MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_008044	GCA	2	6	1556626	1556631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081298
31503	NC_008044	CAA	2	6	1556671	1556676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081298
31504	NC_008044	CCT	2	6	1556852	1556857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081299
31505	NC_008044	TGA	2	6	1556933	1556938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081299
31506	NC_008044	CCA	2	6	1557017	1557022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081299
31507	NC_008044	GC	3	6	1557059	1557064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31508	NC_008044	ATGAA	2	10	1557118	1557127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31509	NC_008044	GGC	2	6	1557131	1557136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31510	NC_008044	GCC	2	6	1557149	1557154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31511	NC_008044	ACC	2	6	1557190	1557195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081300
31512	NC_008044	CCGCAA	2	12	1557238	1557249	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99081300
31513	NC_008044	TCC	2	6	1557297	1557302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081300
31514	NC_008044	CTT	2	6	1557334	1557339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
31515	NC_008044	CTG	2	6	1557355	1557360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31516	NC_008044	GTC	2	6	1557375	1557380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31517	NC_008044	CAA	2	6	1557385	1557390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081300
31518	NC_008044	TCC	2	6	1557453	1557458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081300
31519	NC_008044	ACA	2	6	1557495	1557500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081300
31520	NC_008044	TCA	2	6	1557507	1557512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081300
31521	NC_008044	TGC	2	6	1557539	1557544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31522	NC_008044	GCG	2	6	1557603	1557608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081300
31523	NC_008044	GCCTCT	2	12	1557615	1557626	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	99081300
31524	NC_008044	CTT	2	6	1557647	1557652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
31525	NC_008044	CTT	3	9	1557686	1557694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
31526	NC_008044	CGGTTT	2	12	1557736	1557747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	99081300
31527	NC_008044	CGC	2	6	1557779	1557784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081300
31528	NC_008044	CTT	2	6	1557857	1557862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
31529	NC_008044	CGA	2	6	1557873	1557878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31530	NC_008044	CGCTTG	2	12	1557879	1557890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31531	NC_008044	TCC	2	6	1557945	1557950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081300
31532	NC_008044	CG	4	8	1558037	1558044	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31533	NC_008044	GC	3	6	1558124	1558129	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31534	NC_008044	TCA	2	6	1558162	1558167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081300
31535	NC_008044	CG	3	6	1558207	1558212	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31536	NC_008044	CGG	3	9	1558215	1558223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081300
31537	NC_008044	GTC	2	6	1558268	1558273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31538	NC_008044	TGT	2	6	1558316	1558321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081300
31539	NC_008044	CTT	2	6	1558433	1558438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
31540	NC_008044	CGG	2	6	1558444	1558449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081300
31541	NC_008044	GC	3	6	1558523	1558528	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31542	NC_008044	CTT	2	6	1558531	1558536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
31543	NC_008044	GCC	2	6	1558539	1558544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081300
31544	NC_008044	TCGA	2	8	1558572	1558579	25 %	25 %	25 %	25 %	99081300
31545	NC_008044	CCGG	2	8	1558595	1558602	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31546	NC_008044	CCA	2	6	1558618	1558623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081300
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31549	NC_008044	ATC	2	6	1558776	1558781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081300
31550	NC_008044	TCG	2	6	1558833	1558838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31551	NC_008044	TGA	2	6	1558873	1558878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081300
31552	NC_008044	CGG	2	6	1559002	1559007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081300
31553	NC_008044	GCC	3	9	1559105	1559113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081300
31554	NC_008044	CAGCG	2	10	1559171	1559180	20 %	0 %	40 %	40 %	99081300
31555	NC_008044	TTG	2	6	1559184	1559189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081300
31556	NC_008044	TGA	2	6	1559236	1559241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081300
31557	NC_008044	GCG	2	6	1559278	1559283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081300
31558	NC_008044	ATC	2	6	1559300	1559305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081300
31559	NC_008044	GTC	2	6	1559306	1559311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
31560	NC_008044	GTC	3	9	1559402	1559410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081300
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31571	NC_008044	GC	3	6	1559802	1559807	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31572	NC_008044	GC	3	6	1559823	1559828	0 %	0 %	50 %	50 %	99081300
31573	NC_008044	TCT	2	6	1559829	1559834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081300
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31576	NC_008044	GCCA	2	8	1559987	1559994	25 %	0 %	25 %	50 %	99081300
31577	NC_008044	GTTT	2	8	1560001	1560008	0 %	75 %	25 %	0 %	99081300
31578	NC_008044	TCCA	2	8	1560041	1560048	25 %	25 %	0 %	50 %	99081300
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31583	NC_008044	CCGGGT	2	12	1560190	1560201	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31584	NC_008044	TGT	2	6	1560211	1560216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31585	NC_008044	GTG	2	6	1560219	1560224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31586	NC_008044	CG	4	8	1560324	1560331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31587	NC_008044	TTC	2	6	1560341	1560346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31588	NC_008044	CGGA	2	8	1560487	1560494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31589	NC_008044	GAC	2	6	1560498	1560503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31590	NC_008044	GCG	2	6	1560533	1560538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31591	NC_008044	CCG	2	6	1560599	1560604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31592	NC_008044	AG	3	6	1560605	1560610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31593	NC_008044	GCG	2	6	1560666	1560671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31594	NC_008044	GGT	2	6	1560751	1560756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081301
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31596	NC_008044	CG	3	6	1560809	1560814	0 %	0 %	50 %	50 %	99081301
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31600	NC_008044	GTTT	2	8	1560960	1560967	0 %	75 %	25 %	0 %	99081301
31601	NC_008044	TCA	2	6	1560977	1560982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081301
31602	NC_008044	CCG	2	6	1560983	1560988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081301
31603	NC_008044	CAA	2	6	1561009	1561014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081301
31604	NC_008044	CGC	2	6	1561138	1561143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081301
31605	NC_008044	GCC	2	6	1561146	1561151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081301
31606	NC_008044	TGC	2	6	1561163	1561168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081301
31607	NC_008044	GAA	2	6	1561264	1561269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081301
31608	NC_008044	CG	3	6	1561270	1561275	0 %	0 %	50 %	50 %	99081301
31609	NC_008044	GC	3	6	1561305	1561310	0 %	0 %	50 %	50 %	99081301
31610	NC_008044	AGC	2	6	1561352	1561357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081301
31611	NC_008044	CCAT	2	8	1561358	1561365	25 %	25 %	0 %	50 %	99081301
31612	NC_008044	GGCA	2	8	1561453	1561460	25 %	0 %	50 %	25 %	99081302
31613	NC_008044	GAC	2	6	1561496	1561501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081302
31614	NC_008044	GGT	2	6	1561566	1561571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081302
31615	NC_008044	TCA	2	6	1561601	1561606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081302
31616	NC_008044	AG	4	8	1561607	1561614	50 %	0 %	50 %	0 %	99081302
31617	NC_008044	GCA	2	6	1561643	1561648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081302
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31619	NC_008044	CCT	2	6	1561718	1561723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081302
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31621	NC_008044	GC	3	6	1561867	1561872	0 %	0 %	50 %	50 %	99081302
31622	NC_008044	CCT	2	6	1561898	1561903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081302
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31976	NC_008044	GCA	2	6	1579576	1579581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31979	NC_008044	CAC	2	6	1579721	1579726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31980	NC_008044	GCT	2	6	1579774	1579779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31981	NC_008044	CTTG	2	8	1579797	1579804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31982	NC_008044	GCCC	2	8	1579874	1579881	0 %	0 %	25 %	75 %	99081320
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