MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36003	NC_008044	GCG	2	6	1778080	1778085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081521
36004	NC_008044	TGC	2	6	1778088	1778093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081521
36005	NC_008044	GC	3	6	1778100	1778105	0 %	0 %	50 %	50 %	99081521
36006	NC_008044	CTG	2	6	1778115	1778120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081521
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36008	NC_008044	TGG	2	6	1778276	1778281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36011	NC_008044	GCGCG	2	10	1778531	1778540	0 %	0 %	60 %	40 %	99081522
36012	NC_008044	TC	3	6	1778606	1778611	0 %	50 %	0 %	50 %	99081522
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36020	NC_008044	GA	3	6	1778944	1778949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36021	NC_008044	AAACC	2	10	1779011	1779020	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36022	NC_008044	TTG	2	6	1779027	1779032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36039	NC_008044	A	7	7	1780029	1780035	100 %	0 %	0 %	0 %	99081524
36040	NC_008044	ACTC	2	8	1780102	1780109	25 %	25 %	0 %	50 %	99081524
36041	NC_008044	TA	3	6	1780141	1780146	50 %	50 %	0 %	0 %	99081524
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36053	NC_008044	TG	3	6	1780703	1780708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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36055	NC_008044	TAAA	2	8	1780791	1780798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36117	NC_008044	GGC	2	6	1783631	1783636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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36250	NC_008044	CTGTCG	2	12	1790461	1790472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081536
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36292	NC_008044	TGG	2	6	1792831	1792836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081536
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36325	NC_008044	GC	3	6	1794397	1794402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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36351	NC_008044	GCTG	2	8	1795713	1795720	0 %	25 %	50 %	25 %	99081540
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36356	NC_008044	CAGGA	2	10	1796002	1796011	40 %	0 %	40 %	20 %	99081540
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36480	NC_008044	GTC	2	6	1802417	1802422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081546
36481	NC_008044	GCC	2	6	1802537	1802542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081546
36482	NC_008044	CGG	2	6	1802596	1802601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081546
36483	NC_008044	CCACGG	2	12	1802635	1802646	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	99081546
36484	NC_008044	TGC	2	6	1802707	1802712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081546
36485	NC_008044	GC	4	8	1802808	1802815	0 %	0 %	50 %	50 %	99081546
36486	NC_008044	ATC	2	6	1802816	1802821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081546
36487	NC_008044	GTG	2	6	1802832	1802837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081546
36488	NC_008044	CAG	2	6	1802927	1802932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081546
36489	NC_008044	TCC	2	6	1802940	1802945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081546
36490	NC_008044	GTG	2	6	1803074	1803079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36491	NC_008044	CCA	2	6	1803128	1803133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36492	NC_008044	TGCGC	2	10	1803144	1803153	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36493	NC_008044	GC	3	6	1803255	1803260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36494	NC_008044	ATC	2	6	1803337	1803342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36495	NC_008044	GCA	2	6	1803353	1803358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36496	NC_008044	TCT	2	6	1803381	1803386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36497	NC_008044	G	6	6	1803600	1803605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36498	NC_008044	GTG	2	6	1803619	1803624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36499	NC_008044	GTGGG	2	10	1803626	1803635	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
36500	NC_008044	TGA	2	6	1803646	1803651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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