MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42003	NC_008044	GC	3	6	2062741	2062746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42004	NC_008044	CG	3	6	2062843	2062848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42005	NC_008044	GC	3	6	2062972	2062977	0 %	0 %	50 %	50 %	99081798
42006	NC_008044	GACA	2	8	2063047	2063054	50 %	0 %	25 %	25 %	99081798
42007	NC_008044	CAGCG	2	10	2063066	2063075	20 %	0 %	40 %	40 %	99081798
42008	NC_008044	CTTC	2	8	2063088	2063095	0 %	50 %	0 %	50 %	99081798
42009	NC_008044	CG	3	6	2063270	2063275	0 %	0 %	50 %	50 %	99081798
42010	NC_008044	CT	3	6	2063282	2063287	0 %	50 %	0 %	50 %	99081798
42011	NC_008044	GAAG	2	8	2063292	2063299	50 %	0 %	50 %	0 %	99081798
42012	NC_008044	AGA	3	9	2063327	2063335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081798
42013	NC_008044	GGTG	2	8	2063377	2063384	0 %	25 %	75 %	0 %	99081798
42014	NC_008044	CA	3	6	2063472	2063477	50 %	0 %	0 %	50 %	99081798
42015	NC_008044	GCC	2	6	2063501	2063506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42016	NC_008044	GCAAA	2	10	2063509	2063518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42017	NC_008044	TCCCCC	2	12	2063539	2063550	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
42018	NC_008044	GAC	2	6	2063569	2063574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42019	NC_008044	GAC	2	6	2063623	2063628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42042	NC_008044	TGA	2	6	2064643	2064648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081800
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42052	NC_008044	CG	3	6	2065037	2065042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42053	NC_008044	TGCG	2	8	2065053	2065060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42054	NC_008044	GCG	2	6	2065083	2065088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42055	NC_008044	CGT	2	6	2065127	2065132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42058	NC_008044	CAT	2	6	2065275	2065280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081801
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42118	NC_008044	GCA	2	6	2068294	2068299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081804
42119	NC_008044	GCCCG	2	10	2068300	2068309	0 %	0 %	40 %	60 %	99081804
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42122	NC_008044	CGG	2	6	2068647	2068652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081804
42123	NC_008044	CCG	2	6	2068713	2068718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081804
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42126	NC_008044	TGC	2	6	2068778	2068783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081804
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42128	NC_008044	G	7	7	2068950	2068956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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42172	NC_008044	GC	3	6	2071016	2071021	0 %	0 %	50 %	50 %	99081807
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42230	NC_008044	CCTT	2	8	2073557	2073564	0 %	50 %	0 %	50 %	99081808
42231	NC_008044	TCAG	2	8	2073570	2073577	25 %	25 %	25 %	25 %	99081808
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42478	NC_008044	GTC	2	6	2084789	2084794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42479	NC_008044	CCGGA	2	10	2084856	2084865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42480	NC_008044	GC	5	10	2084915	2084924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42481	NC_008044	GACA	2	8	2084943	2084950	50 %	0 %	25 %	25 %	99081821
42482	NC_008044	GCC	2	6	2084951	2084956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081821
42483	NC_008044	TTG	2	6	2084996	2085001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081821
42484	NC_008044	GCGCG	2	10	2085024	2085033	0 %	0 %	60 %	40 %	99081821
42485	NC_008044	GCC	2	6	2085094	2085099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081821
42486	NC_008044	AG	3	6	2085141	2085146	50 %	0 %	50 %	0 %	99081821
42487	NC_008044	GC	3	6	2085156	2085161	0 %	0 %	50 %	50 %	99081821
42488	NC_008044	CAT	2	6	2085198	2085203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081821
42489	NC_008044	CCT	2	6	2085225	2085230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081821
42490	NC_008044	GGC	2	6	2085325	2085330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081821
42491	NC_008044	GAC	2	6	2085355	2085360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081821
42492	NC_008044	CGC	2	6	2085474	2085479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081821
42493	NC_008044	GAC	2	6	2085484	2085489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081821
42494	NC_008044	GC	3	6	2085536	2085541	0 %	0 %	50 %	50 %	99081821
42495	NC_008044	CCG	2	6	2085551	2085556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081821
42496	NC_008044	GACC	2	8	2085570	2085577	25 %	0 %	25 %	50 %	99081821
42497	NC_008044	CG	3	6	2085578	2085583	0 %	0 %	50 %	50 %	99081821
42498	NC_008044	ATGGC	2	10	2085614	2085623	20 %	20 %	40 %	20 %	99081821
42499	NC_008044	TGGC	2	8	2085751	2085758	0 %	25 %	50 %	25 %	99081821
42500	NC_008044	TCGC	2	8	2085806	2085813	0 %	25 %	25 %	50 %	99081821

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