MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008148	CGGCCC	2	12	193457	193468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803044
6002	NC_008148	ACCCGA	2	12	193490	193501	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108803044
6003	NC_008148	CT	3	6	193566	193571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_008148	TCA	2	6	193597	193602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_008148	TTG	2	6	193606	193611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_008148	TTG	2	6	193618	193623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_008148	GAT	2	6	193626	193631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008148	AG	3	6	193659	193664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008148	AGG	2	6	193673	193678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008148	GGA	2	6	193702	193707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6011	NC_008148	CGGG	3	12	193739	193750	0 %	0 %	75 %	25 %	108803045
6012	NC_008148	CGGG	2	8	193779	193786	0 %	0 %	75 %	25 %	108803045
6013	NC_008148	GCG	2	6	193787	193792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
6014	NC_008148	GGT	2	6	193802	193807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803045
6015	NC_008148	AGC	2	6	193837	193842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803045
6016	NC_008148	GGAG	2	8	193849	193856	25 %	0 %	75 %	0 %	108803045
6017	NC_008148	CAC	2	6	193881	193886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803045
6018	NC_008148	GACC	2	8	193889	193896	25 %	0 %	25 %	50 %	108803045
6019	NC_008148	GCT	2	6	193925	193930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803045
6020	NC_008148	CTA	2	6	194033	194038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803045
6021	NC_008148	GGA	2	6	194042	194047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6022	NC_008148	CGG	2	6	194074	194079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
6023	NC_008148	ACG	2	6	194119	194124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803045
6024	NC_008148	CGA	2	6	194138	194143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803045
6025	NC_008148	G	6	6	194161	194166	0 %	0 %	100 %	0 %	108803045
6026	NC_008148	CCG	2	6	194169	194174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803045
6027	NC_008148	GCG	2	6	194211	194216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
6028	NC_008148	GGT	2	6	194228	194233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803045
6029	NC_008148	GAGGT	2	10	194250	194259	20 %	20 %	60 %	0 %	108803045
6030	NC_008148	CGG	2	6	194269	194274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803045
6031	NC_008148	CT	3	6	194343	194348	0 %	50 %	0 %	50 %	108803045
6032	NC_008148	GAG	2	6	194358	194363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6033	NC_008148	CCG	2	6	194440	194445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803045
6034	NC_008148	GGCT	2	8	194460	194467	0 %	25 %	50 %	25 %	108803045
6035	NC_008148	CTCCC	2	10	194473	194482	0 %	20 %	0 %	80 %	108803045
6036	NC_008148	GAG	2	6	194499	194504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6037	NC_008148	ACC	2	6	194550	194555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803045
6038	NC_008148	G	6	6	194562	194567	0 %	0 %	100 %	0 %	108803045
6039	NC_008148	ACT	3	9	194593	194601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803045
6040	NC_008148	GGA	2	6	194672	194677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6041	NC_008148	CGCAG	2	10	194692	194701	20 %	0 %	40 %	40 %	108803045
6042	NC_008148	GGGAGG	2	12	194719	194730	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	108803045
6043	NC_008148	GAGG	2	8	194762	194769	25 %	0 %	75 %	0 %	108803045
6044	NC_008148	CCTCC	2	10	194792	194801	0 %	20 %	0 %	80 %	108803045
6045	NC_008148	GCTACA	2	12	194875	194886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108803045
6046	NC_008148	GGT	2	6	194912	194917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803045
6047	NC_008148	GGA	3	9	194918	194926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6048	NC_008148	TGT	2	6	194956	194961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803045
6049	NC_008148	GAG	2	6	194967	194972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6050	NC_008148	GGA	2	6	194996	195001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803045
6051	NC_008148	GCCC	2	8	195035	195042	0 %	0 %	25 %	75 %	108803045
6052	NC_008148	AGG	3	9	195104	195112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008148	CGGC	2	8	195147	195154	0 %	0 %	50 %	50 %	108803046
6054	NC_008148	GGGC	2	8	195177	195184	0 %	0 %	75 %	25 %	108803046
6055	NC_008148	GCT	3	9	195195	195203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803046
6056	NC_008148	GGC	2	6	195223	195228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
6057	NC_008148	GCG	2	6	195233	195238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
6058	NC_008148	AGGG	2	8	195242	195249	25 %	0 %	75 %	0 %	108803046
6059	NC_008148	G	6	6	195247	195252	0 %	0 %	100 %	0 %	108803046
6060	NC_008148	GCT	2	6	195276	195281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803046
6061	NC_008148	TCC	2	6	195341	195346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803046
6062	NC_008148	CGG	2	6	195366	195371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
6063	NC_008148	GCGCTC	2	12	195496	195507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108803046
6064	NC_008148	ATC	2	6	195532	195537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803046
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6066	NC_008148	CGC	2	6	195552	195557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803046
6067	NC_008148	TC	3	6	195567	195572	0 %	50 %	0 %	50 %	108803046
6068	NC_008148	AGA	2	6	195581	195586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803046
6069	NC_008148	GCG	2	6	195631	195636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
6070	NC_008148	CGG	2	6	195747	195752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803046
6071	NC_008148	ACCT	2	8	195802	195809	25 %	25 %	0 %	50 %	108803046
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6074	NC_008148	CAG	2	6	195883	195888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803046
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6079	NC_008148	GCA	2	6	196145	196150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803046
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6081	NC_008148	ACT	2	6	196250	196255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803046
6082	NC_008148	CG	3	6	196269	196274	0 %	0 %	50 %	50 %	108803046
6083	NC_008148	GCC	2	6	196326	196331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803046
6084	NC_008148	AGG	2	6	196360	196365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_008148	G	6	6	196364	196369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_008148	TGC	2	6	196431	196436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803047
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6090	NC_008148	TGG	2	6	196614	196619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803047
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6122	NC_008148	GGC	2	6	197526	197531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803048
6123	NC_008148	GCT	2	6	197532	197537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803048
6124	NC_008148	CTT	2	6	197559	197564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803048
6125	NC_008148	CGC	2	6	197622	197627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803048
6126	NC_008148	CGG	2	6	197652	197657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803048
6127	NC_008148	CTA	2	6	197727	197732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803048
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6129	NC_008148	TGC	3	9	197765	197773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803048
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6131	NC_008148	GGT	2	6	197802	197807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803048
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6154	NC_008148	GGA	2	6	198539	198544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803049
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6234	NC_008148	CCT	2	6	200920	200925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803052
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6238	NC_008148	GGCCG	2	10	201146	201155	0 %	0 %	60 %	40 %	108803052
6239	NC_008148	TCCC	2	8	201179	201186	0 %	25 %	0 %	75 %	108803052
6240	NC_008148	CTC	2	6	201197	201202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803052
6241	NC_008148	GCG	2	6	201207	201212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803052
6242	NC_008148	GCC	2	6	201228	201233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803052
6243	NC_008148	CG	3	6	201269	201274	0 %	0 %	50 %	50 %	108803052
6244	NC_008148	GCG	2	6	201279	201284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803052
6245	NC_008148	C	6	6	201340	201345	0 %	0 %	0 %	100 %	108803052
6246	NC_008148	CCT	2	6	201355	201360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803052
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6248	NC_008148	CTC	2	6	201395	201400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803052
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6250	NC_008148	GAG	2	6	201413	201418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803052
6251	NC_008148	CGC	2	6	201457	201462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803052
6252	NC_008148	TCC	2	6	201472	201477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803053
6253	NC_008148	CCT	2	6	201532	201537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803053
6254	NC_008148	GCCTC	2	10	201543	201552	0 %	20 %	20 %	60 %	108803053
6255	NC_008148	CTC	2	6	201556	201561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803053
6256	NC_008148	GC	3	6	201562	201567	0 %	0 %	50 %	50 %	108803053
6257	NC_008148	CG	3	6	201569	201574	0 %	0 %	50 %	50 %	108803053
6258	NC_008148	CCT	2	6	201585	201590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803053
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6262	NC_008148	GAC	3	9	201634	201642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803053
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6264	NC_008148	TCG	2	6	201657	201662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803053
6265	NC_008148	CCG	2	6	201665	201670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803053
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6267	NC_008148	GCACCC	2	12	201720	201731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108803053
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6270	NC_008148	CTC	2	6	201766	201771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803053
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6272	NC_008148	GAG	2	6	201835	201840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803053
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6274	NC_008148	CGC	2	6	201916	201921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803053
6275	NC_008148	GTC	2	6	201937	201942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803053
6276	NC_008148	GAC	2	6	201991	201996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803053
6277	NC_008148	G	6	6	202005	202010	0 %	0 %	100 %	0 %	108803053
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6280	NC_008148	GCT	2	6	202184	202189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803054
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6282	NC_008148	GTA	2	6	202203	202208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803054
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6289	NC_008148	GAT	2	6	202494	202499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803054
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6292	NC_008148	C	6	6	202670	202675	0 %	0 %	0 %	100 %	108803054
6293	NC_008148	GCCC	2	8	202709	202716	0 %	0 %	25 %	75 %	108803054
6294	NC_008148	GCG	3	9	202717	202725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803054
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6301	NC_008148	TCC	2	6	202920	202925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803055
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6327	NC_008148	TCC	2	6	203635	203640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803055
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6330	NC_008148	CCCGC	2	10	203733	203742	0 %	0 %	20 %	80 %	108803055
6331	NC_008148	CAA	2	6	203775	203780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6332	NC_008148	G	7	7	203872	203878	0 %	0 %	100 %	0 %	108803056
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6348	NC_008148	GCGCT	2	10	204347	204356	0 %	20 %	40 %	40 %	108803056
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6352	NC_008148	GAA	2	6	204493	204498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803056
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6359	NC_008148	CCG	2	6	204612	204617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803056
6360	NC_008148	CGG	2	6	204656	204661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803056
6361	NC_008148	AGG	4	12	204675	204686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803056
6362	NC_008148	G	6	6	204704	204709	0 %	0 %	100 %	0 %	108803056
6363	NC_008148	GCGT	2	8	204747	204754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6364	NC_008148	CTT	2	6	204774	204779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6365	NC_008148	GGT	2	6	204883	204888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803057
6366	NC_008148	CGG	2	6	204892	204897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803057
6367	NC_008148	GTC	2	6	204899	204904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803057
6368	NC_008148	G	6	6	204946	204951	0 %	0 %	100 %	0 %	108803057
6369	NC_008148	GGA	2	6	204964	204969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803057
6370	NC_008148	CG	3	6	204974	204979	0 %	0 %	50 %	50 %	108803057
6371	NC_008148	CGC	2	6	204982	204987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803057
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6398	NC_008148	TGG	2	6	205783	205788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6402	NC_008148	GTG	2	6	205855	205860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803058
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6486	NC_008148	CCGG	2	8	208893	208900	0 %	0 %	50 %	50 %	108803060
6487	NC_008148	GCG	2	6	208913	208918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803060
6488	NC_008148	TCC	2	6	208922	208927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803060
6489	NC_008148	CTCC	2	8	208929	208936	0 %	25 %	0 %	75 %	108803060
6490	NC_008148	GGA	2	6	208995	209000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803060
6491	NC_008148	CTC	2	6	209053	209058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803060
6492	NC_008148	CGTC	2	8	209133	209140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6493	NC_008148	GACGA	2	10	209189	209198	40 %	0 %	40 %	20 %	108803061
6494	NC_008148	GCGG	2	8	209202	209209	0 %	0 %	75 %	25 %	108803061
6495	NC_008148	CGG	2	6	209256	209261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803061
6496	NC_008148	GCC	2	6	209326	209331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803061
6497	NC_008148	AGG	2	6	209360	209365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803061
6498	NC_008148	G	6	6	209390	209395	0 %	0 %	100 %	0 %	108803061
6499	NC_008148	GAG	3	9	209416	209424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803061
6500	NC_008148	CGC	2	6	209478	209483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803061

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