MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54005	NC_008148	GTG	2	6	1775659	1775664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804580
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54118	NC_008148	CCGG	2	8	1780052	1780059	0 %	0 %	50 %	50 %	108804584
54119	NC_008148	GGT	2	6	1780108	1780113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804584
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54217	NC_008148	CCA	3	9	1783428	1783436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804590
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54219	NC_008148	GTT	2	6	1783606	1783611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108804590
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54222	NC_008148	CTC	2	6	1783815	1783820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54223	NC_008148	AGTCAA	2	12	1783851	1783862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	108804591
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54226	NC_008148	ATC	2	6	1784025	1784030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804591
54227	NC_008148	GTA	2	6	1784063	1784068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804591
54228	NC_008148	CTT	2	6	1784078	1784083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804591
54229	NC_008148	G	6	6	1784085	1784090	0 %	0 %	100 %	0 %	108804591
54230	NC_008148	GGC	3	9	1784138	1784146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804591
54231	NC_008148	ACC	2	6	1784152	1784157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804591
54232	NC_008148	CCG	2	6	1784166	1784171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804591
54233	NC_008148	TCC	2	6	1784214	1784219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804591
54234	NC_008148	TGG	2	6	1784245	1784250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804591
54235	NC_008148	ACC	2	6	1784283	1784288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804591
54236	NC_008148	CCG	2	6	1784352	1784357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804591
54237	NC_008148	G	6	6	1784421	1784426	0 %	0 %	100 %	0 %	108804591
54238	NC_008148	AGA	2	6	1784542	1784547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804591
54239	NC_008148	CTC	3	9	1784567	1784575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804591
54240	NC_008148	GCGG	2	8	1784651	1784658	0 %	0 %	75 %	25 %	108804591
54241	NC_008148	GGC	2	6	1784696	1784701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804591
54242	NC_008148	CCGCC	2	10	1784776	1784785	0 %	0 %	20 %	80 %	108804592
54243	NC_008148	CG	4	8	1784797	1784804	0 %	0 %	50 %	50 %	108804592
54244	NC_008148	CTA	2	6	1784920	1784925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804592
54245	NC_008148	CGT	2	6	1784956	1784961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804592
54246	NC_008148	GCC	2	6	1784973	1784978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54247	NC_008148	GGC	2	6	1784993	1784998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804592
54248	NC_008148	CGC	2	6	1785007	1785012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54249	NC_008148	GCA	2	6	1785049	1785054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804592
54250	NC_008148	CGG	2	6	1785055	1785060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804592
54251	NC_008148	CCG	2	6	1785064	1785069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54252	NC_008148	CGC	3	9	1785091	1785099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54253	NC_008148	CGTC	2	8	1785127	1785134	0 %	25 %	25 %	50 %	108804592
54254	NC_008148	GCGT	2	8	1785150	1785157	0 %	25 %	50 %	25 %	108804592
54255	NC_008148	GCC	2	6	1785184	1785189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54256	NC_008148	CGA	2	6	1785208	1785213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804592
54257	NC_008148	GTG	2	6	1785216	1785221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804592
54258	NC_008148	GGC	2	6	1785236	1785241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804592
54259	NC_008148	CCGCGC	2	12	1785322	1785333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54260	NC_008148	CGC	2	6	1785343	1785348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54261	NC_008148	GCG	2	6	1785373	1785378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804592
54262	NC_008148	CAC	2	6	1785395	1785400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804592
54263	NC_008148	GTGG	2	8	1785422	1785429	0 %	25 %	75 %	0 %	108804592
54264	NC_008148	AGG	2	6	1785433	1785438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804592
54265	NC_008148	GAA	2	6	1785446	1785451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804592
54266	NC_008148	CG	3	6	1785504	1785509	0 %	0 %	50 %	50 %	108804592
54267	NC_008148	CCG	2	6	1785510	1785515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54268	NC_008148	GAA	2	6	1785527	1785532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804592
54269	NC_008148	AGG	2	6	1785544	1785549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804592
54270	NC_008148	GCAG	2	8	1785559	1785566	25 %	0 %	50 %	25 %	108804592
54271	NC_008148	AGG	2	6	1785583	1785588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804592
54272	NC_008148	CAC	2	6	1785599	1785604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804592
54273	NC_008148	CCT	2	6	1785643	1785648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804592
54274	NC_008148	AGGGG	2	10	1785682	1785691	20 %	0 %	80 %	0 %	108804592
54275	NC_008148	GC	3	6	1785771	1785776	0 %	0 %	50 %	50 %	108804592
54276	NC_008148	AGCTCC	2	12	1785786	1785797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108804592
54277	NC_008148	GCC	2	6	1785834	1785839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804592
54278	NC_008148	CTC	2	6	1785860	1785865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54279	NC_008148	TCC	2	6	1785880	1785885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54280	NC_008148	CTCGGG	2	12	1785903	1785914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108804593
54281	NC_008148	CTC	2	6	1785963	1785968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54282	NC_008148	CCA	2	6	1785977	1785982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804593
54283	NC_008148	TCC	2	6	1786045	1786050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54284	NC_008148	ACG	2	6	1786075	1786080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54285	NC_008148	CCG	2	6	1786102	1786107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54286	NC_008148	CCG	2	6	1786121	1786126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54287	NC_008148	CCG	2	6	1786139	1786144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54288	NC_008148	TCCACC	2	12	1786165	1786176	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	108804593
54289	NC_008148	GCC	2	6	1786191	1786196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54290	NC_008148	GTC	2	6	1786209	1786214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54291	NC_008148	AGA	2	6	1786232	1786237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804593
54292	NC_008148	CGTCCT	2	12	1786241	1786252	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108804593
54293	NC_008148	CGC	2	6	1786283	1786288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54294	NC_008148	TCT	2	6	1786295	1786300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804593
54295	NC_008148	TCT	2	6	1786304	1786309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804593
54296	NC_008148	AGT	2	6	1786322	1786327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804593
54297	NC_008148	CAG	2	6	1786401	1786406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54298	NC_008148	GCA	2	6	1786484	1786489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54299	NC_008148	CCG	3	9	1786571	1786579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54300	NC_008148	CGGA	2	8	1786591	1786598	25 %	0 %	50 %	25 %	108804593
54301	NC_008148	GGT	2	6	1786625	1786630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804593
54302	NC_008148	GAA	2	6	1786662	1786667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804593
54303	NC_008148	TGT	2	6	1786769	1786774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108804593
54304	NC_008148	TCC	3	9	1786822	1786830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54305	NC_008148	GAT	2	6	1786872	1786877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804593
54306	NC_008148	GTG	2	6	1786881	1786886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804593
54307	NC_008148	GTC	2	6	1786947	1786952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54308	NC_008148	TCC	2	6	1786981	1786986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54309	NC_008148	AGC	2	6	1786996	1787001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54310	NC_008148	AGG	2	6	1787009	1787014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804593
54311	NC_008148	CGC	2	6	1787030	1787035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54312	NC_008148	CTC	2	6	1787058	1787063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54313	NC_008148	ACG	2	6	1787113	1787118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54314	NC_008148	CGA	2	6	1787138	1787143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54315	NC_008148	GAA	2	6	1787214	1787219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804593
54316	NC_008148	CAG	2	6	1787253	1787258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804593
54317	NC_008148	TCC	2	6	1787266	1787271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54318	NC_008148	CGG	2	6	1787317	1787322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804593
54319	NC_008148	CCT	2	6	1787342	1787347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804593
54320	NC_008148	CGC	2	6	1787351	1787356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804593
54321	NC_008148	ATC	2	6	1787440	1787445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804593
54322	NC_008148	GC	3	6	1787463	1787468	0 %	0 %	50 %	50 %	108804594
54323	NC_008148	CAC	3	9	1787471	1787479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804594
54324	NC_008148	GTA	2	6	1787495	1787500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804594
54325	NC_008148	TCG	2	6	1787565	1787570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804594
54326	NC_008148	GCC	2	6	1787622	1787627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804594
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54328	NC_008148	GGA	2	6	1787660	1787665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804594
54329	NC_008148	CCT	2	6	1787704	1787709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804594
54330	NC_008148	CCT	2	6	1787752	1787757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804594
54331	NC_008148	CAG	2	6	1787789	1787794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804594
54332	NC_008148	GCC	2	6	1787842	1787847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804594
54333	NC_008148	C	6	6	1787849	1787854	0 %	0 %	0 %	100 %	108804594
54334	NC_008148	CAG	2	6	1787903	1787908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804594
54335	NC_008148	GAT	2	6	1787939	1787944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804594
54336	NC_008148	CGGCC	2	10	1787953	1787962	0 %	0 %	40 %	60 %	108804594
54337	NC_008148	CTC	2	6	1788011	1788016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804594
54338	NC_008148	CAGG	2	8	1788053	1788060	25 %	0 %	50 %	25 %	108804594
54339	NC_008148	GAA	2	6	1788074	1788079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804594
54340	NC_008148	CGC	2	6	1788101	1788106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804594
54341	NC_008148	CGT	2	6	1788121	1788126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804594
54342	NC_008148	GCC	2	6	1788149	1788154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804594
54343	NC_008148	CGC	2	6	1788185	1788190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804594
54344	NC_008148	GCG	2	6	1788195	1788200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804594
54345	NC_008148	CTT	2	6	1788203	1788208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804594
54346	NC_008148	GGCC	2	8	1788256	1788263	0 %	0 %	50 %	50 %	108804594
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54348	NC_008148	CCGG	2	8	1788312	1788319	0 %	0 %	50 %	50 %	108804594
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54467	NC_008148	GGT	2	6	1792158	1792163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804598
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