MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36504	NC_008044	GCT	2	6	1803902	1803907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081547
36505	NC_008044	CAT	2	6	1803951	1803956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081547
36506	NC_008044	CGC	2	6	1803962	1803967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081547
36507	NC_008044	CAA	2	6	1804005	1804010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081547
36508	NC_008044	TGG	3	9	1804106	1804114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081547
36509	NC_008044	CAG	2	6	1804135	1804140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081547
36510	NC_008044	CGG	2	6	1804206	1804211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081547
36511	NC_008044	CAT	2	6	1804215	1804220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081547
36512	NC_008044	CGT	2	6	1804244	1804249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081547
36513	NC_008044	GGCG	2	8	1804278	1804285	0 %	0 %	75 %	25 %	99081547
36514	NC_008044	ACG	2	6	1804331	1804336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081547
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36601	NC_008044	CG	4	8	1808493	1808500	0 %	0 %	50 %	50 %	99081551
36602	NC_008044	TGG	2	6	1808521	1808526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081551
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36615	NC_008044	CCCAC	2	10	1809030	1809039	20 %	0 %	0 %	80 %	99081551
36616	NC_008044	CG	4	8	1809072	1809079	0 %	0 %	50 %	50 %	99081551
36617	NC_008044	CG	3	6	1809089	1809094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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36619	NC_008044	GC	4	8	1809109	1809116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36620	NC_008044	GC	3	6	1809125	1809130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36621	NC_008044	C	7	7	1809185	1809191	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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36623	NC_008044	TA	3	6	1809239	1809244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36628	NC_008044	CAAG	2	8	1809518	1809525	50 %	0 %	25 %	25 %	99081552
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36858	NC_008044	GCTC	2	8	1821463	1821470	0 %	25 %	25 %	50 %	99081563
36859	NC_008044	AGCCTA	2	12	1821494	1821505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99081563
36860	NC_008044	GCG	2	6	1821536	1821541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36861	NC_008044	CGC	2	6	1821657	1821662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081564
36862	NC_008044	ATT	2	6	1821697	1821702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081564
36863	NC_008044	CGG	2	6	1821759	1821764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081564
36864	NC_008044	GGC	2	6	1821838	1821843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081564
36865	NC_008044	CCAC	2	8	1821935	1821942	25 %	0 %	0 %	75 %	99081564
36866	NC_008044	CTG	2	6	1821964	1821969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081564
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36869	NC_008044	TGC	2	6	1822049	1822054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081564
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36874	NC_008044	TGG	2	6	1822385	1822390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081564
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36886	NC_008044	C	7	7	1822709	1822715	0 %	0 %	0 %	100 %	99081565
36887	NC_008044	TGA	2	6	1822726	1822731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081565
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36893	NC_008044	TC	3	6	1823252	1823257	0 %	50 %	0 %	50 %	99081566
36894	NC_008044	TGC	3	9	1823337	1823345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081566
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36908	NC_008044	TCA	2	6	1823960	1823965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081567
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36927	NC_008044	CTTCG	2	10	1824939	1824948	0 %	40 %	20 %	40 %	99081569
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36934	NC_008044	CCTG	2	8	1825208	1825215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36935	NC_008044	TGA	2	6	1825248	1825253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081570
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36953	NC_008044	CG	3	6	1826147	1826152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36954	NC_008044	GCT	2	6	1826267	1826272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081571
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36958	NC_008044	GCC	2	6	1826410	1826415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081571
36959	NC_008044	TCGA	2	8	1826547	1826554	25 %	25 %	25 %	25 %	99081571
36960	NC_008044	TGC	2	6	1826557	1826562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081571
36961	NC_008044	GC	3	6	1826634	1826639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36962	NC_008044	GT	3	6	1826641	1826646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36963	NC_008044	A	8	8	1826744	1826751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36964	NC_008044	GCA	2	6	1826790	1826795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36965	NC_008044	GAT	2	6	1826812	1826817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36966	NC_008044	CTG	2	6	1827150	1827155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36967	NC_008044	ACGCAC	2	12	1827368	1827379	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99081572
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36970	NC_008044	TGC	2	6	1827457	1827462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081572
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36973	NC_008044	GCTG	2	8	1827667	1827674	0 %	25 %	50 %	25 %	99081572
36974	NC_008044	GCA	2	6	1827878	1827883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081573
36975	NC_008044	CGC	2	6	1827976	1827981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081573
36976	NC_008044	TTC	2	6	1828023	1828028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081573
36977	NC_008044	GCC	2	6	1828056	1828061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081574
36978	NC_008044	CAA	2	6	1828072	1828077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081574
36979	NC_008044	CTG	2	6	1828118	1828123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081574
36980	NC_008044	CTC	2	6	1828130	1828135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081574
36981	NC_008044	CAG	2	6	1828226	1828231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081574
36982	NC_008044	TTG	2	6	1828275	1828280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081574
36983	NC_008044	T	6	6	1828325	1828330	0 %	100 %	0 %	0 %	99081574
36984	NC_008044	CGCGA	2	10	1828388	1828397	20 %	0 %	40 %	40 %	99081574
36985	NC_008044	TCG	2	6	1828435	1828440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081574
36986	NC_008044	TC	3	6	1828455	1828460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36987	NC_008044	GAC	2	6	1828468	1828473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36988	NC_008044	TTCT	2	8	1828542	1828549	0 %	75 %	0 %	25 %	99081575
36989	NC_008044	GCC	2	6	1828616	1828621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081575
36990	NC_008044	GGC	2	6	1828829	1828834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081575
36991	NC_008044	ATC	2	6	1828889	1828894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081575
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36995	NC_008044	GCC	2	6	1829009	1829014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081575
36996	NC_008044	CG	3	6	1829079	1829084	0 %	0 %	50 %	50 %	99081575
36997	NC_008044	TGA	2	6	1829136	1829141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081575
36998	NC_008044	CTGG	2	8	1829265	1829272	0 %	25 %	50 %	25 %	99081575
36999	NC_008044	GCG	2	6	1829285	1829290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081575
37000	NC_008044	GCG	2	6	1829309	1829314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081575

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