MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_008044	TCCC	2	8	2014629	2014636	0 %	25 %	0 %	75 %	99081753
41002	NC_008044	GAT	2	6	2014656	2014661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081753
41003	NC_008044	GCC	2	6	2014670	2014675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081753
41004	NC_008044	GCA	2	6	2014680	2014685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081753
41005	NC_008044	AGGCCG	2	12	2014739	2014750	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99081753
41006	NC_008044	CGC	2	6	2014756	2014761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081753
41007	NC_008044	GCTGA	2	10	2014788	2014797	20 %	20 %	40 %	20 %	99081753
41008	NC_008044	AACCG	2	10	2014831	2014840	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41009	NC_008044	GCCCT	2	10	2014846	2014855	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41010	NC_008044	CTG	2	6	2014892	2014897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41011	NC_008044	CCT	2	6	2014909	2014914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41012	NC_008044	TCGCG	2	10	2014976	2014985	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41013	NC_008044	CTG	2	6	2015051	2015056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081754
41014	NC_008044	CGC	2	6	2015261	2015266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081754
41015	NC_008044	CTTTGG	2	12	2015307	2015318	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	99081754
41016	NC_008044	CGC	2	6	2015319	2015324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081754
41017	NC_008044	CCG	2	6	2015339	2015344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081754
41018	NC_008044	TGC	2	6	2015373	2015378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081754
41019	NC_008044	TGG	2	6	2015480	2015485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081754
41020	NC_008044	ACC	2	6	2015491	2015496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081754
41021	NC_008044	AAGA	2	8	2015497	2015504	75 %	0 %	25 %	0 %	99081754
41022	NC_008044	CCT	2	6	2015582	2015587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081754
41023	NC_008044	GCC	2	6	2015719	2015724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081754
41024	NC_008044	TCA	2	6	2015756	2015761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081754
41025	NC_008044	ATG	2	6	2015770	2015775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081754
41026	NC_008044	GCT	2	6	2015784	2015789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081754
41027	NC_008044	CAGA	2	8	2015824	2015831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41028	NC_008044	CTTTT	2	10	2015857	2015866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41029	NC_008044	T	6	6	2015863	2015868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41030	NC_008044	GCT	2	6	2015956	2015961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081755
41031	NC_008044	AC	3	6	2016006	2016011	50 %	0 %	0 %	50 %	99081755
41032	NC_008044	TC	3	6	2016031	2016036	0 %	50 %	0 %	50 %	99081755
41033	NC_008044	AGG	2	6	2016099	2016104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081755
41034	NC_008044	TGC	2	6	2016180	2016185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081755
41035	NC_008044	TCGCCG	2	12	2016192	2016203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99081755
41036	NC_008044	AGA	2	6	2016253	2016258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081755
41037	NC_008044	TGA	2	6	2016354	2016359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081755
41038	NC_008044	TGA	2	6	2016385	2016390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081755
41039	NC_008044	CGC	2	6	2016429	2016434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081755
41040	NC_008044	CTG	2	6	2016450	2016455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41041	NC_008044	GAG	3	9	2016496	2016504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41042	NC_008044	AGG	2	6	2016514	2016519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41043	NC_008044	CTC	3	9	2016533	2016541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41044	NC_008044	CGACCG	2	12	2016567	2016578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41045	NC_008044	AGC	2	6	2016638	2016643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41046	NC_008044	T	6	6	2016667	2016672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41047	NC_008044	ACC	2	6	2016681	2016686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41048	NC_008044	CAT	2	6	2016709	2016714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41049	NC_008044	AT	4	8	2016767	2016774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41050	NC_008044	T	6	6	2016779	2016784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41051	NC_008044	GCA	2	6	2016807	2016812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41052	NC_008044	GC	3	6	2016864	2016869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41053	NC_008044	A	6	6	2016921	2016926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41054	NC_008044	CTT	2	6	2016998	2017003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081756
41055	NC_008044	GC	3	6	2017020	2017025	0 %	0 %	50 %	50 %	99081756
41056	NC_008044	CG	3	6	2017069	2017074	0 %	0 %	50 %	50 %	99081756
41057	NC_008044	GTC	2	6	2017135	2017140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081756
41058	NC_008044	TGG	2	6	2017228	2017233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41059	NC_008044	CT	3	6	2017285	2017290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41060	NC_008044	AG	3	6	2017337	2017342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41061	NC_008044	TTC	2	6	2017396	2017401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41062	NC_008044	CT	3	6	2017443	2017448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41063	NC_008044	GCG	2	6	2017466	2017471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41064	NC_008044	CG	3	6	2017493	2017498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41065	NC_008044	GCGGT	2	10	2017554	2017563	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41066	NC_008044	GCG	2	6	2017622	2017627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41067	NC_008044	TGCCC	2	10	2017663	2017672	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41068	NC_008044	CGT	2	6	2017689	2017694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41069	NC_008044	CT	3	6	2017750	2017755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41070	NC_008044	GC	3	6	2017777	2017782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41071	NC_008044	GC	3	6	2017833	2017838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41072	NC_008044	AGA	3	9	2017863	2017871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41073	NC_008044	GA	3	6	2017877	2017882	50 %	0 %	50 %	0 %	99081757
41074	NC_008044	CGC	2	6	2017899	2017904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081757
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41077	NC_008044	CGG	2	6	2017974	2017979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081757
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41080	NC_008044	CGC	2	6	2018235	2018240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081757
41081	NC_008044	GGT	2	6	2018322	2018327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081757
41082	NC_008044	CGC	2	6	2018358	2018363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081757
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41086	NC_008044	CAG	2	6	2018826	2018831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081758
41087	NC_008044	CAC	2	6	2018839	2018844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081758
41088	NC_008044	GC	4	8	2018853	2018860	0 %	0 %	50 %	50 %	99081758
41089	NC_008044	CCA	2	6	2018949	2018954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081758
41090	NC_008044	GC	3	6	2018993	2018998	0 %	0 %	50 %	50 %	99081758
41091	NC_008044	CTGCC	2	10	2019007	2019016	0 %	20 %	20 %	60 %	99081758
41092	NC_008044	AG	3	6	2019019	2019024	50 %	0 %	50 %	0 %	99081758
41093	NC_008044	GCA	2	6	2019026	2019031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081758
41094	NC_008044	GTC	2	6	2019049	2019054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081758
41095	NC_008044	GCT	2	6	2019090	2019095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081758
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41100	NC_008044	TGC	2	6	2019307	2019312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41101	NC_008044	ACC	2	6	2019349	2019354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081759
41102	NC_008044	GGGC	2	8	2019358	2019365	0 %	0 %	75 %	25 %	99081759
41103	NC_008044	AGA	2	6	2019411	2019416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081759
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41106	NC_008044	GCA	2	6	2019633	2019638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081759
41107	NC_008044	CTT	2	6	2019656	2019661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081759
41108	NC_008044	GC	4	8	2019680	2019687	0 %	0 %	50 %	50 %	99081759
41109	NC_008044	CGT	2	6	2019700	2019705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081759
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41111	NC_008044	CGT	2	6	2019847	2019852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081759
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41231	NC_008044	CGCT	2	8	2025793	2025800	0 %	25 %	25 %	50 %	99081767
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41236	NC_008044	CG	3	6	2025943	2025948	0 %	0 %	50 %	50 %	99081767
41237	NC_008044	GC	4	8	2025955	2025962	0 %	0 %	50 %	50 %	99081767
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41241	NC_008044	CCGC	2	8	2026160	2026167	0 %	0 %	25 %	75 %	99081768
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41247	NC_008044	CG	3	6	2026302	2026307	0 %	0 %	50 %	50 %	99081768
41248	NC_008044	TCG	2	6	2026321	2026326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081768
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41356	NC_008044	TCAA	2	8	2031320	2031327	50 %	25 %	0 %	25 %	99081772
41357	NC_008044	TTGCC	2	10	2031381	2031390	0 %	40 %	20 %	40 %	99081773
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41359	NC_008044	GC	3	6	2031488	2031493	0 %	0 %	50 %	50 %	99081773
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41362	NC_008044	ACA	2	6	2031662	2031667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081773
41363	NC_008044	TGC	2	6	2031686	2031691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081773
41364	NC_008044	TCA	2	6	2031717	2031722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081773
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41368	NC_008044	CCCCG	2	10	2031886	2031895	0 %	0 %	20 %	80 %	99081773
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41385	NC_008044	AT	3	6	2032628	2032633	50 %	50 %	0 %	0 %	99081773
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41451	NC_008044	A	6	6	2036189	2036194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41476	NC_008044	GCG	2	6	2037419	2037424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081775
41477	NC_008044	GCC	2	6	2037452	2037457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081775
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41479	NC_008044	CG	3	6	2037518	2037523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41480	NC_008044	GCAAGA	2	12	2037543	2037554	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41481	NC_008044	GAT	2	6	2037745	2037750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081776
41482	NC_008044	TGC	2	6	2037787	2037792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081776
41483	NC_008044	TGA	2	6	2037807	2037812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081776
41484	NC_008044	TGA	2	6	2037858	2037863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081776
41485	NC_008044	GAA	2	6	2037865	2037870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081776
41486	NC_008044	CTGCAC	2	12	2037964	2037975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99081776
41487	NC_008044	AGA	3	9	2038062	2038070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081776
41488	NC_008044	ATG	2	6	2038130	2038135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081776
41489	NC_008044	GAT	2	6	2038138	2038143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081776
41490	NC_008044	GAT	2	6	2038176	2038181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081776
41491	NC_008044	CGG	2	6	2038206	2038211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081776
41492	NC_008044	TCG	2	6	2038233	2038238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081776
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41497	NC_008044	CCCG	2	8	2038402	2038409	0 %	0 %	25 %	75 %	99081776
41498	NC_008044	TGG	2	6	2038416	2038421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081776
41499	NC_008044	CAC	2	6	2038432	2038437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081776
41500	NC_008044	GGA	2	6	2038542	2038547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081776

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