MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34004	NC_008044	GCG	2	6	1678796	1678801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081412
34005	NC_008044	CCG	2	6	1678832	1678837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081412
34006	NC_008044	GGC	2	6	1678878	1678883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081412
34007	NC_008044	CG	3	6	1678889	1678894	0 %	0 %	50 %	50 %	99081412
34008	NC_008044	GCA	2	6	1678931	1678936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081412
34009	NC_008044	CGCC	2	8	1678984	1678991	0 %	0 %	25 %	75 %	99081412
34010	NC_008044	ACC	2	6	1679002	1679007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081412
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34012	NC_008044	GC	5	10	1679093	1679102	0 %	0 %	50 %	50 %	99081412
34013	NC_008044	GGAC	2	8	1679121	1679128	25 %	0 %	50 %	25 %	99081412
34014	NC_008044	CG	3	6	1679166	1679171	0 %	0 %	50 %	50 %	99081412
34015	NC_008044	GCG	2	6	1679185	1679190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081412
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34017	NC_008044	TTGG	2	8	1679214	1679221	0 %	50 %	50 %	0 %	99081412
34018	NC_008044	CTG	2	6	1679235	1679240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081412
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34020	NC_008044	GAT	2	6	1679274	1679279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081412
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34104	NC_008044	GCCCT	2	10	1683168	1683177	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34105	NC_008044	CG	3	6	1683188	1683193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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34113	NC_008044	ACAG	2	8	1683445	1683452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34114	NC_008044	GGA	3	9	1683453	1683461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34115	NC_008044	TGGA	2	8	1683518	1683525	25 %	25 %	50 %	0 %	99081415
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34120	NC_008044	GC	3	6	1683769	1683774	0 %	0 %	50 %	50 %	99081415
34121	NC_008044	TCA	2	6	1683801	1683806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081415
34122	NC_008044	GAT	2	6	1683817	1683822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081415
34123	NC_008044	GGT	2	6	1683877	1683882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081415
34124	NC_008044	GGC	2	6	1683887	1683892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081415
34125	NC_008044	CCT	2	6	1683897	1683902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081415
34126	NC_008044	TGCGG	2	10	1683910	1683919	0 %	20 %	60 %	20 %	99081415
34127	NC_008044	GAC	2	6	1683923	1683928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081415
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34141	NC_008044	GC	3	6	1684564	1684569	0 %	0 %	50 %	50 %	99081415
34142	NC_008044	ATC	2	6	1684583	1684588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081415
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34144	NC_008044	CAGA	2	8	1684634	1684641	50 %	0 %	25 %	25 %	99081415
34145	NC_008044	TGC	2	6	1684657	1684662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081415
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34152	NC_008044	GC	3	6	1684940	1684945	0 %	0 %	50 %	50 %	99081415
34153	NC_008044	TCA	2	6	1684956	1684961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081415
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34159	NC_008044	GAT	2	6	1685294	1685299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081415
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34164	NC_008044	GATC	2	8	1685551	1685558	25 %	25 %	25 %	25 %	99081416
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34168	NC_008044	TCC	2	6	1685736	1685741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34179	NC_008044	CAGG	2	8	1686362	1686369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34180	NC_008044	C	6	6	1686403	1686408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34181	NC_008044	AGA	2	6	1686492	1686497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081418
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34192	NC_008044	TGA	2	6	1687124	1687129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081418
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34194	NC_008044	GAT	2	6	1687167	1687172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081418
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34201	NC_008044	CG	3	6	1687396	1687401	0 %	0 %	50 %	50 %	99081418
34202	NC_008044	TGA	2	6	1687424	1687429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081418
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34204	NC_008044	TGA	2	6	1687512	1687517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081418
34205	NC_008044	GCT	2	6	1687518	1687523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081418
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34207	NC_008044	GATCGC	2	12	1687630	1687641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99081418
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34210	NC_008044	GC	3	6	1687732	1687737	0 %	0 %	50 %	50 %	99081418
34211	NC_008044	CGA	2	6	1687898	1687903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34212	NC_008044	GC	3	6	1687909	1687914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34213	NC_008044	CTT	2	6	1687921	1687926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34214	NC_008044	CCG	2	6	1687943	1687948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34215	NC_008044	CG	3	6	1687990	1687995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34216	NC_008044	GCA	2	6	1688198	1688203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081419
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34222	NC_008044	ATCGCC	2	12	1688434	1688445	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99081419
34223	NC_008044	CATG	2	8	1688447	1688454	25 %	25 %	25 %	25 %	99081419
34224	NC_008044	CCCGG	2	10	1688457	1688466	0 %	0 %	40 %	60 %	99081419
34225	NC_008044	GAT	2	6	1688493	1688498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081419
34226	NC_008044	GGC	2	6	1688508	1688513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081419
34227	NC_008044	TCA	2	6	1688552	1688557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081419
34228	NC_008044	AACC	2	8	1688561	1688568	50 %	0 %	0 %	50 %	99081419
34229	NC_008044	C	6	6	1688644	1688649	0 %	0 %	0 %	100 %	99081419
34230	NC_008044	CAGAA	2	10	1688703	1688712	60 %	0 %	20 %	20 %	99081419
34231	NC_008044	TCG	2	6	1688856	1688861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34232	NC_008044	TGAC	2	8	1688940	1688947	25 %	25 %	25 %	25 %	99081420
34233	NC_008044	TTC	2	6	1688966	1688971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081420
34234	NC_008044	CT	3	6	1688981	1688986	0 %	50 %	0 %	50 %	99081420
34235	NC_008044	GTC	2	6	1689030	1689035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081420
34236	NC_008044	CGA	2	6	1689040	1689045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081420
34237	NC_008044	CTG	2	6	1689078	1689083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081420
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34239	NC_008044	TAT	2	6	1689149	1689154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081420
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34302	NC_008044	ATC	2	6	1692101	1692106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081423
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34350	NC_008044	CGG	2	6	1694264	1694269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34351	NC_008044	TGC	3	9	1694283	1694291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34352	NC_008044	CTGC	2	8	1694309	1694316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34353	NC_008044	AG	3	6	1694317	1694322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34354	NC_008044	CGAC	2	8	1694366	1694373	25 %	0 %	25 %	50 %	99081427
34355	NC_008044	G	6	6	1694423	1694428	0 %	0 %	100 %	0 %	99081427
34356	NC_008044	CGG	2	6	1694562	1694567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081427
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34482	NC_008044	CAT	2	6	1700904	1700909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081430
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