MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_008148	GCG	3	9	227159	227167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803076
7003	NC_008148	GCC	2	6	227201	227206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803076
7004	NC_008148	CGG	2	6	227218	227223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803076
7005	NC_008148	CCA	2	6	227233	227238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803076
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7007	NC_008148	TGG	2	6	227268	227273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803076
7008	NC_008148	TGG	2	6	227292	227297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803076
7009	NC_008148	GCG	2	6	227353	227358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803076
7010	NC_008148	ACT	2	6	227367	227372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803076
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7012	NC_008148	CAC	2	6	227398	227403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803076
7013	NC_008148	CGA	2	6	227416	227421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803076
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7015	NC_008148	ACG	2	6	227526	227531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803076
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7017	NC_008148	CGGG	2	8	227557	227564	0 %	0 %	75 %	25 %	108803076
7018	NC_008148	GGA	2	6	227602	227607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803076
7019	NC_008148	CGGG	2	8	227624	227631	0 %	0 %	75 %	25 %	108803077
7020	NC_008148	G	6	6	227651	227656	0 %	0 %	100 %	0 %	108803077
7021	NC_008148	GAG	2	6	227668	227673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803077
7022	NC_008148	GGC	2	6	227695	227700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803077
7023	NC_008148	CGGG	2	8	227739	227746	0 %	0 %	75 %	25 %	108803077
7024	NC_008148	CGG	2	6	227757	227762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803077
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7030	NC_008148	GC	3	6	227919	227924	0 %	0 %	50 %	50 %	108803077
7031	NC_008148	CTC	2	6	227932	227937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803077
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7033	NC_008148	TGC	2	6	227960	227965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803077
7034	NC_008148	CTG	2	6	228019	228024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803077
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7038	NC_008148	GGA	2	6	228120	228125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803077
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7049	NC_008148	ACG	3	9	228548	228556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803077
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7053	NC_008148	GTC	2	6	228649	228654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803077
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7063	NC_008148	CGGG	2	8	228955	228962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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7104	NC_008148	GTGGCG	2	12	230354	230365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108803078
7105	NC_008148	AGC	2	6	230433	230438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803078
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7108	NC_008148	GTG	2	6	230492	230497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803078
7109	NC_008148	GTC	2	6	230513	230518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803078
7110	NC_008148	GACG	2	8	230552	230559	25 %	0 %	50 %	25 %	108803078
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7116	NC_008148	CTG	2	6	230788	230793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803079
7117	NC_008148	GTGCT	2	10	230860	230869	0 %	40 %	40 %	20 %	108803079
7118	NC_008148	CGC	2	6	230877	230882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803079
7119	NC_008148	TCGC	2	8	230887	230894	0 %	25 %	25 %	50 %	108803079
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7121	NC_008148	CGG	3	9	230964	230972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803079
7122	NC_008148	CTC	2	6	230983	230988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803079
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7144	NC_008148	CTG	2	6	231675	231680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803080
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7219	NC_008148	GAG	2	6	233605	233610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803081
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7221	NC_008148	CCG	2	6	233653	233658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7222	NC_008148	CA	3	6	233726	233731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7223	NC_008148	GAG	2	6	233736	233741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7224	NC_008148	ACG	2	6	233763	233768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803082
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7227	NC_008148	G	7	7	233863	233869	0 %	0 %	100 %	0 %	108803082
7228	NC_008148	CAC	2	6	233881	233886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803082
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7230	NC_008148	GGA	2	6	233941	233946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803082
7231	NC_008148	GCC	2	6	233960	233965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803082
7232	NC_008148	GGC	2	6	234018	234023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803082
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7240	NC_008148	CG	3	6	234317	234322	0 %	0 %	50 %	50 %	108803082
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7242	NC_008148	TCA	2	6	234345	234350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803082
7243	NC_008148	GGT	2	6	234358	234363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803082
7244	NC_008148	GCCTGA	2	12	234396	234407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108803082
7245	NC_008148	GAG	2	6	234425	234430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803082
7246	NC_008148	TGGAGG	2	12	234438	234449	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803082
7247	NC_008148	CTT	2	6	234451	234456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803082
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7258	NC_008148	GGC	2	6	234822	234827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7259	NC_008148	GC	3	6	234830	234835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7264	NC_008148	GCC	2	6	234932	234937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7352	NC_008148	GACG	2	8	237410	237417	25 %	0 %	50 %	25 %	108803084
7353	NC_008148	GTG	2	6	237450	237455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803084
7354	NC_008148	AGGCG	2	10	237531	237540	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7355	NC_008148	CTC	2	6	237547	237552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7356	NC_008148	TGG	2	6	237569	237574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803085
7357	NC_008148	GA	3	6	237620	237625	50 %	0 %	50 %	0 %	108803085
7358	NC_008148	GCC	2	6	237637	237642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803085
7359	NC_008148	GC	3	6	237644	237649	0 %	0 %	50 %	50 %	108803085
7360	NC_008148	G	6	6	237659	237664	0 %	0 %	100 %	0 %	108803085
7361	NC_008148	GCG	2	6	237677	237682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803085
7362	NC_008148	TGC	2	6	237683	237688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803085
7363	NC_008148	TGC	2	6	237764	237769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803085
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7365	NC_008148	CGC	3	9	237807	237815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803085
7366	NC_008148	CTT	2	6	237822	237827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803085
7367	NC_008148	CGG	2	6	237837	237842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803085
7368	NC_008148	GGA	2	6	237923	237928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803085
7369	NC_008148	CTG	2	6	237934	237939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803085
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7375	NC_008148	CTG	2	6	238048	238053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803085
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7403	NC_008148	GGC	2	6	238752	238757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803085
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7408	NC_008148	CGTC	2	8	238933	238940	0 %	25 %	25 %	50 %	108803085
7409	NC_008148	GTC	2	6	238952	238957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7438	NC_008148	AGC	2	6	239796	239801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803087
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7441	NC_008148	GA	3	6	239978	239983	50 %	0 %	50 %	0 %	108803087
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7457	NC_008148	TGG	2	6	241066	241071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803088
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7474	NC_008148	TTGTA	2	10	241783	241792	20 %	60 %	20 %	0 %	108803088
7475	NC_008148	CCGA	2	8	241830	241837	25 %	0 %	25 %	50 %	108803088
7476	NC_008148	CGC	2	6	241875	241880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803088
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7479	NC_008148	CCA	2	6	242016	242021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803088
7480	NC_008148	TGC	2	6	242024	242029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803088
7481	NC_008148	CTA	2	6	242035	242040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803088
7482	NC_008148	GCT	2	6	242100	242105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803088
7483	NC_008148	CTC	2	6	242148	242153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7484	NC_008148	CGT	2	6	242265	242270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803089
7485	NC_008148	GCG	2	6	242296	242301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803089
7486	NC_008148	GGC	2	6	242410	242415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803089
7487	NC_008148	CTCC	2	8	242418	242425	0 %	25 %	0 %	75 %	108803089
7488	NC_008148	GCG	2	6	242477	242482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803089
7489	NC_008148	C	6	6	242504	242509	0 %	0 %	0 %	100 %	108803089
7490	NC_008148	CGAG	2	8	242520	242527	25 %	0 %	50 %	25 %	108803089
7491	NC_008148	GGCC	2	8	242544	242551	0 %	0 %	50 %	50 %	108803089
7492	NC_008148	AGA	2	6	242559	242564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803089
7493	NC_008148	AGG	2	6	242675	242680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803089
7494	NC_008148	CGG	3	9	242700	242708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803089
7495	NC_008148	GCCGT	2	10	242714	242723	0 %	20 %	40 %	40 %	108803089
7496	NC_008148	GCG	2	6	242729	242734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803089
7497	NC_008148	TCC	2	6	242745	242750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803089
7498	NC_008148	CGC	3	9	242753	242761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803089
7499	NC_008148	CCCGG	2	10	242794	242803	0 %	0 %	40 %	60 %	108803089
7500	NC_008148	AGT	2	6	242832	242837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803089

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