MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_008148	TA	3	6	1843807	1843812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56002	NC_008148	GCG	2	6	1843832	1843837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56003	NC_008148	GCC	2	6	1843841	1843846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56004	NC_008148	GGC	2	6	1843850	1843855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56005	NC_008148	GAG	2	6	1843869	1843874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56006	NC_008148	CGA	2	6	1843892	1843897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804653
56007	NC_008148	G	6	6	1843908	1843913	0 %	0 %	100 %	0 %	108804653
56008	NC_008148	GGA	2	6	1843916	1843921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804653
56009	NC_008148	GGC	2	6	1843947	1843952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804653
56010	NC_008148	CGC	2	6	1843959	1843964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804653
56011	NC_008148	GCG	2	6	1843969	1843974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804653
56012	NC_008148	AGC	2	6	1844056	1844061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804653
56013	NC_008148	GCC	2	6	1844146	1844151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804653
56014	NC_008148	GAG	2	6	1844197	1844202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804653
56015	NC_008148	TCG	3	9	1844237	1844245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804653
56016	NC_008148	GAG	2	6	1844271	1844276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804653
56017	NC_008148	GTC	2	6	1844305	1844310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804653
56018	NC_008148	TGG	2	6	1844333	1844338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804653
56019	NC_008148	GGC	2	6	1844359	1844364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804653
56020	NC_008148	CG	3	6	1844426	1844431	0 %	0 %	50 %	50 %	108804653
56021	NC_008148	AGG	2	6	1844441	1844446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56022	NC_008148	TGCC	2	8	1844447	1844454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56023	NC_008148	GC	3	6	1844457	1844462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56024	NC_008148	CCGC	2	8	1844471	1844478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56025	NC_008148	CGC	2	6	1844495	1844500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56026	NC_008148	CGA	2	6	1844506	1844511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56027	NC_008148	CGGTC	2	10	1844516	1844525	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56028	NC_008148	CGGG	2	8	1844580	1844587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56029	NC_008148	ACC	2	6	1844630	1844635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56030	NC_008148	GGA	2	6	1844655	1844660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56031	NC_008148	TC	3	6	1844686	1844691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56032	NC_008148	CCA	2	6	1844704	1844709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56033	NC_008148	AGGA	2	8	1844723	1844730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56034	NC_008148	AGT	2	6	1844766	1844771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56035	NC_008148	CGT	2	6	1844823	1844828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56036	NC_008148	CGTG	2	8	1844860	1844867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56037	NC_008148	GGT	2	6	1844886	1844891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56038	NC_008148	GC	3	6	1844900	1844905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56039	NC_008148	AG	3	6	1844929	1844934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56040	NC_008148	CGG	2	6	1844936	1844941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56041	NC_008148	AGGG	2	8	1844969	1844976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56042	NC_008148	GCG	2	6	1844989	1844994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56043	NC_008148	GC	3	6	1845032	1845037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56044	NC_008148	GCC	2	6	1845058	1845063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56045	NC_008148	CGG	2	6	1845112	1845117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804654
56046	NC_008148	CT	3	6	1845147	1845152	0 %	50 %	0 %	50 %	108804654
56047	NC_008148	ACG	2	6	1845218	1845223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804654
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56049	NC_008148	CGG	2	6	1845279	1845284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804654
56050	NC_008148	TGG	2	6	1845399	1845404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804654
56051	NC_008148	GCCG	2	8	1845417	1845424	0 %	0 %	50 %	50 %	108804654
56052	NC_008148	CCG	2	6	1845437	1845442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804654
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56054	NC_008148	GCG	2	6	1845501	1845506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804654
56055	NC_008148	CTC	2	6	1845543	1845548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804654
56056	NC_008148	GC	3	6	1845552	1845557	0 %	0 %	50 %	50 %	108804654
56057	NC_008148	C	6	6	1845557	1845562	0 %	0 %	0 %	100 %	108804654
56058	NC_008148	GGC	2	6	1845565	1845570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804654
56059	NC_008148	CGG	2	6	1845654	1845659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804654
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56062	NC_008148	GC	3	6	1845795	1845800	0 %	0 %	50 %	50 %	108804654
56063	NC_008148	CGC	2	6	1845838	1845843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804654
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56065	NC_008148	C	6	6	1845882	1845887	0 %	0 %	0 %	100 %	108804654
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56071	NC_008148	CCTC	2	8	1846003	1846010	0 %	25 %	0 %	75 %	108804655
56072	NC_008148	CCT	2	6	1846039	1846044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804655
56073	NC_008148	CGA	2	6	1846057	1846062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804655
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56079	NC_008148	TGA	2	6	1846213	1846218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804655
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56088	NC_008148	AGC	2	6	1846614	1846619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804655
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56090	NC_008148	AGC	2	6	1846626	1846631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804655
56091	NC_008148	TC	3	6	1846686	1846691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56092	NC_008148	GCT	2	6	1846731	1846736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804656
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56105	NC_008148	CCT	2	6	1847205	1847210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804656
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56107	NC_008148	CTCGGC	2	12	1847380	1847391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108804656
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56111	NC_008148	GAG	2	6	1847473	1847478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804656
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56115	NC_008148	CGC	3	9	1847637	1847645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804656
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56237	NC_008148	TTC	2	6	1851804	1851809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56472	NC_008148	CGGAG	2	10	1861051	1861060	20 %	0 %	60 %	20 %	108804668
56473	NC_008148	CT	3	6	1861061	1861066	0 %	50 %	0 %	50 %	108804668
56474	NC_008148	ACGT	2	8	1861137	1861144	25 %	25 %	25 %	25 %	108804668
56475	NC_008148	GCGGT	2	10	1861260	1861269	0 %	20 %	60 %	20 %	108804668
56476	NC_008148	CGA	2	6	1861285	1861290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804668
56477	NC_008148	CTCG	2	8	1861328	1861335	0 %	25 %	25 %	50 %	108804668
56478	NC_008148	CGT	2	6	1861480	1861485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804668
56479	NC_008148	CGC	2	6	1861493	1861498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804668
56480	NC_008148	TCC	2	6	1861518	1861523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804668
56481	NC_008148	CGT	2	6	1861525	1861530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804668
56482	NC_008148	CGA	2	6	1861540	1861545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804668
56483	NC_008148	GC	3	6	1861558	1861563	0 %	0 %	50 %	50 %	108804668
56484	NC_008148	TCC	2	6	1861710	1861715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804668
56485	NC_008148	ATC	2	6	1861743	1861748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804668
56486	NC_008148	TCG	2	6	1861815	1861820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804668
56487	NC_008148	GA	3	6	1861830	1861835	50 %	0 %	50 %	0 %	108804668
56488	NC_008148	CGT	2	6	1861879	1861884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804668
56489	NC_008148	GGC	2	6	1861922	1861927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804668
56490	NC_008148	TCGCT	2	10	1861931	1861940	0 %	40 %	20 %	40 %	108804668
56491	NC_008148	CCGA	2	8	1862036	1862043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56492	NC_008148	TAC	2	6	1862073	1862078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56493	NC_008148	CTA	2	6	1862116	1862121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804669
56494	NC_008148	CTCC	2	8	1862148	1862155	0 %	25 %	0 %	75 %	108804669
56495	NC_008148	TCG	2	6	1862159	1862164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804669
56496	NC_008148	CTT	2	6	1862182	1862187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804669
56497	NC_008148	GTA	2	6	1862257	1862262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804669
56498	NC_008148	CGG	2	6	1862264	1862269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804669
56499	NC_008148	CCT	2	6	1862370	1862375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804669
56500	NC_008148	TCC	2	6	1862405	1862410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804669

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