MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44003	NC_008044	CG	3	6	2155894	2155899	0 %	0 %	50 %	50 %	99081893
44004	NC_008044	CTT	2	6	2155938	2155943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081893
44005	NC_008044	GAC	2	6	2156002	2156007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081893
44006	NC_008044	CAG	2	6	2156089	2156094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081893
44007	NC_008044	GCG	2	6	2156100	2156105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081893
44008	NC_008044	GA	5	10	2156111	2156120	50 %	0 %	50 %	0 %	99081893
44009	NC_008044	GACC	2	8	2156136	2156143	25 %	0 %	25 %	50 %	99081893
44010	NC_008044	CG	4	8	2156178	2156185	0 %	0 %	50 %	50 %	99081893
44011	NC_008044	GCA	2	6	2156229	2156234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081893
44012	NC_008044	CGGT	2	8	2156348	2156355	0 %	25 %	50 %	25 %	99081893
44013	NC_008044	TGT	2	6	2156368	2156373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081893
44014	NC_008044	TGT	2	6	2156503	2156508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44015	NC_008044	GGCGC	2	10	2156532	2156541	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44016	NC_008044	GCT	2	6	2156701	2156706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44017	NC_008044	GCA	2	6	2156716	2156721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44018	NC_008044	CCCAA	2	10	2156733	2156742	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44019	NC_008044	GGA	2	6	2156814	2156819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44020	NC_008044	GAG	2	6	2156945	2156950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44021	NC_008044	CCAC	2	8	2157079	2157086	25 %	0 %	0 %	75 %	99081894
44022	NC_008044	GC	3	6	2157185	2157190	0 %	0 %	50 %	50 %	99081894
44023	NC_008044	GC	4	8	2157354	2157361	0 %	0 %	50 %	50 %	99081894
44024	NC_008044	GC	3	6	2157438	2157443	0 %	0 %	50 %	50 %	99081894
44025	NC_008044	GGA	2	6	2157449	2157454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081894
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44028	NC_008044	CAT	2	6	2157524	2157529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081894
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44030	NC_008044	GAT	2	6	2157563	2157568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081894
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44032	NC_008044	GGA	3	9	2157635	2157643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081894
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44034	NC_008044	ATC	2	6	2157735	2157740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081894
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44036	NC_008044	GAG	2	6	2158017	2158022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081894
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44039	NC_008044	GGGCC	2	10	2158188	2158197	0 %	0 %	60 %	40 %	99081894
44040	NC_008044	AGC	2	6	2158234	2158239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081894
44041	NC_008044	TGC	2	6	2158245	2158250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081894
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44043	NC_008044	ATCAC	2	10	2158309	2158318	40 %	20 %	0 %	40 %	99081894
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44052	NC_008044	ACG	2	6	2158585	2158590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081894
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44055	NC_008044	GGC	2	6	2158715	2158720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081894
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44058	NC_008044	GC	3	6	2158829	2158834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44059	NC_008044	TGAC	2	8	2158888	2158895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44060	NC_008044	CCG	2	6	2158910	2158915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44061	NC_008044	CTG	2	6	2158972	2158977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081895
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44064	NC_008044	GCAG	2	8	2159052	2159059	25 %	0 %	50 %	25 %	99081895
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44111	NC_008044	GGCG	2	8	2161064	2161071	0 %	0 %	75 %	25 %	99081897
44112	NC_008044	GGCC	2	8	2161168	2161175	0 %	0 %	50 %	50 %	99081897
44113	NC_008044	CGC	2	6	2161178	2161183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081897
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44121	NC_008044	CCG	2	6	2161408	2161413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081897
44122	NC_008044	TGC	2	6	2161427	2161432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081897
44123	NC_008044	CTCA	2	8	2161445	2161452	25 %	25 %	0 %	50 %	99081897
44124	NC_008044	CAC	3	9	2161469	2161477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081897
44125	NC_008044	G	6	6	2161526	2161531	0 %	0 %	100 %	0 %	99081897
44126	NC_008044	AGACC	2	10	2161588	2161597	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44127	NC_008044	GCC	2	6	2161686	2161691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44128	NC_008044	CGC	2	6	2161701	2161706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081898
44129	NC_008044	C	7	7	2161719	2161725	0 %	0 %	0 %	100 %	99081898
44130	NC_008044	GCG	3	9	2161749	2161757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081898
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44132	NC_008044	CCA	2	6	2161817	2161822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081898
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44134	NC_008044	AGC	2	6	2161974	2161979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081898
44135	NC_008044	GTG	2	6	2161986	2161991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081898
44136	NC_008044	CCA	2	6	2162002	2162007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081898
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44142	NC_008044	CTG	2	6	2162193	2162198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081898
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44145	NC_008044	GCCA	2	8	2162256	2162263	25 %	0 %	25 %	50 %	99081898
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44150	NC_008044	CGC	2	6	2162440	2162445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081898
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44153	NC_008044	ATC	2	6	2162469	2162474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081898
44154	NC_008044	CGA	2	6	2162525	2162530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081898
44155	NC_008044	TGC	2	6	2162554	2162559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081898
44156	NC_008044	ATC	2	6	2162568	2162573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081898
44157	NC_008044	GCCA	2	8	2162580	2162587	25 %	0 %	25 %	50 %	99081898
44158	NC_008044	GTGA	2	8	2162613	2162620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44159	NC_008044	GGT	2	6	2162786	2162791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081899
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44162	NC_008044	GC	3	6	2163056	2163061	0 %	0 %	50 %	50 %	99081899
44163	NC_008044	GAG	2	6	2163198	2163203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081899
44164	NC_008044	CAC	2	6	2163252	2163257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081899
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44180	NC_008044	GC	4	8	2164058	2164065	0 %	0 %	50 %	50 %	99081900
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44207	NC_008044	GC	3	6	2165330	2165335	0 %	0 %	50 %	50 %	99081902
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44211	NC_008044	CTCAT	2	10	2165520	2165529	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44212	NC_008044	GCG	2	6	2165566	2165571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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44227	NC_008044	CGA	2	6	2166492	2166497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081903
44228	NC_008044	GAA	2	6	2166511	2166516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081903
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44231	NC_008044	TGT	2	6	2166614	2166619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081903
44232	NC_008044	CTG	2	6	2166651	2166656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081903
44233	NC_008044	CAT	2	6	2166663	2166668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081903
44234	NC_008044	CGG	2	6	2166687	2166692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081903
44235	NC_008044	GGC	2	6	2166705	2166710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081903
44236	NC_008044	GAT	2	6	2166717	2166722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081903
44237	NC_008044	GC	3	6	2166802	2166807	0 %	0 %	50 %	50 %	99081903
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44360	NC_008044	GAG	2	6	2172066	2172071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081907
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44362	NC_008044	AAT	2	6	2172102	2172107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99081907
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44476	NC_008044	CGC	2	6	2178546	2178551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081915
44477	NC_008044	TTC	2	6	2178565	2178570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081915
44478	NC_008044	GAC	2	6	2178646	2178651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081915
44479	NC_008044	TGG	2	6	2178656	2178661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081915
44480	NC_008044	GTGGC	2	10	2178677	2178686	0 %	20 %	60 %	20 %	99081915
44481	NC_008044	C	6	6	2178719	2178724	0 %	0 %	0 %	100 %	99081915
44482	NC_008044	TCG	2	6	2178731	2178736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081915
44483	NC_008044	GGCG	2	8	2178753	2178760	0 %	0 %	75 %	25 %	99081915
44484	NC_008044	TCG	2	6	2178812	2178817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081915
44485	NC_008044	CCG	2	6	2178833	2178838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081915
44486	NC_008044	CCG	2	6	2178926	2178931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081915
44487	NC_008044	TGA	2	6	2178953	2178958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081915
44488	NC_008044	CGC	2	6	2179037	2179042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081915
44489	NC_008044	GGCAC	2	10	2179070	2179079	20 %	0 %	40 %	40 %	99081915
44490	NC_008044	ACA	2	6	2179136	2179141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081915
44491	NC_008044	T	7	7	2179199	2179205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44492	NC_008044	A	6	6	2179216	2179221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44493	NC_008044	ACC	2	6	2179326	2179331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44494	NC_008044	CG	3	6	2179375	2179380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44495	NC_008044	TGAA	2	8	2179422	2179429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44496	NC_008044	GCC	2	6	2179431	2179436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44497	NC_008044	T	6	6	2179521	2179526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44498	NC_008044	TCA	2	6	2179585	2179590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081916
44499	NC_008044	ATC	2	6	2179653	2179658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081916
44500	NC_008044	CAA	2	6	2179699	2179704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081916

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