTA	2	6	3059101	3059106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805834
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91333	NC_008148	GCG	2	6	3059280	3059285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805834
91334	NC_008148	CCA	2	6	3059292	3059297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805834
91335	NC_008148	ACC	2	6	3059426	3059431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805834
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91337	NC_008148	TCA	2	6	3059553	3059558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805834
91338	NC_008148	GAG	2	6	3059658	3059663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805834
91339	NC_008148	TCC	2	6	3059705	3059710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805834
91340	NC_008148	TTC	2	6	3059725	3059730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805834
91341	NC_008148	GTC	2	6	3059766	3059771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805834
91342	NC_008148	AAAGGA	2	12	3059830	3059841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91343	NC_008148	GGC	2	6	3059846	3059851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805835
91344	NC_008148	CAC	2	6	3059859	3059864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805835
91345	NC_008148	GGA	2	6	3059879	3059884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805835
91346	NC_008148	GC	3	6	3059901	3059906	0 %	0 %	50 %	50 %	108805835
91347	NC_008148	GCG	2	6	3059928	3059933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805835
91348	NC_008148	GGCGGT	2	12	3059963	3059974	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108805835
91349	NC_008148	GTT	2	6	3060152	3060157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805835
91350	NC_008148	CTT	2	6	3060167	3060172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805835
91351	NC_008148	CGG	2	6	3060181	3060186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805835
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91353	NC_008148	CGG	2	6	3060208	3060213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805835
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91495	NC_008148	CGT	2	6	3065288	3065293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805840
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91499	NC_008148	C	6	6	3065377	3065382	0 %	0 %	0 %	100 %	108805840
91500	NC_008148	GGTA	2	8	3065386	3065393	25 %	25 %	50 %	0 %	108805840

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