MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_008044	CAT	2	6	1507154	1507159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30502	NC_008044	CGG	2	6	1507181	1507186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30503	NC_008044	TGC	2	6	1507257	1507262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30504	NC_008044	CGC	2	6	1507325	1507330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081255
30505	NC_008044	GTT	2	6	1507374	1507379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081255
30506	NC_008044	GC	3	6	1507555	1507560	0 %	0 %	50 %	50 %	99081255
30507	NC_008044	CGG	2	6	1507568	1507573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081255
30508	NC_008044	GGT	2	6	1507578	1507583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081255
30509	NC_008044	CGGCG	2	10	1507646	1507655	0 %	0 %	60 %	40 %	99081255
30510	NC_008044	TCA	2	6	1507754	1507759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081255
30511	NC_008044	GGT	2	6	1507788	1507793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081255
30512	NC_008044	CTT	2	6	1507892	1507897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081255
30513	NC_008044	CGG	2	6	1507917	1507922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081255
30514	NC_008044	GCT	2	6	1508012	1508017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081255
30515	NC_008044	CCG	2	6	1508087	1508092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30516	NC_008044	TCT	2	6	1508125	1508130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30517	NC_008044	CGGCAA	2	12	1508151	1508162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30518	NC_008044	TTG	2	6	1508184	1508189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081256
30519	NC_008044	CTG	2	6	1508327	1508332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081256
30520	NC_008044	CG	3	6	1508345	1508350	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30521	NC_008044	AGA	2	6	1508360	1508365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081256
30522	NC_008044	AC	3	6	1508410	1508415	50 %	0 %	0 %	50 %	99081256
30523	NC_008044	CCG	2	6	1508422	1508427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081256
30524	NC_008044	CAT	2	6	1508477	1508482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081256
30525	NC_008044	CCCG	2	8	1508546	1508553	0 %	0 %	25 %	75 %	99081256
30526	NC_008044	GC	3	6	1508558	1508563	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30527	NC_008044	CGC	2	6	1508594	1508599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081256
30528	NC_008044	CG	3	6	1508617	1508622	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30529	NC_008044	CG	4	8	1508643	1508650	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30530	NC_008044	GC	3	6	1508675	1508680	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30531	NC_008044	CGC	2	6	1508716	1508721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081256
30532	NC_008044	TGCC	2	8	1508731	1508738	0 %	25 %	25 %	50 %	99081256
30533	NC_008044	TGG	2	6	1508755	1508760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081256
30534	NC_008044	ATG	2	6	1508811	1508816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081256
30535	NC_008044	GC	3	6	1508827	1508832	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30536	NC_008044	GAG	2	6	1508835	1508840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081256
30537	NC_008044	GC	4	8	1508841	1508848	0 %	0 %	50 %	50 %	99081256
30538	NC_008044	CCT	2	6	1508878	1508883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081256
30539	NC_008044	AGCA	2	8	1508941	1508948	50 %	0 %	25 %	25 %	99081256
30540	NC_008044	CGC	2	6	1509037	1509042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081256
30541	NC_008044	CG	3	6	1509080	1509085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30542	NC_008044	CAG	2	6	1509112	1509117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30543	NC_008044	GTT	2	6	1509387	1509392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081257
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30545	NC_008044	TGG	2	6	1509662	1509667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081257
30546	NC_008044	CG	3	6	1509723	1509728	0 %	0 %	50 %	50 %	99081257
30547	NC_008044	CCG	2	6	1509863	1509868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081257
30548	NC_008044	GCT	2	6	1509873	1509878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081257
30549	NC_008044	CGCGG	2	10	1509897	1509906	0 %	0 %	60 %	40 %	99081257
30550	NC_008044	CCT	2	6	1509909	1509914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081257
30551	NC_008044	GCC	2	6	1509970	1509975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081257
30552	NC_008044	TTA	2	6	1509989	1509994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081257
30553	NC_008044	GCA	2	6	1510007	1510012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081257
30554	NC_008044	AAG	2	6	1510030	1510035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081257
30555	NC_008044	ATG	2	6	1510243	1510248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30556	NC_008044	CCG	2	6	1510278	1510283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30557	NC_008044	CGC	2	6	1510298	1510303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30558	NC_008044	ACG	2	6	1510307	1510312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30559	NC_008044	AT	3	6	1510330	1510335	50 %	50 %	0 %	0 %	99081258
30560	NC_008044	ACC	3	9	1510337	1510345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081258
30561	NC_008044	CGA	2	6	1510359	1510364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081258
30562	NC_008044	CAT	2	6	1510367	1510372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081258
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30564	NC_008044	ATGC	2	8	1510385	1510392	25 %	25 %	25 %	25 %	99081258
30565	NC_008044	CGC	2	6	1510421	1510426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081258
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30571	NC_008044	ACA	2	6	1510641	1510646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081258
30572	NC_008044	ACG	2	6	1510647	1510652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081258
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30574	NC_008044	CGA	2	6	1510750	1510755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081258
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30579	NC_008044	CAT	2	6	1510939	1510944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081258
30580	NC_008044	GAT	2	6	1510997	1511002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081258
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30585	NC_008044	ATG	2	6	1511382	1511387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081258
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30588	NC_008044	CG	3	6	1511504	1511509	0 %	0 %	50 %	50 %	99081258
30589	NC_008044	GAA	2	6	1511516	1511521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081258
30590	NC_008044	ATG	2	6	1511528	1511533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081258
30591	NC_008044	CGA	2	6	1511560	1511565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081258
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30593	NC_008044	TGC	2	6	1511640	1511645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081258
30594	NC_008044	ACC	2	6	1511703	1511708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081258
30595	NC_008044	CG	3	6	1511833	1511838	0 %	0 %	50 %	50 %	99081258
30596	NC_008044	GTC	2	6	1511846	1511851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081258
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30598	NC_008044	GGGCT	2	10	1511986	1511995	0 %	20 %	60 %	20 %	99081258
30599	NC_008044	CAC	2	6	1512071	1512076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30600	NC_008044	GAC	2	6	1512113	1512118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30601	NC_008044	TGA	2	6	1512201	1512206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081259
30602	NC_008044	TGA	2	6	1512243	1512248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081259
30603	NC_008044	GCAGC	2	10	1512400	1512409	20 %	0 %	40 %	40 %	99081259
30604	NC_008044	GAA	2	6	1512458	1512463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081259
30605	NC_008044	CG	3	6	1512475	1512480	0 %	0 %	50 %	50 %	99081259
30606	NC_008044	ATC	2	6	1512545	1512550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081259
30607	NC_008044	TGA	2	6	1512579	1512584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081259
30608	NC_008044	GAC	2	6	1512691	1512696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081259
30609	NC_008044	CCT	2	6	1512744	1512749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081259
30610	NC_008044	TTC	2	6	1512818	1512823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081259
30611	NC_008044	TGA	2	6	1512897	1512902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081259
30612	NC_008044	TGC	2	6	1513008	1513013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081259
30613	NC_008044	GTT	2	6	1513024	1513029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081259
30614	NC_008044	GGC	2	6	1513093	1513098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081259
30615	NC_008044	CAA	2	6	1513102	1513107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081259
30616	NC_008044	CTG	2	6	1513121	1513126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081259
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30976	NC_008044	CTG	2	6	1530618	1530623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081274
30977	NC_008044	GCG	2	6	1530699	1530704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081274
30978	NC_008044	GC	3	6	1530780	1530785	0 %	0 %	50 %	50 %	99081274
30979	NC_008044	AGG	2	6	1530801	1530806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081274
30980	NC_008044	GC	3	6	1530831	1530836	0 %	0 %	50 %	50 %	99081274
30981	NC_008044	GC	5	10	1530880	1530889	0 %	0 %	50 %	50 %	99081274
30982	NC_008044	GCA	2	6	1530910	1530915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081275
30983	NC_008044	CCTT	2	8	1530972	1530979	0 %	50 %	0 %	50 %	99081275
30984	NC_008044	AG	3	6	1531085	1531090	50 %	0 %	50 %	0 %	99081275
30985	NC_008044	CCA	2	6	1531186	1531191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081275
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30987	NC_008044	CAT	2	6	1531262	1531267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081275
30988	NC_008044	CG	3	6	1531450	1531455	0 %	0 %	50 %	50 %	99081275
30989	NC_008044	GGC	2	6	1531505	1531510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081275
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30991	NC_008044	TCTTT	2	10	1531587	1531596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30992	NC_008044	GGA	2	6	1531734	1531739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30997	NC_008044	CG	4	8	1531972	1531979	0 %	0 %	50 %	50 %	99081276
30998	NC_008044	CG	3	6	1532034	1532039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30999	NC_008044	GA	3	6	1532125	1532130	50 %	0 %	50 %	0 %	99081277
31000	NC_008044	CAT	2	6	1532163	1532168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081277

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