MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_008044	CG	3	6	1629027	1629032	0 %	0 %	50 %	50 %	99081366
33003	NC_008044	GTA	2	6	1629045	1629050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081366
33004	NC_008044	GCC	2	6	1629120	1629125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081366
33005	NC_008044	GGCG	2	8	1629129	1629136	0 %	0 %	75 %	25 %	99081366
33006	NC_008044	CTC	2	6	1629159	1629164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081366
33007	NC_008044	GTC	2	6	1629171	1629176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081366
33008	NC_008044	CGA	2	6	1629191	1629196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081366
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33010	NC_008044	CAG	2	6	1629263	1629268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33011	NC_008044	GAAA	2	8	1629273	1629280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33012	NC_008044	ATC	2	6	1629381	1629386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081367
33013	NC_008044	CCT	2	6	1629412	1629417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081367
33014	NC_008044	GAC	2	6	1629422	1629427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081367
33015	NC_008044	CG	3	6	1629507	1629512	0 %	0 %	50 %	50 %	99081367
33016	NC_008044	CAG	2	6	1629728	1629733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081367
33017	NC_008044	CT	3	6	1629780	1629785	0 %	50 %	0 %	50 %	99081367
33018	NC_008044	GCT	2	6	1629829	1629834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081367
33019	NC_008044	TGA	2	6	1629835	1629840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081367
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33021	NC_008044	CTG	2	6	1629911	1629916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081367
33022	NC_008044	GCG	2	6	1629937	1629942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081367
33023	NC_008044	CAG	2	6	1629974	1629979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081367
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33025	NC_008044	TCG	2	6	1630056	1630061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081367
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33027	NC_008044	GCA	2	6	1630111	1630116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081367
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33029	NC_008044	GCCT	2	8	1630154	1630161	0 %	25 %	25 %	50 %	99081367
33030	NC_008044	CAG	2	6	1630259	1630264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081367
33031	NC_008044	ATC	2	6	1630385	1630390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081367
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33033	NC_008044	TCA	2	6	1630494	1630499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081367
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33036	NC_008044	GTG	2	6	1630749	1630754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33037	NC_008044	CGT	2	6	1630772	1630777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081368
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33039	NC_008044	CGA	2	6	1630796	1630801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081368
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33042	NC_008044	ATG	2	6	1630957	1630962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081368
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33045	NC_008044	CG	3	6	1631009	1631014	0 %	0 %	50 %	50 %	99081368
33046	NC_008044	CAG	2	6	1631055	1631060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081368
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33051	NC_008044	GC	3	6	1631317	1631322	0 %	0 %	50 %	50 %	99081368
33052	NC_008044	GT	3	6	1631360	1631365	0 %	50 %	50 %	0 %	99081368
33053	NC_008044	ATGT	2	8	1631368	1631375	25 %	50 %	25 %	0 %	99081368
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33055	NC_008044	CCTG	2	8	1631398	1631405	0 %	25 %	25 %	50 %	99081368
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33063	NC_008044	GCT	2	6	1631900	1631905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081369
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33069	NC_008044	AACC	2	8	1632136	1632143	50 %	0 %	0 %	50 %	99081369
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33358	NC_008044	GGT	2	6	1647030	1647035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081379
33359	NC_008044	GC	3	6	1647067	1647072	0 %	0 %	50 %	50 %	99081379
33360	NC_008044	TGC	2	6	1647132	1647137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081379
33361	NC_008044	AGG	2	6	1647152	1647157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081379
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33363	NC_008044	CCG	2	6	1647186	1647191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081380
33364	NC_008044	GCT	2	6	1647265	1647270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081380
33365	NC_008044	CGC	2	6	1647324	1647329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081380
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33384	NC_008044	CAGG	2	8	1647985	1647992	25 %	0 %	50 %	25 %	99081381
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33400	NC_008044	CT	3	6	1648770	1648775	0 %	50 %	0 %	50 %	99081381
33401	NC_008044	CAT	2	6	1648782	1648787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081381
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33412	NC_008044	GC	3	6	1649382	1649387	0 %	0 %	50 %	50 %	99081382
33413	NC_008044	ATC	2	6	1649388	1649393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081382
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33415	NC_008044	G	6	6	1649477	1649482	0 %	0 %	100 %	0 %	99081382
33416	NC_008044	CACCAT	2	12	1649483	1649494	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	99081382
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33421	NC_008044	CGC	2	6	1649610	1649615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081382
33422	NC_008044	TGA	2	6	1649685	1649690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081383
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33427	NC_008044	TGC	2	6	1649877	1649882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081383
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33430	NC_008044	TCA	2	6	1649929	1649934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081384
33431	NC_008044	CGG	2	6	1649951	1649956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081384
33432	NC_008044	GCTCAA	2	12	1649987	1649998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99081384
33433	NC_008044	CCA	2	6	1650034	1650039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081384
33434	NC_008044	TGC	2	6	1650073	1650078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081384
33435	NC_008044	GCT	2	6	1650116	1650121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081384
33436	NC_008044	CAG	2	6	1650189	1650194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081384
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33438	NC_008044	CAG	2	6	1650272	1650277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081384
33439	NC_008044	C	6	6	1650312	1650317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33440	NC_008044	ATG	2	6	1650326	1650331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081385
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33442	NC_008044	TGC	2	6	1650483	1650488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081385
33443	NC_008044	CG	3	6	1650547	1650552	0 %	0 %	50 %	50 %	99081385
33444	NC_008044	GC	3	6	1650561	1650566	0 %	0 %	50 %	50 %	99081385
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33447	NC_008044	TGG	2	6	1650693	1650698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081385
33448	NC_008044	TGCGC	2	10	1650844	1650853	0 %	20 %	40 %	40 %	99081385
33449	NC_008044	CAG	3	9	1650854	1650862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081385
33450	NC_008044	ACA	2	6	1650973	1650978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081385
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33454	NC_008044	GC	5	10	1651065	1651074	0 %	0 %	50 %	50 %	99081385
33455	NC_008044	GGCT	2	8	1651079	1651086	0 %	25 %	50 %	25 %	99081385
33456	NC_008044	CAG	2	6	1651103	1651108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081385
33457	NC_008044	GGCG	2	8	1651210	1651217	0 %	0 %	75 %	25 %	99081385
33458	NC_008044	CCT	2	6	1651381	1651386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081385
33459	NC_008044	GCCC	2	8	1651450	1651457	0 %	0 %	25 %	75 %	99081385
33460	NC_008044	TG	3	6	1651515	1651520	0 %	50 %	50 %	0 %	99081385
33461	NC_008044	GGC	2	6	1651542	1651547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081385
33462	NC_008044	CGC	2	6	1651621	1651626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081385
33463	NC_008044	TCA	2	6	1651656	1651661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081385
33464	NC_008044	GGT	2	6	1651696	1651701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081385
33465	NC_008044	CGC	2	6	1651714	1651719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081385
33466	NC_008044	GCC	2	6	1651862	1651867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081385
33467	NC_008044	GAA	2	6	1651904	1651909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081385
33468	NC_008044	GCA	2	6	1652027	1652032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081385
33469	NC_008044	TG	3	6	1652060	1652065	0 %	50 %	50 %	0 %	99081385
33470	NC_008044	CGC	2	6	1652104	1652109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081385
33471	NC_008044	GGCG	2	8	1652239	1652246	0 %	0 %	75 %	25 %	99081385
33472	NC_008044	GCG	2	6	1652249	1652254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081385
33473	NC_008044	GC	5	10	1652330	1652339	0 %	0 %	50 %	50 %	99081385
33474	NC_008044	CGGG	2	8	1652361	1652368	0 %	0 %	75 %	25 %	99081385
33475	NC_008044	GC	4	8	1652390	1652397	0 %	0 %	50 %	50 %	99081385
33476	NC_008044	AGC	2	6	1652531	1652536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081386
33477	NC_008044	GC	3	6	1652563	1652568	0 %	0 %	50 %	50 %	99081386
33478	NC_008044	GC	3	6	1652626	1652631	0 %	0 %	50 %	50 %	99081386
33479	NC_008044	CCA	2	6	1652673	1652678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081386
33480	NC_008044	CGC	2	6	1652695	1652700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081386
33481	NC_008044	CTA	2	6	1652721	1652726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081386
33482	NC_008044	GTC	2	6	1652794	1652799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081386
33483	NC_008044	CGC	2	6	1652827	1652832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081386
33484	NC_008044	GCC	2	6	1652861	1652866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081386
33485	NC_008044	GCCC	2	8	1653006	1653013	0 %	0 %	25 %	75 %	99081386
33486	NC_008044	GCC	2	6	1653073	1653078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081386
33487	NC_008044	AGC	2	6	1653134	1653139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081386
33488	NC_008044	GCG	2	6	1653156	1653161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081386
33489	NC_008044	GCCA	2	8	1653228	1653235	25 %	0 %	25 %	50 %	99081386
33490	NC_008044	CCG	2	6	1653275	1653280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081386
33491	NC_008044	GTG	2	6	1653316	1653321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081386
33492	NC_008044	GCG	2	6	1653347	1653352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081386
33493	NC_008044	GC	3	6	1653382	1653387	0 %	0 %	50 %	50 %	99081386
33494	NC_008044	CTG	2	6	1653400	1653405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081386
33495	NC_008044	CCG	2	6	1653492	1653497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081386
33496	NC_008044	ACA	2	6	1653598	1653603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33497	NC_008044	GAC	2	6	1653645	1653650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081387
33498	NC_008044	CCG	2	6	1653702	1653707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081387
33499	NC_008044	CGA	2	6	1653740	1653745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081387
33500	NC_008044	GCG	2	6	1653751	1653756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081387

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