MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_008044	GCATGG	2	12	1923113	1923124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99081668
39003	NC_008044	CGG	2	6	1923169	1923174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081668
39004	NC_008044	CAC	3	9	1923286	1923294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081668
39005	NC_008044	AAG	2	6	1923340	1923345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081668
39006	NC_008044	CACCG	2	10	1923373	1923382	20 %	0 %	20 %	60 %	99081668
39007	NC_008044	GCA	2	6	1923417	1923422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081668
39008	NC_008044	CCA	2	6	1923429	1923434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081668
39009	NC_008044	CGAG	2	8	1923453	1923460	25 %	0 %	50 %	25 %	99081668
39010	NC_008044	GCC	2	6	1923473	1923478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081668
39011	NC_008044	CGG	2	6	1923558	1923563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081668
39012	NC_008044	CCG	2	6	1923582	1923587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081668
39013	NC_008044	ACA	2	6	1923594	1923599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081668
39014	NC_008044	CGC	2	6	1923655	1923660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081668
39015	NC_008044	TCC	2	6	1923694	1923699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39016	NC_008044	CG	3	6	1923712	1923717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39017	NC_008044	GAT	2	6	1923837	1923842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39018	NC_008044	TAAGG	2	10	1923883	1923892	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39019	NC_008044	CGG	2	6	1923925	1923930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39020	NC_008044	CG	3	6	1923938	1923943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39021	NC_008044	TC	3	6	1923959	1923964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39022	NC_008044	CG	3	6	1924031	1924036	0 %	0 %	50 %	50 %	99081669
39023	NC_008044	GC	3	6	1924039	1924044	0 %	0 %	50 %	50 %	99081669
39024	NC_008044	GCCC	2	8	1924050	1924057	0 %	0 %	25 %	75 %	99081669
39025	NC_008044	CCA	2	6	1924062	1924067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081669
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39027	NC_008044	CAC	2	6	1924111	1924116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081669
39028	NC_008044	CCA	2	6	1924155	1924160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081669
39029	NC_008044	TGG	2	6	1924164	1924169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081669
39030	NC_008044	CGCT	2	8	1924211	1924218	0 %	25 %	25 %	50 %	99081669
39031	NC_008044	AGC	2	6	1924253	1924258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081669
39032	NC_008044	CGCAAT	2	12	1924285	1924296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99081669
39033	NC_008044	GCCC	2	8	1924308	1924315	0 %	0 %	25 %	75 %	99081669
39034	NC_008044	CAT	2	6	1924347	1924352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081669
39035	NC_008044	ATG	2	6	1924370	1924375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081669
39036	NC_008044	GGC	3	9	1924399	1924407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081669
39037	NC_008044	TCGC	2	8	1924421	1924428	0 %	25 %	25 %	50 %	99081669
39038	NC_008044	CG	4	8	1924455	1924462	0 %	0 %	50 %	50 %	99081669
39039	NC_008044	GCA	2	6	1924466	1924471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081669
39040	NC_008044	GGC	2	6	1924506	1924511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081669
39041	NC_008044	ATC	2	6	1924516	1924521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081669
39042	NC_008044	GC	3	6	1924522	1924527	0 %	0 %	50 %	50 %	99081669
39043	NC_008044	ATC	2	6	1924592	1924597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081669
39044	NC_008044	GCCC	2	8	1924615	1924622	0 %	0 %	25 %	75 %	99081669
39045	NC_008044	GCA	2	6	1924758	1924763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081669
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39049	NC_008044	CGT	2	6	1924950	1924955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081669
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39053	NC_008044	CGA	2	6	1925158	1925163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081669
39054	NC_008044	CGC	2	6	1925207	1925212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081669
39055	NC_008044	CCG	2	6	1925238	1925243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081669
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39057	NC_008044	AGC	2	6	1925285	1925290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081669
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39070	NC_008044	CTGCA	2	10	1925779	1925788	20 %	20 %	20 %	40 %	99081669
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39072	NC_008044	GC	3	6	1925839	1925844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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39074	NC_008044	CCCG	2	8	1925987	1925994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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39092	NC_008044	T	6	6	1926861	1926866	0 %	100 %	0 %	0 %	99081670
39093	NC_008044	CG	3	6	1926888	1926893	0 %	0 %	50 %	50 %	99081670
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39096	NC_008044	CTTCG	2	10	1927008	1927017	0 %	40 %	20 %	40 %	99081670
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39100	NC_008044	CAT	2	6	1927157	1927162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39101	NC_008044	TTTGG	2	10	1927222	1927231	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39102	NC_008044	TGCT	2	8	1927275	1927282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39103	NC_008044	GAG	2	6	1927301	1927306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39104	NC_008044	TGGC	2	8	1927335	1927342	0 %	25 %	50 %	25 %	99081671
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39106	NC_008044	CAT	2	6	1927368	1927373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081671
39107	NC_008044	CAT	2	6	1927398	1927403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081671
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39111	NC_008044	AC	3	6	1927520	1927525	50 %	0 %	0 %	50 %	99081671
39112	NC_008044	CG	3	6	1927538	1927543	0 %	0 %	50 %	50 %	99081671
39113	NC_008044	GC	3	6	1927551	1927556	0 %	0 %	50 %	50 %	99081671
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39118	NC_008044	GC	3	6	1927704	1927709	0 %	0 %	50 %	50 %	99081671
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39120	NC_008044	CTG	2	6	1927777	1927782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081671
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39477	NC_008044	ATGC	2	8	1944190	1944197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39478	NC_008044	GCA	2	6	1944204	1944209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39479	NC_008044	TGC	2	6	1944224	1944229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39480	NC_008044	CGC	2	6	1944262	1944267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39481	NC_008044	GC	3	6	1944266	1944271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39482	NC_008044	GGC	2	6	1944278	1944283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39483	NC_008044	GC	3	6	1944375	1944380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39484	NC_008044	GCC	2	6	1944395	1944400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39485	NC_008044	AGC	2	6	1944428	1944433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39486	NC_008044	ACC	2	6	1944510	1944515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39487	NC_008044	TC	3	6	1944567	1944572	0 %	50 %	0 %	50 %	99081684
39488	NC_008044	TGG	2	6	1944596	1944601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081684
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39490	NC_008044	CCA	2	6	1944646	1944651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081684
39491	NC_008044	ACCG	2	8	1944699	1944706	25 %	0 %	25 %	50 %	99081684
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39493	NC_008044	GATC	2	8	1944721	1944728	25 %	25 %	25 %	25 %	99081684
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39495	NC_008044	GTCT	2	8	1944753	1944760	0 %	50 %	25 %	25 %	99081684
39496	NC_008044	GC	5	10	1944787	1944796	0 %	0 %	50 %	50 %	99081684
39497	NC_008044	GC	3	6	1944812	1944817	0 %	0 %	50 %	50 %	99081684
39498	NC_008044	CGC	2	6	1944836	1944841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081684
39499	NC_008044	CG	3	6	1944866	1944871	0 %	0 %	50 %	50 %	99081684
39500	NC_008044	TCGCTC	2	12	1944936	1944947	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

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