MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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67002	NC_008148	TCG	2	6	2240573	2240578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805044
67003	NC_008148	CCG	2	6	2240579	2240584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805044
67004	NC_008148	GAC	3	9	2240602	2240610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805044
67005	NC_008148	CTAGA	2	10	2240632	2240641	40 %	20 %	20 %	20 %	108805044
67006	NC_008148	GCG	2	6	2240752	2240757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67007	NC_008148	CCAG	2	8	2240766	2240773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67008	NC_008148	CCA	2	6	2240787	2240792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67009	NC_008148	G	6	6	2240826	2240831	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67010	NC_008148	CCTT	2	8	2240871	2240878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67011	NC_008148	GATC	2	8	2240901	2240908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67012	NC_008148	CCACG	2	10	2240914	2240923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67013	NC_008148	CGATC	2	10	2240982	2240991	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67014	NC_008148	CGC	2	6	2241003	2241008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67015	NC_008148	GGC	2	6	2241029	2241034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67016	NC_008148	CAC	2	6	2241038	2241043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67017	NC_008148	CGA	2	6	2241070	2241075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67018	NC_008148	CTT	2	6	2241101	2241106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67019	NC_008148	CGT	2	6	2241111	2241116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67020	NC_008148	GGT	2	6	2241137	2241142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67021	NC_008148	CGCCC	2	10	2241189	2241198	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67022	NC_008148	CGT	2	6	2241223	2241228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67023	NC_008148	GAC	2	6	2241331	2241336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67024	NC_008148	AGG	2	6	2241353	2241358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67025	NC_008148	TC	3	6	2241360	2241365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67026	NC_008148	GTC	2	6	2241366	2241371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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67028	NC_008148	GGT	2	6	2241496	2241501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67029	NC_008148	TGG	3	9	2241540	2241548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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67031	NC_008148	TGG	2	6	2241795	2241800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67032	NC_008148	CTCG	2	8	2241857	2241864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67033	NC_008148	ACC	2	6	2241872	2241877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67034	NC_008148	CGA	2	6	2241889	2241894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67035	NC_008148	CAGC	2	8	2241983	2241990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67036	NC_008148	CTC	2	6	2242035	2242040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805045
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67038	NC_008148	GT	3	6	2242089	2242094	0 %	50 %	50 %	0 %	108805045
67039	NC_008148	GGGC	2	8	2242130	2242137	0 %	0 %	75 %	25 %	108805045
67040	NC_008148	TC	3	6	2242153	2242158	0 %	50 %	0 %	50 %	108805045
67041	NC_008148	TGT	2	6	2242196	2242201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805045
67042	NC_008148	GGC	2	6	2242225	2242230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805045
67043	NC_008148	ACCA	2	8	2242257	2242264	50 %	0 %	0 %	50 %	108805045
67044	NC_008148	CTC	2	6	2242299	2242304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805045
67045	NC_008148	GCT	2	6	2242328	2242333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805045
67046	NC_008148	TGG	2	6	2242334	2242339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805045
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67048	NC_008148	TGCC	2	8	2242502	2242509	0 %	25 %	25 %	50 %	108805045
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67050	NC_008148	A	6	6	2242545	2242550	100 %	0 %	0 %	0 %	108805045
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67053	NC_008148	CAT	2	6	2242643	2242648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805045
67054	NC_008148	TGT	2	6	2242652	2242657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805045
67055	NC_008148	TCG	2	6	2242681	2242686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805045
67056	NC_008148	CGT	2	6	2242688	2242693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805045
67057	NC_008148	GGT	2	6	2242816	2242821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805045
67058	NC_008148	TCTG	2	8	2242835	2242842	0 %	50 %	25 %	25 %	108805045
67059	NC_008148	TGC	2	6	2242899	2242904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805045
67060	NC_008148	CT	4	8	2242905	2242912	0 %	50 %	0 %	50 %	108805045
67061	NC_008148	AGT	2	6	2242940	2242945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805045
67062	NC_008148	TATT	2	8	2242988	2242995	25 %	75 %	0 %	0 %	108805045
67063	NC_008148	GTA	2	6	2243028	2243033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805045
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67095	NC_008148	GCCG	2	8	2244691	2244698	0 %	0 %	50 %	50 %	108805046
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67101	NC_008148	TAA	2	6	2245124	2245129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67116	NC_008148	GCC	2	6	2245902	2245907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67117	NC_008148	GA	3	6	2245915	2245920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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67120	NC_008148	GCC	2	6	2246003	2246008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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67244	NC_008148	GCC	2	6	2250711	2250716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805051
67245	NC_008148	AGC	2	6	2250731	2250736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805051
67246	NC_008148	CCGC	2	8	2250756	2250763	0 %	0 %	25 %	75 %	108805051
67247	NC_008148	CGA	2	6	2250837	2250842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805051
67248	NC_008148	GCC	2	6	2250851	2250856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108805051
67249	NC_008148	ACG	2	6	2250860	2250865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805051
67250	NC_008148	CGGC	2	8	2250896	2250903	0 %	0 %	50 %	50 %	108805051
67251	NC_008148	CAT	2	6	2250904	2250909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108805051
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67254	NC_008148	GAT	2	6	2251105	2251110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108805052
67255	NC_008148	GC	3	6	2251125	2251130	0 %	0 %	50 %	50 %	108805052
67256	NC_008148	CGA	2	6	2251217	2251222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805052
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67258	NC_008148	GTG	2	6	2251333	2251338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108805052
67259	NC_008148	CGA	2	6	2251364	2251369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805052
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67263	NC_008148	CA	3	6	2251487	2251492	50 %	0 %	0 %	50 %	108805052
67264	NC_008148	GC	3	6	2251537	2251542	0 %	0 %	50 %	50 %	108805052
67265	NC_008148	CCGGC	2	10	2251561	2251570	0 %	0 %	40 %	60 %	108805052
67266	NC_008148	CCT	3	9	2251580	2251588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805052
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67268	NC_008148	ACG	2	6	2251639	2251644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805052
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67273	NC_008148	TCC	2	6	2251960	2251965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67274	NC_008148	GTC	2	6	2251971	2251976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805053
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67303	NC_008148	CGA	2	6	2253084	2253089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108805053
67304	NC_008148	CTG	2	6	2253130	2253135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805054
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67323	NC_008148	GAG	2	6	2254271	2254276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67324	NC_008148	CCT	2	6	2254322	2254327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108805055
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67330	NC_008148	AG	3	6	2254660	2254665	50 %	0 %	50 %	0 %	108805055
67331	NC_008148	GCT	2	6	2254700	2254705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805055
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67337	NC_008148	CGCT	2	8	2254969	2254976	0 %	25 %	25 %	50 %	108805055
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67342	NC_008148	GATC	2	8	2255368	2255375	25 %	25 %	25 %	25 %	108805056
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67345	NC_008148	GAG	2	6	2255531	2255536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805056
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67348	NC_008148	GGA	2	6	2255707	2255712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108805056
67349	NC_008148	GCTGTG	2	12	2255845	2255856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	108805056
67350	NC_008148	CCTG	2	8	2256057	2256064	0 %	25 %	25 %	50 %	108805056
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67352	NC_008148	GCG	2	6	2256087	2256092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108805056
67353	NC_008148	GAC	2	6	2256185	2256190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67354	NC_008148	CGAGGA	2	12	2256215	2256226	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67355	NC_008148	CGT	2	6	2256230	2256235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67356	NC_008148	GTC	2	6	2256305	2256310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67357	NC_008148	CCT	2	6	2256460	2256465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67358	NC_008148	CGGT	2	8	2256521	2256528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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67360	NC_008148	CTC	2	6	2256629	2256634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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67365	NC_008148	GAAG	2	8	2256789	2256796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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67486	NC_008148	CCA	2	6	2262639	2262644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67487	NC_008148	GCC	2	6	2262819	2262824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67488	NC_008148	TCG	2	6	2262835	2262840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67489	NC_008148	CTA	2	6	2262857	2262862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67490	NC_008148	TCCG	2	8	2262920	2262927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67491	NC_008148	TCG	2	6	2262946	2262951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67492	NC_008148	GA	3	6	2262973	2262978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67493	NC_008148	TC	3	6	2263036	2263041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67494	NC_008148	CGC	2	6	2263065	2263070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67495	NC_008148	GAC	2	6	2263071	2263076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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