MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_008044	CTG	2	6	2301677	2301682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082031
47003	NC_008044	TGC	2	6	2301692	2301697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082031
47004	NC_008044	GCT	2	6	2301703	2301708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082031
47005	NC_008044	TGA	3	9	2301714	2301722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082031
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47125	NC_008044	TCA	2	6	2307837	2307842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161899027
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47358	NC_008044	AC	3	6	2319750	2319755	50 %	0 %	0 %	50 %	99082048
47359	NC_008044	TCA	2	6	2319832	2319837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082049
47360	NC_008044	TGG	2	6	2319913	2319918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082049
47361	NC_008044	CCG	2	6	2319934	2319939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082049
47362	NC_008044	CAT	2	6	2319995	2320000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082049
47363	NC_008044	CTG	2	6	2320022	2320027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082049
47364	NC_008044	GAT	2	6	2320038	2320043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082049
47365	NC_008044	CCA	2	6	2320051	2320056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082049
47366	NC_008044	CTGGC	2	10	2320111	2320120	0 %	20 %	40 %	40 %	99082049
47367	NC_008044	GCT	2	6	2320133	2320138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082049
47368	NC_008044	AGATC	2	10	2320316	2320325	40 %	20 %	20 %	20 %	99082049
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47370	NC_008044	CG	3	6	2320392	2320397	0 %	0 %	50 %	50 %	99082049
47371	NC_008044	ATC	2	6	2320398	2320403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082049
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47373	NC_008044	GAC	2	6	2320497	2320502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082049
47374	NC_008044	GCCC	2	8	2320509	2320516	0 %	0 %	25 %	75 %	99082049
47375	NC_008044	ACG	2	6	2320525	2320530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082049
47376	NC_008044	ATCACG	2	12	2320534	2320545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99082049
47377	NC_008044	ATCG	2	8	2320562	2320569	25 %	25 %	25 %	25 %	99082049
47378	NC_008044	ATC	2	6	2320617	2320622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082049
47379	NC_008044	GGAA	2	8	2320673	2320680	50 %	0 %	50 %	0 %	99082049
47380	NC_008044	GC	4	8	2320721	2320728	0 %	0 %	50 %	50 %	99082049
47381	NC_008044	TGG	2	6	2320771	2320776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082049
47382	NC_008044	CAG	2	6	2320804	2320809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082049
47383	NC_008044	CCCG	2	8	2320874	2320881	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47384	NC_008044	ACC	2	6	2320953	2320958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47385	NC_008044	CGT	2	6	2320966	2320971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082050
47386	NC_008044	TGG	2	6	2321040	2321045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082050
47387	NC_008044	CG	3	6	2321096	2321101	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
47388	NC_008044	TGG	2	6	2321221	2321226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082050
47389	NC_008044	CCTG	2	8	2321299	2321306	0 %	25 %	25 %	50 %	99082050
47390	NC_008044	GCC	2	6	2321367	2321372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082050
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47392	NC_008044	CGA	2	6	2321506	2321511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082050
47393	NC_008044	GC	3	6	2321514	2321519	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
47394	NC_008044	CGAT	2	8	2321601	2321608	25 %	25 %	25 %	25 %	99082050
47395	NC_008044	GC	4	8	2321626	2321633	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
47396	NC_008044	CGC	2	6	2321680	2321685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082050
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47398	NC_008044	ATC	2	6	2321732	2321737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082050
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47400	NC_008044	CATG	2	8	2321887	2321894	25 %	25 %	25 %	25 %	99082050
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47403	NC_008044	TC	3	6	2322232	2322237	0 %	50 %	0 %	50 %	99082050
47404	NC_008044	G	6	6	2322327	2322332	0 %	0 %	100 %	0 %	99082050
47405	NC_008044	CG	3	6	2322377	2322382	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
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47411	NC_008044	GC	4	8	2323018	2323025	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
47412	NC_008044	TGG	2	6	2323038	2323043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082050
47413	NC_008044	ACC	2	6	2323112	2323117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082050
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47415	NC_008044	GCG	2	6	2323142	2323147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082050
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47417	NC_008044	GTTG	2	8	2323222	2323229	0 %	50 %	50 %	0 %	99082050
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47427	NC_008044	CG	3	6	2323595	2323600	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
47428	NC_008044	TCGA	2	8	2323637	2323644	25 %	25 %	25 %	25 %	99082050
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47432	NC_008044	GC	3	6	2323862	2323867	0 %	0 %	50 %	50 %	99082050
47433	NC_008044	AAG	2	6	2323875	2323880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082050
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47440	NC_008044	GACGC	2	10	2324161	2324170	20 %	0 %	40 %	40 %	99082050
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47452	NC_008044	ACTGAG	2	12	2324728	2324739	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99082051
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47459	NC_008044	GCAG	2	8	2325162	2325169	25 %	0 %	50 %	25 %	99082051
47460	NC_008044	CACC	2	8	2325171	2325178	25 %	0 %	0 %	75 %	99082051
47461	NC_008044	GC	3	6	2325316	2325321	0 %	0 %	50 %	50 %	99082051
47462	NC_008044	GC	3	6	2325327	2325332	0 %	0 %	50 %	50 %	99082051
47463	NC_008044	CGC	2	6	2325335	2325340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082051
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47466	NC_008044	GC	3	6	2325573	2325578	0 %	0 %	50 %	50 %	99082052
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47468	NC_008044	CCCG	2	8	2325618	2325625	0 %	0 %	25 %	75 %	99082052
47469	NC_008044	GCCT	2	8	2325627	2325634	0 %	25 %	25 %	50 %	99082052
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47475	NC_008044	GGA	2	6	2325895	2325900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99082052
47476	NC_008044	CCTG	2	8	2325901	2325908	0 %	25 %	25 %	50 %	99082052
47477	NC_008044	GAT	2	6	2325916	2325921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082052
47478	NC_008044	TGG	2	6	2325937	2325942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082052
47479	NC_008044	CCT	2	6	2325978	2325983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082052
47480	NC_008044	TGA	2	6	2326072	2326077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082053
47481	NC_008044	GC	3	6	2326091	2326096	0 %	0 %	50 %	50 %	99082053
47482	NC_008044	AGGC	2	8	2326132	2326139	25 %	0 %	50 %	25 %	99082053
47483	NC_008044	TCG	2	6	2326162	2326167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082053
47484	NC_008044	CAC	2	6	2326217	2326222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082053
47485	NC_008044	GTG	3	9	2326320	2326328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082053
47486	NC_008044	ATC	2	6	2326407	2326412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082053
47487	NC_008044	GAT	2	6	2326473	2326478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082053
47488	NC_008044	GTC	2	6	2326551	2326556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082053
47489	NC_008044	GCT	2	6	2326602	2326607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082053
47490	NC_008044	GCTTG	2	10	2326623	2326632	0 %	40 %	40 %	20 %	99082053
47491	NC_008044	CGC	2	6	2326731	2326736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082053
47492	NC_008044	ATGA	2	8	2326739	2326746	50 %	25 %	25 %	0 %	99082053
47493	NC_008044	GTG	2	6	2326763	2326768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082054
47494	NC_008044	CGC	2	6	2326878	2326883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082054
47495	NC_008044	GC	3	6	2326882	2326887	0 %	0 %	50 %	50 %	99082054
47496	NC_008044	GTG	3	9	2326973	2326981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082054
47497	NC_008044	GAA	2	6	2327039	2327044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082054
47498	NC_008044	TGC	2	6	2327088	2327093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082054
47499	NC_008044	GCC	2	6	2327156	2327161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082054
47500	NC_008044	CCCG	2	8	2327268	2327275	0 %	0 %	25 %	75 %	99082054

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