MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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70002	NC_008148	GGT	2	6	2352314	2352319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805145
70003	NC_008148	GGA	2	6	2352323	2352328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805145
70004	NC_008148	GGT	2	6	2352346	2352351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805145
70005	NC_008148	CGA	2	6	2352397	2352402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805145
70006	NC_008148	TCC	2	6	2352405	2352410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805145
70007	NC_008148	GCA	2	6	2352463	2352468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805145
70008	NC_008148	GCC	2	6	2352539	2352544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805145
70009	NC_008148	CAG	2	6	2352566	2352571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805145
70010	NC_008148	AGG	2	6	2352634	2352639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805145
70011	NC_008148	GAGG	2	8	2352653	2352660	25 %	0 %	75 %	0 %	108805145
70012	NC_008148	CAC	2	6	2352677	2352682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805145
70013	NC_008148	GCG	3	9	2352750	2352758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805145
70014	NC_008148	GCC	2	6	2352762	2352767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805145
70015	NC_008148	CTC	2	6	2352773	2352778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805145
70016	NC_008148	CTC	2	6	2352782	2352787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805145
70017	NC_008148	GAG	2	6	2352798	2352803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805145
70018	NC_008148	CCG	2	6	2352840	2352845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805145
70019	NC_008148	CCG	2	6	2352855	2352860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805145
70020	NC_008148	CG	3	6	2352936	2352941	0 %	0 %	50 %	50 %	108805145
70021	NC_008148	CGC	2	6	2352961	2352966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805145
70022	NC_008148	GACC	2	8	2353007	2353014	25 %	0 %	25 %	50 %	108805145
70023	NC_008148	CTC	2	6	2353106	2353111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805145
70024	NC_008148	GTC	2	6	2353140	2353145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805145
70025	NC_008148	CTC	3	9	2353166	2353174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70026	NC_008148	CCG	2	6	2353192	2353197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805146
70027	NC_008148	GGC	2	6	2353230	2353235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805146
70028	NC_008148	TCT	2	6	2353316	2353321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805146
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70031	NC_008148	GCC	2	6	2353437	2353442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805146
70032	NC_008148	GGC	2	6	2353485	2353490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805146
70033	NC_008148	GCC	2	6	2353498	2353503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805146
70034	NC_008148	GGCGA	2	10	2353510	2353519	20 %	0 %	60 %	20 %	108805146
70035	NC_008148	TGGA	2	8	2353528	2353535	25 %	25 %	50 %	0 %	108805146
70036	NC_008148	TGA	2	6	2353544	2353549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805146
70037	NC_008148	CTCG	2	8	2353562	2353569	0 %	25 %	25 %	50 %	108805146
70038	NC_008148	CGGG	2	8	2353646	2353653	0 %	0 %	75 %	25 %	108805146
70039	NC_008148	CTC	2	6	2353656	2353661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805146
70040	NC_008148	TGC	2	6	2353675	2353680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805146
70041	NC_008148	GTT	2	6	2353689	2353694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805146
70042	NC_008148	ACC	2	6	2353696	2353701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805146
70043	NC_008148	CCTCCA	2	12	2353709	2353720	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108805146
70044	NC_008148	GCG	2	6	2353732	2353737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805146
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70046	NC_008148	CCGC	2	8	2353787	2353794	0 %	0 %	25 %	75 %	108805146
70047	NC_008148	ACC	2	6	2353816	2353821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805146
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70049	NC_008148	TCGAGG	2	12	2353909	2353920	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108805146
70050	NC_008148	CCA	2	6	2353922	2353927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108805146
70051	NC_008148	CGC	2	6	2353928	2353933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805146
70052	NC_008148	CCT	2	6	2353967	2353972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70053	NC_008148	CGG	2	6	2353998	2354003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70054	NC_008148	CCG	2	6	2354025	2354030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70055	NC_008148	GCT	2	6	2354078	2354083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805147
70056	NC_008148	GCG	2	6	2354098	2354103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805147
70057	NC_008148	TCC	2	6	2354107	2354112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805147
70058	NC_008148	ACG	2	6	2354134	2354139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805147
70059	NC_008148	CGC	2	6	2354163	2354168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805147
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70065	NC_008148	CGT	2	6	2354342	2354347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805147
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70067	NC_008148	AGC	2	6	2354407	2354412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805147
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70069	NC_008148	GCC	2	6	2354446	2354451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805147
70070	NC_008148	GCCG	2	8	2354471	2354478	0 %	0 %	50 %	50 %	108805147
70071	NC_008148	CAG	2	6	2354514	2354519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805147
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70085	NC_008148	CGATGC	2	12	2354981	2354992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108805147
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70100	NC_008148	CGC	2	6	2355459	2355464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70101	NC_008148	GCC	2	6	2355470	2355475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70102	NC_008148	GCG	2	6	2355476	2355481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70103	NC_008148	CGC	2	6	2355485	2355490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70104	NC_008148	GCAGG	2	10	2355633	2355642	20 %	0 %	60 %	20 %	108805148
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70107	NC_008148	CCCG	2	8	2355733	2355740	0 %	0 %	25 %	75 %	108805148
70108	NC_008148	CGA	2	6	2355743	2355748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805148
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70110	NC_008148	CCGG	2	8	2355831	2355838	0 %	0 %	50 %	50 %	108805148
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70116	NC_008148	GAT	2	6	2356065	2356070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805148
70117	NC_008148	CCT	2	6	2356082	2356087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805148
70118	NC_008148	G	6	6	2356128	2356133	0 %	0 %	100 %	0 %	108805148
70119	NC_008148	AAGG	2	8	2356134	2356141	50 %	0 %	50 %	0 %	108805148
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70121	NC_008148	GTA	2	6	2356290	2356295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805148
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70127	NC_008148	GGC	2	6	2356419	2356424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805148
70128	NC_008148	TGA	3	9	2356457	2356465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805148
70129	NC_008148	CGT	2	6	2356556	2356561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805148
70130	NC_008148	GTT	2	6	2356572	2356577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805148
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70133	NC_008148	CGC	2	6	2356866	2356871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805148
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70137	NC_008148	TCC	2	6	2356986	2356991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70138	NC_008148	GGC	2	6	2357019	2357024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70139	NC_008148	CTA	2	6	2357031	2357036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70140	NC_008148	GAG	2	6	2357072	2357077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70141	NC_008148	CTG	2	6	2357114	2357119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805149
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70145	NC_008148	G	6	6	2357148	2357153	0 %	0 %	100 %	0 %	108805149
70146	NC_008148	GGA	2	6	2357173	2357178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805149
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70230	NC_008148	GGAAGG	2	12	2359447	2359458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805150
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70350	NC_008148	GCGG	2	8	2363568	2363575	0 %	0 %	75 %	25 %	108805154
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70369	NC_008148	GAGC	2	8	2364414	2364421	25 %	0 %	50 %	25 %	108805155
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70460	NC_008148	CT	3	6	2367782	2367787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70461	NC_008148	GCCCG	2	10	2367863	2367872	0 %	0 %	40 %	60 %	108805160
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70469	NC_008148	CCT	2	6	2368061	2368066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805160
70470	NC_008148	GCC	2	6	2368078	2368083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805160
70471	NC_008148	CGG	2	6	2368084	2368089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805160
70472	NC_008148	GGA	2	6	2368115	2368120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805160
70473	NC_008148	CCT	2	6	2368121	2368126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805160
70474	NC_008148	TCG	2	6	2368159	2368164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805160
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70479	NC_008148	GCGG	2	8	2368283	2368290	0 %	0 %	75 %	25 %	108805160
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70481	NC_008148	CTG	2	6	2368311	2368316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805160
70482	NC_008148	GCCG	2	8	2368338	2368345	0 %	0 %	50 %	50 %	108805160
70483	NC_008148	GTC	2	6	2368350	2368355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805160
70484	NC_008148	GCC	2	6	2368368	2368373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805160
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70488	NC_008148	GCC	2	6	2368461	2368466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805160
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70499	NC_008148	GCCG	2	8	2368710	2368717	0 %	0 %	50 %	50 %	108805161
70500	NC_008148	GCGG	2	8	2368725	2368732	0 %	0 %	75 %	25 %	108805161

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