MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45003	NC_008044	GC	3	6	2203848	2203853	0 %	0 %	50 %	50 %	99081937
45004	NC_008044	AGA	2	6	2203876	2203881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081937
45005	NC_008044	TGC	2	6	2203924	2203929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45006	NC_008044	TG	3	6	2204012	2204017	0 %	50 %	50 %	0 %	99081938
45007	NC_008044	TGC	2	6	2204068	2204073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081938
45008	NC_008044	GGC	2	6	2204144	2204149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081938
45009	NC_008044	GGC	2	6	2204157	2204162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081938
45010	NC_008044	GCCC	2	8	2204182	2204189	0 %	0 %	25 %	75 %	99081938
45011	NC_008044	CTGG	2	8	2204227	2204234	0 %	25 %	50 %	25 %	99081938
45012	NC_008044	CCA	2	6	2204263	2204268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081938
45013	NC_008044	CTA	2	6	2204305	2204310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081938
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45015	NC_008044	CGA	2	6	2204425	2204430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081938
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45018	NC_008044	TGC	2	6	2204553	2204558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081938
45019	NC_008044	GCGCC	2	10	2204559	2204568	0 %	0 %	40 %	60 %	99081938
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45025	NC_008044	GGA	2	6	2204899	2204904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081938
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45055	NC_008044	CG	3	6	2206702	2206707	0 %	0 %	50 %	50 %	99081940
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45120	NC_008044	CAC	2	6	2210362	2210367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45121	NC_008044	CTT	2	6	2210410	2210415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081945
45122	NC_008044	CCG	2	6	2210421	2210426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081945
45123	NC_008044	CAA	2	6	2210445	2210450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081945
45124	NC_008044	CCG	3	9	2210532	2210540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081945
45125	NC_008044	CG	4	8	2210539	2210546	0 %	0 %	50 %	50 %	99081945
45126	NC_008044	CCG	2	6	2210622	2210627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081945
45127	NC_008044	CAG	2	6	2210677	2210682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081945
45128	NC_008044	GCA	2	6	2210690	2210695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081945
45129	NC_008044	CGG	2	6	2210808	2210813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081945
45130	NC_008044	T	7	7	2210859	2210865	0 %	100 %	0 %	0 %	99081945
45131	NC_008044	CGC	2	6	2210943	2210948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081946
45132	NC_008044	CAT	2	6	2211104	2211109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081946
45133	NC_008044	ACC	2	6	2211118	2211123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081946
45134	NC_008044	ACC	2	6	2211126	2211131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081946
45135	NC_008044	CCA	2	6	2211218	2211223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081946
45136	NC_008044	GCTCG	2	10	2211227	2211236	0 %	20 %	40 %	40 %	99081946
45137	NC_008044	GC	3	6	2211330	2211335	0 %	0 %	50 %	50 %	99081946
45138	NC_008044	AG	4	8	2211339	2211346	50 %	0 %	50 %	0 %	99081946
45139	NC_008044	CG	3	6	2211489	2211494	0 %	0 %	50 %	50 %	99081946
45140	NC_008044	TGG	2	6	2211518	2211523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081946
45141	NC_008044	GCAC	2	8	2211618	2211625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45142	NC_008044	GCC	2	6	2211653	2211658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45143	NC_008044	GGTTC	2	10	2211743	2211752	0 %	40 %	40 %	20 %	99081947
45144	NC_008044	GAC	2	6	2211756	2211761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081947
45145	NC_008044	GCCAG	2	10	2211778	2211787	20 %	0 %	40 %	40 %	99081947
45146	NC_008044	AGG	2	6	2211938	2211943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081947
45147	NC_008044	CG	3	6	2212026	2212031	0 %	0 %	50 %	50 %	99081947
45148	NC_008044	ACG	2	6	2212036	2212041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081947
45149	NC_008044	GAC	2	6	2212049	2212054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081947
45150	NC_008044	CAG	2	6	2212059	2212064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081947
45151	NC_008044	GCG	2	6	2212119	2212124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081947
45152	NC_008044	GTA	2	6	2212149	2212154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081947
45153	NC_008044	GC	3	6	2212174	2212179	0 %	0 %	50 %	50 %	99081947
45154	NC_008044	AG	3	6	2212197	2212202	50 %	0 %	50 %	0 %	99081947
45155	NC_008044	GCG	2	6	2212212	2212217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081947
45156	NC_008044	GGC	2	6	2212268	2212273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081947
45157	NC_008044	GCG	2	6	2212293	2212298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081947
45158	NC_008044	CTT	2	6	2212345	2212350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45159	NC_008044	CAA	2	6	2212452	2212457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45160	NC_008044	TTGGAT	2	12	2212476	2212487	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45161	NC_008044	GAT	2	6	2212490	2212495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45162	NC_008044	CCA	2	6	2212528	2212533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45163	NC_008044	AGA	2	6	2212678	2212683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45164	NC_008044	CTT	2	6	2212701	2212706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45165	NC_008044	ATC	2	6	2212905	2212910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081948
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45173	NC_008044	GC	3	6	2213244	2213249	0 %	0 %	50 %	50 %	99081948
45174	NC_008044	ACC	2	6	2213428	2213433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081948
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45176	NC_008044	CTG	2	6	2213551	2213556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081948
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45178	NC_008044	GCA	2	6	2213687	2213692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081948
45179	NC_008044	TCCA	2	8	2213703	2213710	25 %	25 %	0 %	50 %	99081948
45180	NC_008044	GCCAT	2	10	2213724	2213733	20 %	20 %	20 %	40 %	99081948
45181	NC_008044	GCA	2	6	2213770	2213775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081948
45182	NC_008044	GCCT	2	8	2213849	2213856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45183	NC_008044	AGTTG	2	10	2213858	2213867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45184	NC_008044	A	6	6	2213962	2213967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45185	NC_008044	AG	3	6	2213995	2214000	50 %	0 %	50 %	0 %	99081949
45186	NC_008044	GCTG	2	8	2214020	2214027	0 %	25 %	50 %	25 %	99081949
45187	NC_008044	AAG	2	6	2214061	2214066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081949
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45189	NC_008044	CG	3	6	2214203	2214208	0 %	0 %	50 %	50 %	99081949
45190	NC_008044	GCCG	2	8	2214270	2214277	0 %	0 %	50 %	50 %	99081949
45191	NC_008044	CCA	2	6	2214392	2214397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081949
45192	NC_008044	CGAG	2	8	2214533	2214540	25 %	0 %	50 %	25 %	99081949
45193	NC_008044	CCCAG	2	10	2214591	2214600	20 %	0 %	20 %	60 %	99081949
45194	NC_008044	CGA	2	6	2214726	2214731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081949
45195	NC_008044	GATCA	2	10	2214771	2214780	40 %	20 %	20 %	20 %	99081949
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45197	NC_008044	GAG	2	6	2214929	2214934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45198	NC_008044	TGGT	2	8	2214943	2214950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45199	NC_008044	GCA	2	6	2214972	2214977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45200	NC_008044	GC	3	6	2215005	2215010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45201	NC_008044	ACC	2	6	2215111	2215116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081950
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45203	NC_008044	GCCA	2	8	2215211	2215218	25 %	0 %	25 %	50 %	99081950
45204	NC_008044	CAT	2	6	2215394	2215399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081950
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45210	NC_008044	AGG	2	6	2215525	2215530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45211	NC_008044	GGC	2	6	2215536	2215541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45212	NC_008044	ACC	2	6	2215545	2215550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45213	NC_008044	CTG	2	6	2215574	2215579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45214	NC_008044	CTGCC	3	15	2215597	2215611	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45215	NC_008044	GAG	2	6	2215670	2215675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45216	NC_008044	GC	3	6	2215684	2215689	0 %	0 %	50 %	50 %	99081951
45217	NC_008044	GAG	2	6	2215748	2215753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081951
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45220	NC_008044	CTGTC	2	10	2215859	2215868	0 %	40 %	20 %	40 %	99081951
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45222	NC_008044	CGG	2	6	2215984	2215989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081951
45223	NC_008044	CG	3	6	2216072	2216077	0 %	0 %	50 %	50 %	99081951
45224	NC_008044	CGC	2	6	2216098	2216103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081951
45225	NC_008044	GC	4	8	2216126	2216133	0 %	0 %	50 %	50 %	99081951
45226	NC_008044	GGCA	2	8	2216142	2216149	25 %	0 %	50 %	25 %	99081951
45227	NC_008044	GCT	2	6	2216167	2216172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081951
45228	NC_008044	GAA	2	6	2216180	2216185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081951
45229	NC_008044	CCG	2	6	2216187	2216192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081951
45230	NC_008044	AGA	2	6	2216193	2216198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081951
45231	NC_008044	CCT	2	6	2216224	2216229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081951
45232	NC_008044	CG	3	6	2216237	2216242	0 %	0 %	50 %	50 %	99081951
45233	NC_008044	CGC	2	6	2216284	2216289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081951
45234	NC_008044	GCC	2	6	2216294	2216299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081951
45235	NC_008044	TTC	2	6	2216471	2216476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081951
45236	NC_008044	TCC	2	6	2216517	2216522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081951
45237	NC_008044	TC	3	6	2216562	2216567	0 %	50 %	0 %	50 %	99081951
45238	NC_008044	ATC	2	6	2216594	2216599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081951
45239	NC_008044	GTCG	2	8	2216611	2216618	0 %	25 %	50 %	25 %	99081951
45240	NC_008044	GGC	2	6	2216621	2216626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081951
45241	NC_008044	CGA	2	6	2216764	2216769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081951
45242	NC_008044	AAC	2	6	2216809	2216814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081951
45243	NC_008044	AG	3	6	2216866	2216871	50 %	0 %	50 %	0 %	99081951
45244	NC_008044	CTGCCG	2	12	2216873	2216884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99081951
45245	NC_008044	GC	3	6	2216911	2216916	0 %	0 %	50 %	50 %	99081951
45246	NC_008044	GGC	2	6	2216959	2216964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081951
45247	NC_008044	AG	3	6	2216965	2216970	50 %	0 %	50 %	0 %	99081951
45248	NC_008044	CG	3	6	2217004	2217009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45249	NC_008044	TCC	2	6	2217046	2217051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081952
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45252	NC_008044	TTC	2	6	2217123	2217128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081952
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45255	NC_008044	AG	3	6	2217249	2217254	50 %	0 %	50 %	0 %	99081952
45256	NC_008044	TGGCG	2	10	2217476	2217485	0 %	20 %	60 %	20 %	99081952
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45263	NC_008044	AG	3	6	2217817	2217822	50 %	0 %	50 %	0 %	99081952
45264	NC_008044	TTTC	2	8	2217827	2217834	0 %	75 %	0 %	25 %	99081952
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45278	NC_008044	CG	3	6	2218770	2218775	0 %	0 %	50 %	50 %	99081953
45279	NC_008044	GCC	2	6	2218790	2218795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081953
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45304	NC_008044	TCCC	2	8	2219720	2219727	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45305	NC_008044	CG	3	6	2219728	2219733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45306	NC_008044	CGC	2	6	2219779	2219784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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45346	NC_008044	TGC	2	6	2221811	2221816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081955
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45348	NC_008044	ACA	2	6	2221868	2221873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081955
45349	NC_008044	TGC	3	9	2221904	2221912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081955
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45351	NC_008044	GGC	2	6	2221987	2221992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081955
45352	NC_008044	ACCT	2	8	2222176	2222183	25 %	25 %	0 %	50 %	99081955
45353	NC_008044	CTC	2	6	2222248	2222253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081955
45354	NC_008044	TCA	2	6	2222319	2222324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081956
45355	NC_008044	CA	3	6	2222323	2222328	50 %	0 %	0 %	50 %	99081956
45356	NC_008044	ACCAAC	2	12	2222392	2222403	50 %	0 %	0 %	50 %	99081956
45357	NC_008044	TAT	2	6	2222430	2222435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081956
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45360	NC_008044	CAC	3	9	2222467	2222475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081956
45361	NC_008044	GGAGCT	2	12	2222514	2222525	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99081956
45362	NC_008044	GTG	2	6	2222566	2222571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081956
45363	NC_008044	CG	3	6	2222635	2222640	0 %	0 %	50 %	50 %	99081956
45364	NC_008044	CGA	2	6	2222667	2222672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081956
45365	NC_008044	TGC	2	6	2222690	2222695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081956
45366	NC_008044	CCGC	2	8	2222705	2222712	0 %	0 %	25 %	75 %	99081956
45367	NC_008044	GC	4	8	2222828	2222835	0 %	0 %	50 %	50 %	99081956
45368	NC_008044	CGA	2	6	2222880	2222885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081956
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45371	NC_008044	CGTG	2	8	2222991	2222998	0 %	25 %	50 %	25 %	99081956
45372	NC_008044	TG	3	6	2223119	2223124	0 %	50 %	50 %	0 %	99081957
45373	NC_008044	ATG	2	6	2223128	2223133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081957
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45380	NC_008044	ATG	2	6	2223411	2223416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081957
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45384	NC_008044	CTTT	2	8	2223546	2223553	0 %	75 %	0 %	25 %	99081957
45385	NC_008044	GCC	2	6	2223576	2223581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081957
45386	NC_008044	GCT	2	6	2223634	2223639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081957
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45388	NC_008044	CA	3	6	2223910	2223915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45389	NC_008044	AGCC	2	8	2223933	2223940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45390	NC_008044	GCG	2	6	2224055	2224060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081958
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45414	NC_008044	GCG	2	6	2225022	2225027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45415	NC_008044	ACCGA	2	10	2225065	2225074	40 %	0 %	20 %	40 %	99081959
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45419	NC_008044	GGCT	2	8	2225254	2225261	0 %	25 %	50 %	25 %	99081959
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45424	NC_008044	ACC	2	6	2225468	2225473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45425	NC_008044	GGC	2	6	2225535	2225540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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45427	NC_008044	T	6	6	2225605	2225610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45428	NC_008044	GCG	2	6	2225613	2225618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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45465	NC_008044	AT	3	6	2227469	2227474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45466	NC_008044	GCGCA	2	10	2227484	2227493	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45467	NC_008044	TCC	2	6	2227519	2227524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081962
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45472	NC_008044	TTC	2	6	2227899	2227904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081962
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45474	NC_008044	GCCC	2	8	2228166	2228173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45475	NC_008044	GC	3	6	2228186	2228191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45476	NC_008044	GCA	2	6	2228238	2228243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45478	NC_008044	CGC	2	6	2228342	2228347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45479	NC_008044	TGG	2	6	2228357	2228362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45480	NC_008044	CGC	2	6	2228367	2228372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45481	NC_008044	C	6	6	2228377	2228382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45482	NC_008044	TGA	2	6	2228431	2228436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45483	NC_008044	CG	3	6	2228542	2228547	0 %	0 %	50 %	50 %	99081963
45484	NC_008044	ATC	2	6	2228552	2228557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081963
45485	NC_008044	CGCCAT	2	12	2228564	2228575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99081963
45486	NC_008044	GC	3	6	2228671	2228676	0 %	0 %	50 %	50 %	99081963
45487	NC_008044	CAG	2	6	2228699	2228704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081963
45488	NC_008044	CAA	2	6	2228710	2228715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081963
45489	NC_008044	AG	3	6	2228716	2228721	50 %	0 %	50 %	0 %	99081963
45490	NC_008044	GGCAT	2	10	2228775	2228784	20 %	20 %	40 %	20 %	99081963
45491	NC_008044	CCT	2	6	2228785	2228790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45492	NC_008044	GT	3	6	2228794	2228799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45493	NC_008044	CGA	2	6	2228855	2228860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45494	NC_008044	TGC	2	6	2228872	2228877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45495	NC_008044	CGC	2	6	2228985	2228990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081964
45496	NC_008044	TTG	2	6	2229049	2229054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081964
45497	NC_008044	GTG	2	6	2229063	2229068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081964
45498	NC_008044	TGGA	2	8	2229072	2229079	25 %	25 %	50 %	0 %	99081964
45499	NC_008044	GCC	2	6	2229109	2229114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081964
45500	NC_008044	TAT	2	6	2229156	2229161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081964

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