MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008148	AGG	2	6	209498	209503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803061
6502	NC_008148	CTG	2	6	209563	209568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803061
6503	NC_008148	CCG	2	6	209598	209603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803061
6504	NC_008148	TCG	2	6	209606	209611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803061
6505	NC_008148	CCA	2	6	209627	209632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803061
6506	NC_008148	GCT	2	6	209640	209645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803061
6507	NC_008148	GTACC	2	10	209679	209688	20 %	20 %	20 %	40 %	108803061
6508	NC_008148	GCTC	2	8	209714	209721	0 %	25 %	25 %	50 %	108803061
6509	NC_008148	GCC	3	9	209827	209835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803061
6510	NC_008148	TTG	2	6	209873	209878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_008148	GA	3	6	209927	209932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_008148	GGA	2	6	209969	209974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6513	NC_008148	GCG	2	6	210024	210029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803062
6514	NC_008148	AGC	2	6	210076	210081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803062
6515	NC_008148	GGAG	2	8	210088	210095	25 %	0 %	75 %	0 %	108803062
6516	NC_008148	CAC	2	6	210120	210125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803062
6517	NC_008148	GACC	2	8	210128	210135	25 %	0 %	25 %	50 %	108803062
6518	NC_008148	GCT	2	6	210164	210169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803062
6519	NC_008148	CTA	2	6	210272	210277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803062
6520	NC_008148	GGA	2	6	210281	210286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6521	NC_008148	CGG	2	6	210350	210355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803062
6522	NC_008148	G	6	6	210400	210405	0 %	0 %	100 %	0 %	108803062
6523	NC_008148	CCG	2	6	210408	210413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803062
6524	NC_008148	GCG	2	6	210450	210455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803062
6525	NC_008148	GGT	2	6	210467	210472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803062
6526	NC_008148	GAGGT	2	10	210489	210498	20 %	20 %	60 %	0 %	108803062
6527	NC_008148	CT	3	6	210582	210587	0 %	50 %	0 %	50 %	108803062
6528	NC_008148	GAG	2	6	210597	210602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6529	NC_008148	CCG	2	6	210679	210684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803062
6530	NC_008148	GGCT	2	8	210699	210706	0 %	25 %	50 %	25 %	108803062
6531	NC_008148	CTCCC	2	10	210712	210721	0 %	20 %	0 %	80 %	108803062
6532	NC_008148	GAG	2	6	210738	210743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6533	NC_008148	CGG	2	6	210791	210796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803062
6534	NC_008148	ACT	3	9	210823	210831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803062
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6536	NC_008148	CGCAG	2	10	210922	210931	20 %	0 %	40 %	40 %	108803062
6537	NC_008148	GGGAGG	2	12	210949	210960	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	108803062
6538	NC_008148	GAGG	2	8	210992	210999	25 %	0 %	75 %	0 %	108803062
6539	NC_008148	GCTACA	2	12	211105	211116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108803062
6540	NC_008148	GGT	2	6	211142	211147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803062
6541	NC_008148	GGA	3	9	211148	211156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6542	NC_008148	TGT	2	6	211186	211191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803062
6543	NC_008148	GAG	2	6	211197	211202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6544	NC_008148	GGA	2	6	211226	211231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803062
6545	NC_008148	GCCC	2	8	211265	211272	0 %	0 %	25 %	75 %	108803062
6546	NC_008148	CGGG	2	8	211302	211309	0 %	0 %	75 %	25 %	108803062
6547	NC_008148	GAG	2	6	211327	211332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_008148	GAG	2	6	211354	211359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803063
6549	NC_008148	ATG	2	6	211501	211506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803063
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6551	NC_008148	CGA	2	6	211653	211658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803063
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6553	NC_008148	CTA	2	6	211731	211736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803063
6554	NC_008148	ACG	2	6	211772	211777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803063
6555	NC_008148	GTC	2	6	211828	211833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803063
6556	NC_008148	GA	3	6	211867	211872	50 %	0 %	50 %	0 %	108803063
6557	NC_008148	GCG	2	6	211873	211878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803063
6558	NC_008148	CT	4	8	211939	211946	0 %	50 %	0 %	50 %	108803064
6559	NC_008148	CCT	2	6	211965	211970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803064
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6561	NC_008148	AGC	2	6	212060	212065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803064
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6565	NC_008148	CTC	2	6	212167	212172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803064
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6570	NC_008148	CGG	2	6	212362	212367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803064
6571	NC_008148	AGCCGT	2	12	212517	212528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108803064
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6573	NC_008148	GCC	2	6	212577	212582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803064
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6590	NC_008148	GC	3	6	213105	213110	0 %	0 %	50 %	50 %	108803065
6591	NC_008148	GC	3	6	213114	213119	0 %	0 %	50 %	50 %	108803065
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6594	NC_008148	GAC	2	6	213173	213178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803065
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6603	NC_008148	CGAGC	2	10	213440	213449	20 %	0 %	40 %	40 %	108803065
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6609	NC_008148	TC	3	6	213510	213515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_008148	CGG	2	6	213535	213540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_008148	CCG	3	9	213549	213557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6615	NC_008148	GGAG	2	8	213635	213642	25 %	0 %	75 %	0 %	108803066
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6621	NC_008148	TCT	2	6	213781	213786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803066
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6865	NC_008148	CCAGG	2	10	222167	222176	20 %	0 %	40 %	40 %	108803072
6866	NC_008148	GCCGAC	2	12	222219	222230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108803072
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6869	NC_008148	GGC	2	6	222484	222489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803073
6870	NC_008148	TAC	2	6	222512	222517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803073
6871	NC_008148	GCG	2	6	222540	222545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803073
6872	NC_008148	CTT	2	6	222589	222594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803073
6873	NC_008148	CGG	2	6	222595	222600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803073
6874	NC_008148	CAC	2	6	222607	222612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803073
6875	NC_008148	TCG	2	6	222639	222644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803073
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6881	NC_008148	CGG	2	6	222868	222873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803073
6882	NC_008148	TCC	2	6	222905	222910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803073
6883	NC_008148	CACCG	2	10	222957	222966	20 %	0 %	20 %	60 %	108803073
6884	NC_008148	GAG	2	6	223004	223009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803073
6885	NC_008148	GAG	2	6	223036	223041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803073
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6888	NC_008148	C	6	6	223124	223129	0 %	0 %	0 %	100 %	108803073
6889	NC_008148	GGA	2	6	223159	223164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803073
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6910	NC_008148	CGG	2	6	224034	224039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803074
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6913	NC_008148	C	6	6	224096	224101	0 %	0 %	0 %	100 %	108803074
6914	NC_008148	TGG	2	6	224126	224131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803074
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6917	NC_008148	GCTC	2	8	224195	224202	0 %	25 %	25 %	50 %	108803074
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6924	NC_008148	GCGG	2	8	224502	224509	0 %	0 %	75 %	25 %	108803074
6925	NC_008148	CGA	2	6	224523	224528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803074
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6930	NC_008148	GCGA	2	8	224683	224690	25 %	0 %	50 %	25 %	108803074
6931	NC_008148	GCC	2	6	224698	224703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803074
6932	NC_008148	GGTGG	2	10	224718	224727	0 %	20 %	80 %	0 %	108803074
6933	NC_008148	GAGG	2	8	224796	224803	25 %	0 %	75 %	0 %	108803074
6934	NC_008148	ACG	2	6	224843	224848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803074
6935	NC_008148	CGG	2	6	224849	224854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803074
6936	NC_008148	AGG	3	9	224921	224929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803074
6937	NC_008148	GAG	2	6	224938	224943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803074
6938	NC_008148	GCTGG	2	10	224991	225000	0 %	20 %	60 %	20 %	108803074
6939	NC_008148	G	6	6	225032	225037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6940	NC_008148	GAG	2	6	225045	225050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6941	NC_008148	CGC	2	6	225113	225118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803075
6942	NC_008148	CGC	2	6	225142	225147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803075
6943	NC_008148	ACG	2	6	225154	225159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803075
6944	NC_008148	ACC	2	6	225195	225200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803075
6945	NC_008148	ACA	2	6	225202	225207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108803075
6946	NC_008148	TCA	2	6	225238	225243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803075
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6948	NC_008148	GCT	2	6	225299	225304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803075
6949	NC_008148	TGC	2	6	225343	225348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803075
6950	NC_008148	CCT	2	6	225403	225408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803075
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6952	NC_008148	TCA	2	6	225511	225516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803075
6953	NC_008148	GCC	2	6	225519	225524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803075
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6956	NC_008148	TCT	2	6	225574	225579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803075
6957	NC_008148	G	6	6	225580	225585	0 %	0 %	100 %	0 %	108803075
6958	NC_008148	ATC	2	6	225597	225602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803075
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6960	NC_008148	GCT	2	6	225650	225655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803075
6961	NC_008148	CCT	2	6	225674	225679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803075
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6966	NC_008148	CCG	2	6	225934	225939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803075
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6972	NC_008148	GGC	2	6	226070	226075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803075
6973	NC_008148	CCT	2	6	226090	226095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803075
6974	NC_008148	CGG	2	6	226139	226144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803075
6975	NC_008148	ATC	2	6	226146	226151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803075
6976	NC_008148	CAT	2	6	226157	226162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803075
6977	NC_008148	GCT	2	6	226184	226189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803075
6978	NC_008148	CTGG	2	8	226220	226227	0 %	25 %	50 %	25 %	108803075
6979	NC_008148	TGA	2	6	226264	226269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803075
6980	NC_008148	ACT	2	6	226276	226281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803075
6981	NC_008148	CGG	2	6	226349	226354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803075
6982	NC_008148	GGCG	2	8	226363	226370	0 %	0 %	75 %	25 %	108803075
6983	NC_008148	GCG	2	6	226374	226379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803075
6984	NC_008148	GTG	2	6	226392	226397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803075
6985	NC_008148	TCC	2	6	226402	226407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803075
6986	NC_008148	GGC	2	6	226421	226426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803075
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6988	NC_008148	TTC	2	6	226497	226502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803075
6989	NC_008148	CTC	2	6	226533	226538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803075
6990	NC_008148	GAG	2	6	226572	226577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803075
6991	NC_008148	GACC	2	8	226615	226622	25 %	0 %	25 %	50 %	108803076
6992	NC_008148	CGCC	2	8	226623	226630	0 %	0 %	25 %	75 %	108803076
6993	NC_008148	CGT	2	6	226636	226641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803076
6994	NC_008148	GAG	2	6	226661	226666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803076
6995	NC_008148	CGCCTG	2	12	226675	226686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803076
6996	NC_008148	GCG	2	6	226875	226880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803076
6997	NC_008148	GGA	2	6	226902	226907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803076
6998	NC_008148	TCA	2	6	226947	226952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803076
6999	NC_008148	CGG	2	6	226984	226989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803076
7000	NC_008148	GCG	2	6	227016	227021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803076

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