MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_008044	AG	3	6	175630	175635	50 %	0 %	50 %	0 %	99080000
3503	NC_008044	CCGC	2	8	175736	175743	0 %	0 %	25 %	75 %	99080000
3504	NC_008044	CGC	2	6	175750	175755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080000
3505	NC_008044	TCGCGG	2	12	175775	175786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99080000
3506	NC_008044	GCC	2	6	175807	175812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080000
3507	NC_008044	TG	3	6	175821	175826	0 %	50 %	50 %	0 %	99080000
3508	NC_008044	AGT	2	6	175881	175886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080000
3509	NC_008044	GC	3	6	175935	175940	0 %	0 %	50 %	50 %	99080000
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3512	NC_008044	CGA	2	6	176112	176117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080000
3513	NC_008044	CGTGC	2	10	176221	176230	0 %	20 %	40 %	40 %	99080000
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3515	NC_008044	TGA	2	6	176275	176280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3518	NC_008044	TG	3	6	176463	176468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008044	TGG	2	6	176536	176541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080001
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3533	NC_008044	GGCGG	2	10	177434	177443	0 %	0 %	80 %	20 %	99080002
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3541	NC_008044	CGA	2	6	178042	178047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080002
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3544	NC_008044	AT	3	6	178184	178189	50 %	50 %	0 %	0 %	99080002
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3581	NC_008044	CACAC	2	10	179920	179929	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3582	NC_008044	GC	3	6	179949	179954	0 %	0 %	50 %	50 %	99080004
3583	NC_008044	GGTC	2	8	179977	179984	0 %	25 %	50 %	25 %	99080004
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3593	NC_008044	GCC	2	6	180443	180448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080004
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3602	NC_008044	GC	3	6	180842	180847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_008044	GCGTC	2	10	180883	180892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3604	NC_008044	GC	3	6	180918	180923	0 %	0 %	50 %	50 %	99080005
3605	NC_008044	CAT	2	6	180943	180948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080005
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3608	NC_008044	CGAGG	2	10	181114	181123	20 %	0 %	60 %	20 %	99080005
3609	NC_008044	GCC	2	6	181169	181174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080005
3610	NC_008044	AC	3	6	181198	181203	50 %	0 %	0 %	50 %	99080005
3611	NC_008044	GC	3	6	181206	181211	0 %	0 %	50 %	50 %	99080005
3612	NC_008044	GC	3	6	181263	181268	0 %	0 %	50 %	50 %	99080005
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3619	NC_008044	GCAG	2	8	181573	181580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_008044	GC	3	6	181586	181591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_008044	A	6	6	181599	181604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3623	NC_008044	CGG	2	6	181746	181751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080006
3624	NC_008044	T	6	6	181939	181944	0 %	100 %	0 %	0 %	99080006
3625	NC_008044	CAT	2	6	181945	181950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080006
3626	NC_008044	TGC	2	6	182067	182072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_008044	GC	3	6	182071	182076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3629	NC_008044	CGG	2	6	182147	182152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080007
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3742	NC_008044	GA	3	6	187323	187328	50 %	0 %	50 %	0 %	99080010
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3749	NC_008044	AGA	2	6	187799	187804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3750	NC_008044	T	7	7	187843	187849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3751	NC_008044	TG	3	6	187879	187884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3752	NC_008044	TA	3	6	187935	187940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3753	NC_008044	AAAT	2	8	187954	187961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3755	NC_008044	TGG	2	6	188007	188012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080011
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3757	NC_008044	CGC	2	6	188076	188081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080011
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3759	NC_008044	T	6	6	188358	188363	0 %	100 %	0 %	0 %	99080011
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3787	NC_008044	GTT	2	6	189634	189639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3788	NC_008044	CTGA	2	8	189803	189810	25 %	25 %	25 %	25 %	99080013
3789	NC_008044	CTGG	2	8	189845	189852	0 %	25 %	50 %	25 %	99080013
3790	NC_008044	CGA	2	6	189867	189872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080013
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3877	NC_008044	GCAG	2	8	194192	194199	25 %	0 %	50 %	25 %	99080016
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4000	NC_008044	CGGG	2	8	199266	199273	0 %	0 %	75 %	25 %	99080020

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