MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_008148	CGT	2	6	1809672	1809677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804620
55003	NC_008148	CGA	2	6	1809702	1809707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804620
55004	NC_008148	GAG	2	6	1809760	1809765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804620
55005	NC_008148	CGG	2	6	1809772	1809777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804620
55006	NC_008148	TGC	2	6	1809800	1809805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804620
55007	NC_008148	G	6	6	1809821	1809826	0 %	0 %	100 %	0 %	108804620
55008	NC_008148	TCCT	2	8	1809850	1809857	0 %	50 %	0 %	50 %	108804620
55009	NC_008148	CCG	2	6	1809864	1809869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804620
55010	NC_008148	CTA	2	6	1809939	1809944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804620
55011	NC_008148	GGGA	2	8	1810055	1810062	25 %	0 %	75 %	0 %	108804621
55012	NC_008148	CGGG	3	12	1810100	1810111	0 %	0 %	75 %	25 %	108804621
55013	NC_008148	TCG	2	6	1810133	1810138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804621
55014	NC_008148	GCT	2	6	1810152	1810157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804621
55015	NC_008148	CGA	2	6	1810158	1810163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804621
55016	NC_008148	GCT	2	6	1810164	1810169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804621
55017	NC_008148	GAG	2	6	1810171	1810176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804621
55018	NC_008148	CGA	2	6	1810229	1810234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804621
55019	NC_008148	GCG	2	6	1810241	1810246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804621
55020	NC_008148	GCC	2	6	1810263	1810268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804621
55021	NC_008148	GC	3	6	1810269	1810274	0 %	0 %	50 %	50 %	108804621
55022	NC_008148	GGA	2	6	1810305	1810310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804621
55023	NC_008148	CTG	2	6	1810345	1810350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804621
55024	NC_008148	GAGG	2	8	1810395	1810402	25 %	0 %	75 %	0 %	108804621
55025	NC_008148	ACC	2	6	1810457	1810462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804621
55026	NC_008148	GCG	2	6	1810484	1810489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804621
55027	NC_008148	CGG	2	6	1810516	1810521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804621
55028	NC_008148	GGT	2	6	1810524	1810529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804621
55029	NC_008148	GGA	2	6	1810530	1810535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804621
55030	NC_008148	GCG	2	6	1810562	1810567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804621
55031	NC_008148	AGAA	2	8	1810614	1810621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55032	NC_008148	CCA	2	6	1810669	1810674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55033	NC_008148	CTCG	2	8	1810685	1810692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55034	NC_008148	AAGG	2	8	1810759	1810766	50 %	0 %	50 %	0 %	108804622
55035	NC_008148	TC	3	6	1810776	1810781	0 %	50 %	0 %	50 %	108804622
55036	NC_008148	TC	3	6	1810787	1810792	0 %	50 %	0 %	50 %	108804622
55037	NC_008148	TCA	2	6	1810804	1810809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804622
55038	NC_008148	CAG	2	6	1810824	1810829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804622
55039	NC_008148	TCCT	2	8	1810854	1810861	0 %	50 %	0 %	50 %	108804622
55040	NC_008148	TTC	2	6	1810878	1810883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804622
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55042	NC_008148	CTT	2	6	1810918	1810923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804622
55043	NC_008148	GGA	2	6	1810985	1810990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804622
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55052	NC_008148	GGA	2	6	1811240	1811245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804622
55053	NC_008148	GAG	2	6	1811258	1811263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804622
55054	NC_008148	GCG	2	6	1811290	1811295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804622
55055	NC_008148	AGG	2	6	1811301	1811306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804622
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55057	NC_008148	GAGC	2	8	1811344	1811351	25 %	0 %	50 %	25 %	108804622
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55059	NC_008148	GCA	2	6	1811369	1811374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804622
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55062	NC_008148	CGAGG	2	10	1811594	1811603	20 %	0 %	60 %	20 %	108804623
55063	NC_008148	CGA	2	6	1811610	1811615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804623
55064	NC_008148	GGCG	2	8	1811660	1811667	0 %	0 %	75 %	25 %	108804623
55065	NC_008148	GGGCGA	2	12	1811690	1811701	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	108804623
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55070	NC_008148	GCC	2	6	1811920	1811925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804623
55071	NC_008148	CCGGC	2	10	1811989	1811998	0 %	0 %	40 %	60 %	108804623
55072	NC_008148	CTC	2	6	1812014	1812019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804623
55073	NC_008148	GCG	2	6	1812020	1812025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804623
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55075	NC_008148	GCA	2	6	1812118	1812123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55077	NC_008148	GCG	2	6	1812136	1812141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804624
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55079	NC_008148	CGCCC	2	10	1812169	1812178	0 %	0 %	20 %	80 %	108804624
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55083	NC_008148	CGA	2	6	1812285	1812290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804624
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55085	NC_008148	CGGG	2	8	1812325	1812332	0 %	0 %	75 %	25 %	108804624
55086	NC_008148	CTCGTC	2	12	1812370	1812381	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108804624
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55089	NC_008148	G	6	6	1812546	1812551	0 %	0 %	100 %	0 %	108804624
55090	NC_008148	GAC	2	6	1812553	1812558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804624
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55100	NC_008148	CAG	2	6	1812797	1812802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804624
55101	NC_008148	GAG	2	6	1812847	1812852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804624
55102	NC_008148	CGAG	2	8	1812906	1812913	25 %	0 %	50 %	25 %	108804624
55103	NC_008148	G	6	6	1813048	1813053	0 %	0 %	100 %	0 %	108804624
55104	NC_008148	GCT	2	6	1813056	1813061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804624
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55106	NC_008148	C	6	6	1813088	1813093	0 %	0 %	0 %	100 %	108804624
55107	NC_008148	TCG	2	6	1813148	1813153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804624
55108	NC_008148	ATGAGG	2	12	1813154	1813165	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	108804624
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55113	NC_008148	ACG	2	6	1813436	1813441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804624
55114	NC_008148	GC	3	6	1813461	1813466	0 %	0 %	50 %	50 %	108804624
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55116	NC_008148	GC	4	8	1813529	1813536	0 %	0 %	50 %	50 %	108804624
55117	NC_008148	CGG	2	6	1813558	1813563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804624
55118	NC_008148	GGC	2	6	1813581	1813586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804624
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55231	NC_008148	CG	3	6	1817591	1817596	0 %	0 %	50 %	50 %	108804625
55232	NC_008148	CTC	2	6	1817597	1817602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804625
55233	NC_008148	CCG	2	6	1817614	1817619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804625
55234	NC_008148	TCC	2	6	1817637	1817642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804625
55235	NC_008148	GCC	2	6	1817649	1817654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804625
55236	NC_008148	CGC	2	6	1817661	1817666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804625
55237	NC_008148	CTC	3	9	1817699	1817707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804625
55238	NC_008148	GCC	2	6	1817728	1817733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804625
55239	NC_008148	C	6	6	1817744	1817749	0 %	0 %	0 %	100 %	108804625
55240	NC_008148	GCGG	2	8	1817753	1817760	0 %	0 %	75 %	25 %	108804625
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55242	NC_008148	CGTAC	2	10	1817812	1817821	20 %	20 %	20 %	40 %	108804625
55243	NC_008148	CGCAG	2	10	1817860	1817869	20 %	0 %	40 %	40 %	108804625
55244	NC_008148	GGT	2	6	1817959	1817964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804625
55245	NC_008148	CCT	2	6	1817980	1817985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804625
55246	NC_008148	AGT	2	6	1818022	1818027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804625
55247	NC_008148	GTA	2	6	1818065	1818070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804625
55248	NC_008148	CCTC	2	8	1818091	1818098	0 %	25 %	0 %	75 %	108804625
55249	NC_008148	CGG	2	6	1818136	1818141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804625
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55251	NC_008148	CGTCGA	2	12	1818178	1818189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108804625
55252	NC_008148	GCGCC	2	10	1818212	1818221	0 %	0 %	40 %	60 %	108804625
55253	NC_008148	ACG	2	6	1818225	1818230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804625
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55256	NC_008148	GTA	2	6	1818293	1818298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804625
55257	NC_008148	GGC	2	6	1818299	1818304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804625
55258	NC_008148	GCA	2	6	1818325	1818330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804625
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55262	NC_008148	CG	3	6	1818435	1818440	0 %	0 %	50 %	50 %	108804625
55263	NC_008148	CTC	2	6	1818443	1818448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804625
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55266	NC_008148	CGA	2	6	1818524	1818529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804626
55267	NC_008148	GGACA	2	10	1818534	1818543	40 %	0 %	40 %	20 %	108804626
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55269	NC_008148	C	6	6	1818576	1818581	0 %	0 %	0 %	100 %	108804626
55270	NC_008148	TCCAG	2	10	1818587	1818596	20 %	20 %	20 %	40 %	108804626
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55274	NC_008148	GCC	2	6	1818664	1818669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804626
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55284	NC_008148	CGC	2	6	1819134	1819139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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55286	NC_008148	GAGG	2	8	1819233	1819240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55287	NC_008148	GC	3	6	1819282	1819287	0 %	0 %	50 %	50 %	108804627
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55332	NC_008148	CCCG	2	8	1820608	1820615	0 %	0 %	25 %	75 %	108804628
55333	NC_008148	GCG	2	6	1820702	1820707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804628
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55336	NC_008148	CG	3	6	1820815	1820820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55337	NC_008148	GC	3	6	1820840	1820845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55338	NC_008148	CGG	2	6	1820865	1820870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804629
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55347	NC_008148	CAC	2	6	1821153	1821158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804629
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55349	NC_008148	AGG	2	6	1821243	1821248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804630
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55351	NC_008148	CGG	2	6	1821292	1821297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804630
55352	NC_008148	CAG	2	6	1821308	1821313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804630
55353	NC_008148	GCC	2	6	1821384	1821389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804630
55354	NC_008148	ACG	2	6	1821396	1821401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804630
55355	NC_008148	AGGCGA	2	12	1821418	1821429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108804630
55356	NC_008148	AGA	2	6	1821433	1821438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804630
55357	NC_008148	CCT	2	6	1821457	1821462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55358	NC_008148	GCG	2	6	1821495	1821500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804631
55359	NC_008148	CTC	2	6	1821507	1821512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804631
55360	NC_008148	CGG	2	6	1821520	1821525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804631
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55363	NC_008148	GAA	2	6	1821594	1821599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804631
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55365	NC_008148	GAC	2	6	1821756	1821761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804631
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55367	NC_008148	CCGC	2	8	1821785	1821792	0 %	0 %	25 %	75 %	108804631
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55372	NC_008148	AGCG	2	8	1821930	1821937	25 %	0 %	50 %	25 %	108804631
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55376	NC_008148	CGG	2	6	1822003	1822008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804632
55377	NC_008148	CCG	2	6	1822009	1822014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
55378	NC_008148	CAC	2	6	1822058	1822063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804632
55379	NC_008148	GCC	2	6	1822068	1822073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
55380	NC_008148	GCC	2	6	1822077	1822082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
55381	NC_008148	GC	3	6	1822091	1822096	0 %	0 %	50 %	50 %	108804632
55382	NC_008148	AGGA	2	8	1822167	1822174	50 %	0 %	50 %	0 %	108804632
55383	NC_008148	CGA	2	6	1822186	1822191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804632
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55387	NC_008148	GCC	2	6	1822278	1822283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
55388	NC_008148	CCG	2	6	1822326	1822331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
55389	NC_008148	CGG	2	6	1822351	1822356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804632
55390	NC_008148	GAC	2	6	1822400	1822405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804632
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55392	NC_008148	CGAGC	2	10	1822568	1822577	20 %	0 %	40 %	40 %	108804632
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55394	NC_008148	ATG	2	6	1822593	1822598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804632
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55398	NC_008148	AAG	2	6	1822731	1822736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804632
55399	NC_008148	CGC	2	6	1822739	1822744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
55400	NC_008148	CGTC	2	8	1822789	1822796	0 %	25 %	25 %	50 %	108804632
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55402	NC_008148	CGC	2	6	1822844	1822849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804632
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55405	NC_008148	ACC	2	6	1822887	1822892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804632
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55412	NC_008148	AGC	2	6	1823091	1823096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804632
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55414	NC_008148	CCCG	2	8	1823183	1823190	0 %	0 %	25 %	75 %	108804632
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55420	NC_008148	GCCG	2	8	1823296	1823303	0 %	0 %	50 %	50 %	108804632
55421	NC_008148	CGG	2	6	1823320	1823325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804632
55422	NC_008148	GCA	2	6	1823350	1823355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804632
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55425	NC_008148	CTC	2	6	1823428	1823433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804633
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55428	NC_008148	TCC	2	6	1823513	1823518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804633
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55434	NC_008148	CCG	2	6	1823706	1823711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804633
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55437	NC_008148	AGG	2	6	1823765	1823770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804633
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55448	NC_008148	CGA	2	6	1824197	1824202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
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55451	NC_008148	CAC	2	6	1824273	1824278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804634
55452	NC_008148	CGC	2	6	1824282	1824287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804634
55453	NC_008148	GCG	2	6	1824293	1824298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55454	NC_008148	CCG	2	6	1824299	1824304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804634
55455	NC_008148	CGCC	2	8	1824310	1824317	0 %	0 %	25 %	75 %	108804634
55456	NC_008148	CGC	2	6	1824321	1824326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804634
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55460	NC_008148	GCG	2	6	1824509	1824514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55461	NC_008148	C	6	6	1824527	1824532	0 %	0 %	0 %	100 %	108804634
55462	NC_008148	CGA	3	9	1824536	1824544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
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55464	NC_008148	CG	3	6	1824592	1824597	0 %	0 %	50 %	50 %	108804634
55465	NC_008148	GGC	2	6	1824598	1824603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55466	NC_008148	CGA	2	6	1824653	1824658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
55467	NC_008148	GCA	2	6	1824659	1824664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
55468	NC_008148	CCA	2	6	1824692	1824697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804634
55469	NC_008148	CAC	2	6	1824699	1824704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804634
55470	NC_008148	GCC	2	6	1824782	1824787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804634
55471	NC_008148	GCG	2	6	1824842	1824847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55472	NC_008148	CCCA	2	8	1824868	1824875	25 %	0 %	0 %	75 %	108804634
55473	NC_008148	GGC	2	6	1824882	1824887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55474	NC_008148	TCA	2	6	1824896	1824901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804634
55475	NC_008148	CCA	2	6	1824914	1824919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804634
55476	NC_008148	GAG	2	6	1824996	1825001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804634
55477	NC_008148	GCGCG	2	10	1825073	1825082	0 %	0 %	60 %	40 %	108804634
55478	NC_008148	CGC	2	6	1825110	1825115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804634
55479	NC_008148	AGG	2	6	1825202	1825207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804634
55480	NC_008148	CGG	2	6	1825214	1825219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55481	NC_008148	CCT	2	6	1825255	1825260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804634
55482	NC_008148	AGC	2	6	1825300	1825305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
55483	NC_008148	CGG	2	6	1825315	1825320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55484	NC_008148	GC	3	6	1825424	1825429	0 %	0 %	50 %	50 %	108804634
55485	NC_008148	GGC	2	6	1825443	1825448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55486	NC_008148	GAA	3	9	1825449	1825457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804634
55487	NC_008148	GAA	2	6	1825467	1825472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804634
55488	NC_008148	GGC	2	6	1825491	1825496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
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55490	NC_008148	AGC	2	6	1825531	1825536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
55491	NC_008148	C	7	7	1825554	1825560	0 %	0 %	0 %	100 %	108804634
55492	NC_008148	TCC	2	6	1825576	1825581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804634
55493	NC_008148	GC	3	6	1825619	1825624	0 %	0 %	50 %	50 %	108804634
55494	NC_008148	GGC	2	6	1825656	1825661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55495	NC_008148	C	6	6	1825680	1825685	0 %	0 %	0 %	100 %	108804634
55496	NC_008148	GCT	2	6	1825742	1825747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804634
55497	NC_008148	CGC	2	6	1825775	1825780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804634
55498	NC_008148	AGC	2	6	1825795	1825800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804634
55499	NC_008148	CGG	2	6	1825805	1825810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804634
55500	NC_008148	CCA	2	6	1825883	1825888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804634

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