MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_008148	CAC	2	6	2001109	2001114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804801
60003	NC_008148	C	6	6	2001210	2001215	0 %	0 %	0 %	100 %	108804801
60004	NC_008148	CAG	2	6	2001226	2001231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804801
60005	NC_008148	CAG	2	6	2001235	2001240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804801
60006	NC_008148	CG	3	6	2001246	2001251	0 %	0 %	50 %	50 %	108804801
60007	NC_008148	CCA	2	6	2001267	2001272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804801
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60009	NC_008148	TCC	3	9	2001326	2001334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804801
60010	NC_008148	GCC	2	6	2001339	2001344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804801
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60012	NC_008148	CG	3	6	2001387	2001392	0 %	0 %	50 %	50 %	108804801
60013	NC_008148	CCT	2	6	2001449	2001454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804802
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60017	NC_008148	GCCGC	2	10	2001615	2001624	0 %	0 %	40 %	60 %	108804802
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60028	NC_008148	CCCG	2	8	2001897	2001904	0 %	0 %	25 %	75 %	108804802
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60042	NC_008148	GC	3	6	2002596	2002601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60043	NC_008148	CGC	2	6	2002605	2002610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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60353	NC_008148	CGC	2	6	2012323	2012328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804814
60354	NC_008148	CGG	2	6	2012329	2012334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804814
60355	NC_008148	TCG	2	6	2012382	2012387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804814
60356	NC_008148	TGC	2	6	2012406	2012411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804814
60357	NC_008148	CT	3	6	2012454	2012459	0 %	50 %	0 %	50 %	108804814
60358	NC_008148	CCT	2	6	2012503	2012508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804814
60359	NC_008148	GAC	2	6	2012552	2012557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804814
60360	NC_008148	CCT	2	6	2012614	2012619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804814
60361	NC_008148	TCC	2	6	2012667	2012672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804814
60362	NC_008148	GC	3	6	2012681	2012686	0 %	0 %	50 %	50 %	108804814
60363	NC_008148	ATG	2	6	2012688	2012693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804814
60364	NC_008148	GGT	2	6	2012743	2012748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804814
60365	NC_008148	GCG	2	6	2012761	2012766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804814
60366	NC_008148	CTG	2	6	2012774	2012779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804814
60367	NC_008148	CAC	2	6	2012780	2012785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804814
60368	NC_008148	TGG	3	9	2012854	2012862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804814
60369	NC_008148	TGT	2	6	2012872	2012877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108804814
60370	NC_008148	GCCC	2	8	2012976	2012983	0 %	0 %	25 %	75 %	108804814
60371	NC_008148	GCC	2	6	2013005	2013010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804814
60372	NC_008148	GC	3	6	2013059	2013064	0 %	0 %	50 %	50 %	108804814
60373	NC_008148	CCT	2	6	2013067	2013072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804814
60374	NC_008148	CCG	2	6	2013077	2013082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804814
60375	NC_008148	TCGCGC	2	12	2013189	2013200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108804814
60376	NC_008148	GGC	2	6	2013201	2013206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804814
60377	NC_008148	TCG	2	6	2013222	2013227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804814
60378	NC_008148	CGA	2	6	2013310	2013315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804814
60379	NC_008148	TC	3	6	2013418	2013423	0 %	50 %	0 %	50 %	108804814
60380	NC_008148	CCT	3	9	2013427	2013435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804814
60381	NC_008148	GCC	2	6	2013452	2013457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804814
60382	NC_008148	TCC	2	6	2013479	2013484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60383	NC_008148	TCC	2	6	2013524	2013529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804815
60384	NC_008148	CGG	2	6	2013545	2013550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60385	NC_008148	CCG	2	6	2013581	2013586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60386	NC_008148	GC	3	6	2013596	2013601	0 %	0 %	50 %	50 %	108804815
60387	NC_008148	CGT	2	6	2013609	2013614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804815
60388	NC_008148	CTG	2	6	2013625	2013630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804815
60389	NC_008148	G	7	7	2013630	2013636	0 %	0 %	100 %	0 %	108804815
60390	NC_008148	CGG	2	6	2013666	2013671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60391	NC_008148	GCC	2	6	2013686	2013691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60392	NC_008148	GTC	2	6	2013733	2013738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804815
60393	NC_008148	GGA	2	6	2013774	2013779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804815
60394	NC_008148	CACCAT	2	12	2013847	2013858	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	108804815
60395	NC_008148	GCC	2	6	2013878	2013883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60396	NC_008148	CGG	2	6	2013889	2013894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60397	NC_008148	CCG	3	9	2014029	2014037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60398	NC_008148	CGC	2	6	2014090	2014095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60399	NC_008148	ACG	2	6	2014112	2014117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804815
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60402	NC_008148	GC	3	6	2014180	2014185	0 %	0 %	50 %	50 %	108804815
60403	NC_008148	CGG	2	6	2014215	2014220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60404	NC_008148	C	6	6	2014262	2014267	0 %	0 %	0 %	100 %	108804815
60405	NC_008148	CGA	2	6	2014281	2014286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804815
60406	NC_008148	CGG	2	6	2014296	2014301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60407	NC_008148	GGC	2	6	2014341	2014346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60408	NC_008148	TGT	2	6	2014368	2014373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108804815
60409	NC_008148	AGC	2	6	2014382	2014387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804815
60410	NC_008148	CCG	2	6	2014391	2014396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60411	NC_008148	TCT	2	6	2014416	2014421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804815
60412	NC_008148	GTA	2	6	2014426	2014431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804815
60413	NC_008148	GCC	2	6	2014444	2014449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804815
60414	NC_008148	TCC	2	6	2014508	2014513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804815
60415	NC_008148	C	7	7	2014512	2014518	0 %	0 %	0 %	100 %	108804815
60416	NC_008148	C	7	7	2014545	2014551	0 %	0 %	0 %	100 %	108804815
60417	NC_008148	C	7	7	2014557	2014563	0 %	0 %	0 %	100 %	108804815
60418	NC_008148	AGC	2	6	2014577	2014582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804815
60419	NC_008148	AGG	3	9	2014583	2014591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804815
60420	NC_008148	GAG	2	6	2014594	2014599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804815
60421	NC_008148	CGG	2	6	2014602	2014607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804815
60422	NC_008148	CG	3	6	2014620	2014625	0 %	0 %	50 %	50 %	108804815
60423	NC_008148	TGCT	2	8	2014644	2014651	0 %	50 %	25 %	25 %	108804815
60424	NC_008148	GCT	2	6	2014762	2014767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60425	NC_008148	ACG	2	6	2014770	2014775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60426	NC_008148	CGC	2	6	2014789	2014794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804816
60427	NC_008148	CGC	2	6	2014802	2014807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804816
60428	NC_008148	GAG	2	6	2015101	2015106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804816
60429	NC_008148	GTG	3	9	2015114	2015122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804816
60430	NC_008148	CTC	2	6	2015135	2015140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804816
60431	NC_008148	GCT	2	6	2015194	2015199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60432	NC_008148	CGG	2	6	2015200	2015205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804816
60433	NC_008148	CAC	2	6	2015236	2015241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804816
60434	NC_008148	GTC	2	6	2015294	2015299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60435	NC_008148	ACG	2	6	2015301	2015306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60436	NC_008148	CAC	2	6	2015312	2015317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804816
60437	NC_008148	CGG	2	6	2015322	2015327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804816
60438	NC_008148	TGC	2	6	2015352	2015357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60439	NC_008148	GGC	2	6	2015406	2015411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804816
60440	NC_008148	GCCGG	2	10	2015432	2015441	0 %	0 %	60 %	40 %	108804816
60441	NC_008148	CCG	2	6	2015449	2015454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804816
60442	NC_008148	CCA	2	6	2015640	2015645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804816
60443	NC_008148	GCT	2	6	2015668	2015673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60444	NC_008148	GC	3	6	2015678	2015683	0 %	0 %	50 %	50 %	108804816
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60448	NC_008148	GGA	2	6	2015788	2015793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804816
60449	NC_008148	CGG	2	6	2015810	2015815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804816
60450	NC_008148	CTG	2	6	2015819	2015824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804816
60451	NC_008148	CCCGG	2	10	2015845	2015854	0 %	0 %	40 %	60 %	108804816
60452	NC_008148	ATC	2	6	2015960	2015965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804816
60453	NC_008148	CGG	2	6	2015984	2015989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804816
60454	NC_008148	CGGC	2	8	2016007	2016014	0 %	0 %	50 %	50 %	108804816
60455	NC_008148	GCGG	2	8	2016037	2016044	0 %	0 %	75 %	25 %	108804816
60456	NC_008148	CGG	2	6	2016092	2016097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804816
60457	NC_008148	TGC	2	6	2016118	2016123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804817
60458	NC_008148	GCC	2	6	2016141	2016146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804817
60459	NC_008148	GCG	2	6	2016149	2016154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804817
60460	NC_008148	CGC	2	6	2016181	2016186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804817
60461	NC_008148	GCC	2	6	2016207	2016212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804817
60462	NC_008148	TGG	2	6	2016265	2016270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804817
60463	NC_008148	GGA	3	9	2016287	2016295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804817
60464	NC_008148	GTG	2	6	2016333	2016338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804817
60465	NC_008148	GCT	2	6	2016353	2016358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804817
60466	NC_008148	GGA	2	6	2016359	2016364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804817
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