MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 96175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_008148	CGG	2	6	1740846	1740851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804548
53003	NC_008148	AGT	2	6	1740948	1740953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804548
53004	NC_008148	CGA	2	6	1740981	1740986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804548
53005	NC_008148	CCT	2	6	1741014	1741019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804548
53006	NC_008148	CCG	2	6	1741097	1741102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804548
53007	NC_008148	CGC	2	6	1741137	1741142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804548
53008	NC_008148	CAG	2	6	1741153	1741158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804548
53009	NC_008148	CCT	2	6	1741179	1741184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804548
53010	NC_008148	CCT	2	6	1741281	1741286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804548
53011	NC_008148	CAC	3	9	1741309	1741317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804548
53012	NC_008148	GCC	2	6	1741319	1741324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804548
53013	NC_008148	CAC	3	9	1741338	1741346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804548
53014	NC_008148	ACGC	2	8	1741401	1741408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53015	NC_008148	GA	3	6	1741461	1741466	50 %	0 %	50 %	0 %	108804549
53016	NC_008148	GGA	2	6	1741469	1741474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804549
53017	NC_008148	CACC	2	8	1741581	1741588	25 %	0 %	0 %	75 %	108804549
53018	NC_008148	GC	3	6	1741621	1741626	0 %	0 %	50 %	50 %	108804549
53019	NC_008148	CAT	3	9	1741665	1741673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804549
53020	NC_008148	AG	3	6	1741701	1741706	50 %	0 %	50 %	0 %	108804549
53021	NC_008148	CGT	2	6	1741707	1741712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804549
53022	NC_008148	GAGG	2	8	1741743	1741750	25 %	0 %	75 %	0 %	108804549
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53024	NC_008148	CAT	2	6	1741890	1741895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108804549
53025	NC_008148	GAG	2	6	1741909	1741914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804549
53026	NC_008148	GGC	2	6	1742001	1742006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804549
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53028	NC_008148	GCTTG	2	10	1742058	1742067	0 %	40 %	40 %	20 %	108804549
53029	NC_008148	AGGGG	2	10	1742068	1742077	20 %	0 %	80 %	0 %	108804549
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53035	NC_008148	GC	3	6	1742188	1742193	0 %	0 %	50 %	50 %	108804549
53036	NC_008148	CCGG	2	8	1742228	1742235	0 %	0 %	50 %	50 %	108804549
53037	NC_008148	TGGCG	2	10	1742241	1742250	0 %	20 %	60 %	20 %	108804549
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53043	NC_008148	GGA	2	6	1742343	1742348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108804549
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53054	NC_008148	GCA	2	6	1742572	1742577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804550
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53056	NC_008148	GTC	2	6	1742624	1742629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804550
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53118	NC_008148	CGGC	2	8	1745219	1745226	0 %	0 %	50 %	50 %	108804552
53119	NC_008148	TCC	2	6	1745230	1745235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804552
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53122	NC_008148	GC	3	6	1745390	1745395	0 %	0 %	50 %	50 %	108804552
53123	NC_008148	GGC	2	6	1745398	1745403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804552
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53127	NC_008148	CGCC	2	8	1745546	1745553	0 %	0 %	25 %	75 %	108804552
53128	NC_008148	GCA	2	6	1745561	1745566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804552
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53131	NC_008148	G	6	6	1745639	1745644	0 %	0 %	100 %	0 %	108804552
53132	NC_008148	CTC	2	6	1745647	1745652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804552
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53233	NC_008148	CTGC	2	8	1749374	1749381	0 %	25 %	25 %	50 %	108804555
53234	NC_008148	CCT	2	6	1749439	1749444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53235	NC_008148	CGG	2	6	1749450	1749455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53236	NC_008148	CTGC	2	8	1749500	1749507	0 %	25 %	25 %	50 %	108804556
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53314	NC_008148	GA	3	6	1752583	1752588	50 %	0 %	50 %	0 %	108804559
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53328	NC_008148	ATG	2	6	1753258	1753263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804559
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53336	NC_008148	CTG	2	6	1753444	1753449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108804559
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53339	NC_008148	ACC	2	6	1753498	1753503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53340	NC_008148	CTC	2	6	1753559	1753564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804560
53341	NC_008148	CTC	2	6	1753569	1753574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804560
53342	NC_008148	CGGGG	2	10	1753622	1753631	0 %	0 %	80 %	20 %	108804560
53343	NC_008148	CCCT	2	8	1753638	1753645	0 %	25 %	0 %	75 %	108804560
53344	NC_008148	CAG	2	6	1753655	1753660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804560
53345	NC_008148	GAT	2	6	1753697	1753702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804560
53346	NC_008148	CGG	2	6	1753709	1753714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804560
53347	NC_008148	CCA	2	6	1753715	1753720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804560
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53466	NC_008148	AGC	2	6	1758098	1758103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804563
53467	NC_008148	CCT	2	6	1758159	1758164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804563
53468	NC_008148	CTC	2	6	1758196	1758201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804563
53469	NC_008148	CTC	2	6	1758224	1758229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804563
53470	NC_008148	CGC	2	6	1758262	1758267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804563
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53472	NC_008148	CCT	2	6	1758318	1758323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804563
53473	NC_008148	GAT	2	6	1758361	1758366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804563
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53475	NC_008148	C	6	6	1758444	1758449	0 %	0 %	0 %	100 %	108804564
53476	NC_008148	CGA	2	6	1758476	1758481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804564
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53478	NC_008148	CGGCG	2	10	1758636	1758645	0 %	0 %	60 %	40 %	108804564
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53480	NC_008148	CG	3	6	1758806	1758811	0 %	0 %	50 %	50 %	108804564
53481	NC_008148	CGC	2	6	1758872	1758877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804564
53482	NC_008148	CGA	3	9	1758881	1758889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804564
53483	NC_008148	TGA	2	6	1758932	1758937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804564
53484	NC_008148	CT	3	6	1758961	1758966	0 %	50 %	0 %	50 %	108804564
53485	NC_008148	ATG	2	6	1759009	1759014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108804564
53486	NC_008148	CGG	2	6	1759079	1759084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804564
53487	NC_008148	CT	3	6	1759149	1759154	0 %	50 %	0 %	50 %	108804564
53488	NC_008148	ACG	2	6	1759165	1759170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804564
53489	NC_008148	CCT	2	6	1759214	1759219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804564
53490	NC_008148	GC	4	8	1759225	1759232	0 %	0 %	50 %	50 %	108804564
53491	NC_008148	GCCC	2	8	1759290	1759297	0 %	0 %	25 %	75 %	108804564
53492	NC_008148	GCC	2	6	1759300	1759305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804564
53493	NC_008148	CGG	2	6	1759391	1759396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804564
53494	NC_008148	AGC	2	6	1759414	1759419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108804564
53495	NC_008148	GC	3	6	1759431	1759436	0 %	0 %	50 %	50 %	108804564
53496	NC_008148	CGG	2	6	1759454	1759459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108804564
53497	NC_008148	CCA	3	9	1759460	1759468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108804564
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53499	NC_008148	GCC	2	6	1759508	1759513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108804564
53500	NC_008148	CTC	2	6	1759576	1759581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108804564

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