MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_008148	TCCATG	2	12	1862429	1862440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108804669
56502	NC_008148	GTGC	2	8	1862454	1862461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56503	NC_008148	TTC	2	6	1862515	1862520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56504	NC_008148	GCT	2	6	1862599	1862604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804670
56505	NC_008148	CT	3	6	1862620	1862625	0 %	50 %	0 %	50 %	108804670
56506	NC_008148	G	6	6	1862656	1862661	0 %	0 %	100 %	0 %	108804670
56507	NC_008148	GAG	2	6	1862695	1862700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804670
56508	NC_008148	CCG	2	6	1862714	1862719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804670
56509	NC_008148	GAGCGC	2	12	1862731	1862742	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108804670
56510	NC_008148	GCC	2	6	1862760	1862765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804670
56511	NC_008148	CAC	2	6	1862814	1862819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804671
56512	NC_008148	GCC	2	6	1862833	1862838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804671
56513	NC_008148	CGC	2	6	1862853	1862858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804671
56514	NC_008148	CTC	2	6	1862979	1862984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804671
56515	NC_008148	CTC	3	9	1863111	1863119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804671
56516	NC_008148	CAC	2	6	1863126	1863131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804671
56517	NC_008148	GA	3	6	1863140	1863145	50 %	0 %	50 %	0 %	108804671
56518	NC_008148	CGC	2	6	1863247	1863252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804671
56519	NC_008148	CTCA	2	8	1863267	1863274	25 %	25 %	0 %	50 %	108804671
56520	NC_008148	CCT	2	6	1863283	1863288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804671
56521	NC_008148	GCC	2	6	1863315	1863320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804671
56522	NC_008148	CTT	2	6	1863324	1863329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804671
56523	NC_008148	GTG	2	6	1863437	1863442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56524	NC_008148	CGCC	2	8	1863467	1863474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56525	NC_008148	GA	3	6	1863564	1863569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56526	NC_008148	CGC	2	6	1863587	1863592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56527	NC_008148	CGG	2	6	1863593	1863598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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56529	NC_008148	GC	3	6	1863688	1863693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56530	NC_008148	ACC	2	6	1863694	1863699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56531	NC_008148	GCA	2	6	1863711	1863716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56532	NC_008148	CGG	2	6	1863725	1863730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56533	NC_008148	CAA	2	6	1863746	1863751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56534	NC_008148	ACGG	2	8	1863757	1863764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56535	NC_008148	GCC	2	6	1863766	1863771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56536	NC_008148	GCC	2	6	1863785	1863790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56537	NC_008148	GA	3	6	1863798	1863803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56538	NC_008148	CCA	2	6	1863841	1863846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56539	NC_008148	GAA	2	6	1863867	1863872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56541	NC_008148	ACGG	2	8	1863958	1863965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56542	NC_008148	GGC	2	6	1863990	1863995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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56544	NC_008148	GCG	2	6	1864031	1864036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56545	NC_008148	GAGC	2	8	1864076	1864083	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56546	NC_008148	GGC	2	6	1864125	1864130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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56548	NC_008148	GCG	2	6	1864243	1864248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56549	NC_008148	GCC	2	6	1864260	1864265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56550	NC_008148	CACG	2	8	1864284	1864291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56551	NC_008148	CCG	2	6	1864341	1864346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56552	NC_008148	CCG	3	9	1864366	1864374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56553	NC_008148	GGGT	2	8	1864375	1864382	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56554	NC_008148	GTGC	2	8	1864383	1864390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56555	NC_008148	ACTG	2	8	1864396	1864403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56556	NC_008148	GCC	2	6	1864464	1864469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56557	NC_008148	CAT	2	6	1864473	1864478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56558	NC_008148	GAC	2	6	1864495	1864500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56559	NC_008148	CTC	2	6	1864528	1864533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56560	NC_008148	CCT	2	6	1864585	1864590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804672
56561	NC_008148	CTG	2	6	1864596	1864601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804672
56562	NC_008148	GAG	2	6	1864704	1864709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804672
56563	NC_008148	GAC	2	6	1864768	1864773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804672
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56570	NC_008148	CCT	2	6	1865052	1865057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56571	NC_008148	CCT	2	6	1865096	1865101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56573	NC_008148	GAG	2	6	1865154	1865159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56574	NC_008148	GCC	2	6	1865170	1865175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56575	NC_008148	GAT	2	6	1865196	1865201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56577	NC_008148	ACG	2	6	1865257	1865262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804673
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56581	NC_008148	GCT	2	6	1865330	1865335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804673
56582	NC_008148	ATC	2	6	1865338	1865343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804673
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56584	NC_008148	CGGT	2	8	1865363	1865370	0 %	25 %	50 %	25 %	108804673
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56588	NC_008148	GCC	2	6	1865536	1865541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804673
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56591	NC_008148	CG	3	6	1865630	1865635	0 %	0 %	50 %	50 %	108804673
56592	NC_008148	CTCTC	2	10	1865638	1865647	0 %	40 %	0 %	60 %	108804673
56593	NC_008148	GGGT	2	8	1865680	1865687	0 %	25 %	75 %	0 %	108804673
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56603	NC_008148	GGTCC	2	10	1866072	1866081	0 %	20 %	40 %	40 %	108804673
56604	NC_008148	GAC	2	6	1866087	1866092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804673
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56606	NC_008148	CTAGC	2	10	1866203	1866212	20 %	20 %	20 %	40 %	108804673
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56609	NC_008148	ACT	2	6	1866335	1866340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56610	NC_008148	GA	3	6	1866359	1866364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56611	NC_008148	GA	3	6	1866432	1866437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56612	NC_008148	TCA	2	6	1866449	1866454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56613	NC_008148	GGA	2	6	1866551	1866556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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56615	NC_008148	ACG	2	6	1866602	1866607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56616	NC_008148	GAC	2	6	1866640	1866645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56618	NC_008148	CGG	2	6	1866671	1866676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56619	NC_008148	CCGA	2	8	1866687	1866694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56620	NC_008148	GCG	2	6	1866697	1866702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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56622	NC_008148	CT	3	6	1866807	1866812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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56887	NC_008148	AGGGA	2	10	1878996	1879005	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56888	NC_008148	CTCG	2	8	1879160	1879167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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56975	NC_008148	GCC	3	9	1883486	1883494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804686
56976	NC_008148	ACT	2	6	1883516	1883521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804686
56977	NC_008148	TCG	2	6	1883537	1883542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804686
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56979	NC_008148	TTC	2	6	1883572	1883577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804686
56980	NC_008148	CAT	2	6	1883712	1883717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804686
56981	NC_008148	ACCAC	2	10	1883762	1883771	40 %	0 %	0 %	60 %	108804686
56982	NC_008148	GTC	2	6	1883776	1883781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804686
56983	NC_008148	CCG	2	6	1883800	1883805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804686
56984	NC_008148	TCT	2	6	1883819	1883824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804686
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56986	NC_008148	CGT	2	6	1884012	1884017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804686
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