MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_008148	CTC	2	6	1759594	1759599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53502	NC_008148	CCA	2	6	1759627	1759632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804565
53503	NC_008148	CAT	2	6	1759634	1759639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804565
53504	NC_008148	CCG	2	6	1759695	1759700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804565
53505	NC_008148	CCT	2	6	1759765	1759770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804565
53506	NC_008148	CTT	2	6	1759781	1759786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108804565
53507	NC_008148	CGG	2	6	1759830	1759835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804565
53508	NC_008148	GCC	2	6	1759850	1759855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804565
53509	NC_008148	TCC	2	6	1759866	1759871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804565
53510	NC_008148	CAG	2	6	1759883	1759888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804565
53511	NC_008148	CAGCCG	2	12	1759937	1759948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108804565
53512	NC_008148	GCA	2	6	1759957	1759962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804565
53513	NC_008148	CGG	2	6	1760003	1760008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804565
53514	NC_008148	CCT	2	6	1760017	1760022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804565
53515	NC_008148	CGAG	2	8	1760023	1760030	25 %	0 %	50 %	25 %	108804565
53516	NC_008148	GTC	2	6	1760069	1760074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804565
53517	NC_008148	CCGC	2	8	1760095	1760102	0 %	0 %	25 %	75 %	108804565
53518	NC_008148	CGA	2	6	1760119	1760124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804565
53519	NC_008148	CGC	2	6	1760139	1760144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804565
53520	NC_008148	TCG	2	6	1760191	1760196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804565
53521	NC_008148	GCTC	2	8	1760212	1760219	0 %	25 %	25 %	50 %	108804565
53522	NC_008148	CGC	2	6	1760294	1760299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804565
53523	NC_008148	TGG	2	6	1760301	1760306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804565
53524	NC_008148	GA	3	6	1760346	1760351	50 %	0 %	50 %	0 %	108804565
53525	NC_008148	GTC	2	6	1760363	1760368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804565
53526	NC_008148	CAT	2	6	1760372	1760377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804565
53527	NC_008148	GGGC	2	8	1760469	1760476	0 %	0 %	75 %	25 %	108804566
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53530	NC_008148	GGC	2	6	1760524	1760529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
53531	NC_008148	GGA	2	6	1760530	1760535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804566
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53533	NC_008148	CGG	2	6	1760575	1760580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
53534	NC_008148	AGG	2	6	1760616	1760621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804566
53535	NC_008148	GCG	2	6	1760624	1760629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
53536	NC_008148	TGG	2	6	1760641	1760646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804566
53537	NC_008148	CGG	2	6	1760709	1760714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
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53539	NC_008148	GCG	2	6	1760831	1760836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
53540	NC_008148	TCCGGG	2	12	1760868	1760879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108804566
53541	NC_008148	GCG	2	6	1760880	1760885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
53542	NC_008148	CGAG	2	8	1760923	1760930	25 %	0 %	50 %	25 %	108804566
53543	NC_008148	AGG	2	6	1760959	1760964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804566
53544	NC_008148	GGGA	2	8	1760975	1760982	25 %	0 %	75 %	0 %	108804566
53545	NC_008148	GAA	2	6	1761005	1761010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804566
53546	NC_008148	CGCC	2	8	1761035	1761042	0 %	0 %	25 %	75 %	108804566
53547	NC_008148	GGT	2	6	1761080	1761085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108804566
53548	NC_008148	AGC	3	9	1761096	1761104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804566
53549	NC_008148	CCT	2	6	1761139	1761144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804566
53550	NC_008148	CGG	2	6	1761148	1761153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804566
53551	NC_008148	GGA	2	6	1761178	1761183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804566
53552	NC_008148	GCC	2	6	1761247	1761252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804567
53553	NC_008148	CTC	2	6	1761262	1761267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804567
53554	NC_008148	ACC	2	6	1761278	1761283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804567
53555	NC_008148	GAC	2	6	1761337	1761342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804567
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53557	NC_008148	CGG	2	6	1761372	1761377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804567
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53559	NC_008148	GCCC	2	8	1761474	1761481	0 %	0 %	25 %	75 %	108804567
53560	NC_008148	CGC	2	6	1761525	1761530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804567
53561	NC_008148	GAC	2	6	1761541	1761546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804567
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53563	NC_008148	GCC	2	6	1761568	1761573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804567
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53566	NC_008148	GA	3	6	1761629	1761634	50 %	0 %	50 %	0 %	108804567
53567	NC_008148	TG	3	6	1761691	1761696	0 %	50 %	50 %	0 %	108804568
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53570	NC_008148	TCG	2	6	1761766	1761771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804568
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53572	NC_008148	CT	3	6	1761826	1761831	0 %	50 %	0 %	50 %	108804568
53573	NC_008148	GGC	2	6	1761839	1761844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804568
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53582	NC_008148	CGG	2	6	1762133	1762138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804568
53583	NC_008148	TCA	2	6	1762163	1762168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804568
53584	NC_008148	TGGCGA	2	12	1762172	1762183	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108804568
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53586	NC_008148	CGA	2	6	1762229	1762234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804568
53587	NC_008148	AGGA	2	8	1762273	1762280	50 %	0 %	50 %	0 %	108804568
53588	NC_008148	GGC	2	6	1762287	1762292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804568
53589	NC_008148	AGGC	2	8	1762348	1762355	25 %	0 %	50 %	25 %	108804568
53590	NC_008148	CAT	2	6	1762371	1762376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804568
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53597	NC_008148	TGGCC	2	10	1762586	1762595	0 %	20 %	40 %	40 %	108804568
53598	NC_008148	GGC	2	6	1762596	1762601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804568
53599	NC_008148	CCT	2	6	1762610	1762615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804568
53600	NC_008148	CGG	2	6	1762620	1762625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804568
53601	NC_008148	CCAGA	2	10	1762626	1762635	40 %	0 %	20 %	40 %	108804568
53602	NC_008148	GCC	2	6	1762691	1762696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804568
53603	NC_008148	GAA	2	6	1762701	1762706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108804568
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53605	NC_008148	CGA	2	6	1762769	1762774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804568
53606	NC_008148	GCC	2	6	1762891	1762896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804568
53607	NC_008148	C	6	6	1762903	1762908	0 %	0 %	0 %	100 %	108804568
53608	NC_008148	GCC	2	6	1762975	1762980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804568
53609	NC_008148	CTG	2	6	1763004	1763009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804568
53610	NC_008148	GCC	3	9	1763029	1763037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804568
53611	NC_008148	CCAA	2	8	1763103	1763110	50 %	0 %	0 %	50 %	108804568
53612	NC_008148	CGC	2	6	1763118	1763123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804568
53613	NC_008148	CGT	2	6	1763124	1763129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804568
53614	NC_008148	TAC	2	6	1763179	1763184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53616	NC_008148	GGGC	2	8	1763258	1763265	0 %	0 %	75 %	25 %	108804569
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53731	NC_008148	CTC	2	6	1767220	1767225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804573
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53848	NC_008148	GGCG	2	8	1771117	1771124	0 %	0 %	75 %	25 %	108804576
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