MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85118	NC_008148	GGA	2	6	2852559	2852564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805632
85119	NC_008148	GTC	2	6	2852585	2852590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805632
85120	NC_008148	GCCG	2	8	2852596	2852603	0 %	0 %	50 %	50 %	108805632
85121	NC_008148	AG	3	6	2852624	2852629	50 %	0 %	50 %	0 %	108805632
85122	NC_008148	AGA	2	6	2852750	2852755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108805633
85123	NC_008148	CTG	2	6	2852784	2852789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805633
85124	NC_008148	CCA	2	6	2852834	2852839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805633
85125	NC_008148	CGG	2	6	2852874	2852879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805633
85126	NC_008148	CTA	2	6	2852907	2852912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805633
85127	NC_008148	ACC	2	6	2852954	2852959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805633
85128	NC_008148	TCACCG	2	12	2852963	2852974	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108805633
85129	NC_008148	GC	3	6	2853023	2853028	0 %	0 %	50 %	50 %	108805633
85130	NC_008148	CGCT	2	8	2853119	2853126	0 %	25 %	25 %	50 %	108805634
85131	NC_008148	GCGG	2	8	2853130	2853137	0 %	0 %	75 %	25 %	108805634
85132	NC_008148	CTCCA	2	10	2853158	2853167	20 %	20 %	0 %	60 %	108805634
85133	NC_008148	ACGA	2	8	2853179	2853186	50 %	0 %	25 %	25 %	108805634
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85136	NC_008148	GCACCC	2	12	2853294	2853305	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108805634
85137	NC_008148	CGG	2	6	2853337	2853342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805634
85138	NC_008148	CGT	2	6	2853346	2853351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805634
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85143	NC_008148	TGC	2	6	2853447	2853452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805634
85144	NC_008148	GAC	2	6	2853461	2853466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805634
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85146	NC_008148	GC	3	6	2853473	2853478	0 %	0 %	50 %	50 %	108805634
85147	NC_008148	CCT	2	6	2853486	2853491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805634
85148	NC_008148	CGG	2	6	2853514	2853519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805634
85149	NC_008148	CGG	2	6	2853583	2853588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805634
85150	NC_008148	GAG	2	6	2853722	2853727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805634
85151	NC_008148	TCGACC	2	12	2853777	2853788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108805634
85152	NC_008148	GCC	2	6	2853863	2853868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805634
85153	NC_008148	GAG	2	6	2853869	2853874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805634
85154	NC_008148	AAG	2	6	2853878	2853883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108805634
85155	NC_008148	ATG	2	6	2853884	2853889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805634
85156	NC_008148	TAC	2	6	2853896	2853901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805634
85157	NC_008148	CAT	2	6	2853946	2853951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805634
85158	NC_008148	CGC	2	6	2853974	2853979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805634
85159	NC_008148	CGA	2	6	2854003	2854008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805634
85160	NC_008148	C	6	6	2854011	2854016	0 %	0 %	0 %	100 %	108805634
85161	NC_008148	CAG	2	6	2854019	2854024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805634
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85164	NC_008148	CGG	2	6	2854123	2854128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805635
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85167	NC_008148	GAT	2	6	2854213	2854218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805635
85168	NC_008148	GGT	2	6	2854234	2854239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805635
85169	NC_008148	CTG	2	6	2854274	2854279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805635
85170	NC_008148	CGC	2	6	2854280	2854285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805635
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85172	NC_008148	GCG	2	6	2854332	2854337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805635
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85174	NC_008148	GC	3	6	2854522	2854527	0 %	0 %	50 %	50 %	108805635
85175	NC_008148	GAGG	2	8	2854531	2854538	25 %	0 %	75 %	0 %	108805635
85176	NC_008148	GTC	2	6	2854547	2854552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805635
85177	NC_008148	GGC	2	6	2854572	2854577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805635
85178	NC_008148	GTC	2	6	2854580	2854585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805635
85179	NC_008148	CCCCG	2	10	2854591	2854600	0 %	0 %	20 %	80 %	108805635
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85181	NC_008148	GCT	2	6	2854633	2854638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805635
85182	NC_008148	GTG	2	6	2854652	2854657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805635
85183	NC_008148	GCG	2	6	2854671	2854676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805635
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85185	NC_008148	CCT	2	6	2854705	2854710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805635
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85187	NC_008148	GCT	2	6	2854753	2854758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805635
85188	NC_008148	CGA	2	6	2854834	2854839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805635
85189	NC_008148	GGA	2	6	2854864	2854869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805635
85190	NC_008148	GAG	2	6	2854886	2854891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805635
85191	NC_008148	CCG	2	6	2854929	2854934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805635
85192	NC_008148	GCG	2	6	2854953	2854958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805635
85193	NC_008148	ATC	2	6	2854970	2854975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805635
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85195	NC_008148	TCA	2	6	2855057	2855062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805636
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85197	NC_008148	CGC	2	6	2855079	2855084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805636
85198	NC_008148	CCGC	3	12	2855081	2855092	0 %	0 %	25 %	75 %	108805636
85199	NC_008148	GTC	3	9	2855107	2855115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85200	NC_008148	GAG	2	6	2855128	2855133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805636
85201	NC_008148	TCG	2	6	2855180	2855185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85202	NC_008148	CAG	2	6	2855202	2855207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85203	NC_008148	TGA	2	6	2855210	2855215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805636
85204	NC_008148	CG	3	6	2855238	2855243	0 %	0 %	50 %	50 %	108805636
85205	NC_008148	GC	3	6	2855250	2855255	0 %	0 %	50 %	50 %	108805636
85206	NC_008148	CGA	2	6	2855265	2855270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85207	NC_008148	TCG	2	6	2855285	2855290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85208	NC_008148	GGA	2	6	2855313	2855318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805636
85209	NC_008148	TGG	2	6	2855330	2855335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805636
85210	NC_008148	CGT	2	6	2855361	2855366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85211	NC_008148	GAC	2	6	2855392	2855397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805636
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85213	NC_008148	CGC	2	6	2855502	2855507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805636
85214	NC_008148	CCA	2	6	2855516	2855521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805636
85215	NC_008148	CAC	2	6	2855529	2855534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805636
85216	NC_008148	TCC	2	6	2855551	2855556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805636
85217	NC_008148	CCCGCC	2	12	2855612	2855623	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	108805636
85218	NC_008148	CGC	2	6	2855679	2855684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805636
85219	NC_008148	CTG	2	6	2855701	2855706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85220	NC_008148	CGC	2	6	2855709	2855714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805636
85221	NC_008148	CGT	2	6	2855778	2855783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85222	NC_008148	GGCC	2	8	2855808	2855815	0 %	0 %	50 %	50 %	108805636
85223	NC_008148	TCG	2	6	2855825	2855830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805636
85224	NC_008148	ACGGCG	2	12	2855867	2855878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108805636
85225	NC_008148	TGG	2	6	2855954	2855959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805636
85226	NC_008148	CGC	2	6	2855964	2855969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805636
85227	NC_008148	GAG	2	6	2855995	2856000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805636
85228	NC_008148	C	6	6	2856008	2856013	0 %	0 %	0 %	100 %	108805636
85229	NC_008148	AG	3	6	2856095	2856100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85230	NC_008148	GCT	2	6	2856123	2856128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805637
85231	NC_008148	G	6	6	2856142	2856147	0 %	0 %	100 %	0 %	108805637
85232	NC_008148	GCT	2	6	2856185	2856190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805637
85233	NC_008148	GAGC	2	8	2856203	2856210	25 %	0 %	50 %	25 %	108805637
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85241	NC_008148	C	6	6	2856487	2856492	0 %	0 %	0 %	100 %	108805637
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85350	NC_008148	TCT	2	6	2860064	2860069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805640
85351	NC_008148	AGA	2	6	2860082	2860087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108805640
85352	NC_008148	TGC	2	6	2860111	2860116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805640
85353	NC_008148	GCTGG	2	10	2860131	2860140	0 %	20 %	60 %	20 %	108805640
85354	NC_008148	GCCT	2	8	2860150	2860157	0 %	25 %	25 %	50 %	108805640
85355	NC_008148	CGGC	2	8	2860170	2860177	0 %	0 %	50 %	50 %	108805640
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85365	NC_008148	GC	3	6	2860476	2860481	0 %	0 %	50 %	50 %	108805640
85366	NC_008148	GAG	2	6	2860486	2860491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805640
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85370	NC_008148	CGC	3	9	2860667	2860675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805641
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85373	NC_008148	CGT	2	6	2860766	2860771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805641
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85379	NC_008148	CGGG	2	8	2860922	2860929	0 %	0 %	75 %	25 %	108805641
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85388	NC_008148	GCG	2	6	2861149	2861154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805641
85389	NC_008148	CCCG	2	8	2861175	2861182	0 %	0 %	25 %	75 %	108805641
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85400	NC_008148	CGC	2	6	2861519	2861524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805641
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85402	NC_008148	C	6	6	2861565	2861570	0 %	0 %	0 %	100 %	108805641
85403	NC_008148	GCG	2	6	2861584	2861589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805641
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85418	NC_008148	G	6	6	2861969	2861974	0 %	0 %	100 %	0 %	108805642
85419	NC_008148	CAC	2	6	2861989	2861994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805642
85420	NC_008148	GGGCG	2	10	2862000	2862009	0 %	0 %	80 %	20 %	108805642
85421	NC_008148	GCC	2	6	2862010	2862015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805642
85422	NC_008148	TGG	2	6	2862027	2862032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805642
85423	NC_008148	GGACG	2	10	2862049	2862058	20 %	0 %	60 %	20 %	108805642
85424	NC_008148	CG	3	6	2862067	2862072	0 %	0 %	50 %	50 %	108805642
85425	NC_008148	GCC	3	9	2862106	2862114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805642
85426	NC_008148	GCC	3	9	2862137	2862145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805642
85427	NC_008148	GGA	2	6	2862190	2862195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805642
85428	NC_008148	TTC	2	6	2862212	2862217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805642
85429	NC_008148	TGCCCG	2	12	2862294	2862305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85430	NC_008148	GT	3	6	2862306	2862311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85431	NC_008148	CGG	2	6	2862387	2862392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805643
85432	NC_008148	CGG	2	6	2862435	2862440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805643
85433	NC_008148	TCC	2	6	2862449	2862454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805643
85434	NC_008148	GAG	2	6	2862487	2862492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805643
85435	NC_008148	AGC	2	6	2862500	2862505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805643
85436	NC_008148	CGG	2	6	2862558	2862563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805643
85437	NC_008148	CGG	2	6	2862607	2862612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805643
85438	NC_008148	CG	3	6	2862615	2862620	0 %	0 %	50 %	50 %	108805643
85439	NC_008148	GCT	2	6	2862624	2862629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805643
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85442	NC_008148	GAG	2	6	2862667	2862672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805643
85443	NC_008148	GC	4	8	2862694	2862701	0 %	0 %	50 %	50 %	108805643
85444	NC_008148	CGG	2	6	2862726	2862731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805643
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85446	NC_008148	CGG	2	6	2862766	2862771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805643
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85448	NC_008148	CAT	2	6	2862840	2862845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805643
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85450	NC_008148	TCC	2	6	2862890	2862895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805643
85451	NC_008148	CGC	2	6	2862927	2862932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805643
85452	NC_008148	CGA	2	6	2862939	2862944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805643
85453	NC_008148	CGA	2	6	2862978	2862983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805643
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85455	NC_008148	GCC	2	6	2863108	2863113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805643
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85458	NC_008148	GCT	2	6	2863173	2863178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805643
85459	NC_008148	CGC	2	6	2863191	2863196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805643
85460	NC_008148	CGA	2	6	2863197	2863202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805643
85461	NC_008148	GAG	2	6	2863219	2863224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805643
85462	NC_008148	CGA	2	6	2863275	2863280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805643
85463	NC_008148	CCG	2	6	2863314	2863319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805643
85464	NC_008148	GAG	2	6	2863330	2863335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805643
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