MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_008044	ATCGT	2	10	1481524	1481533	20 %	40 %	20 %	20 %	99081227
30002	NC_008044	AGAC	2	8	1481695	1481702	50 %	0 %	25 %	25 %	99081228
30003	NC_008044	GAT	2	6	1481766	1481771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081228
30004	NC_008044	AGC	2	6	1481778	1481783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081228
30005	NC_008044	GGTC	2	8	1481813	1481820	0 %	25 %	50 %	25 %	99081228
30006	NC_008044	CGC	2	6	1481833	1481838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081228
30007	NC_008044	GCC	2	6	1481846	1481851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081228
30008	NC_008044	TCA	2	6	1481859	1481864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081228
30009	NC_008044	T	6	6	1481982	1481987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30010	NC_008044	G	7	7	1482111	1482117	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30011	NC_008044	CCGC	2	8	1482230	1482237	0 %	0 %	25 %	75 %	99081229
30012	NC_008044	GGA	2	6	1482282	1482287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081229
30013	NC_008044	ATC	2	6	1482334	1482339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081229
30014	NC_008044	TGA	2	6	1482344	1482349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081229
30015	NC_008044	GCG	2	6	1482413	1482418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081229
30016	NC_008044	CTG	2	6	1482424	1482429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081229
30017	NC_008044	GT	3	6	1482461	1482466	0 %	50 %	50 %	0 %	99081229
30018	NC_008044	TG	3	6	1482548	1482553	0 %	50 %	50 %	0 %	99081229
30019	NC_008044	GCC	2	6	1482592	1482597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081229
30020	NC_008044	TGC	2	6	1482629	1482634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081229
30021	NC_008044	GCG	2	6	1482635	1482640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081229
30022	NC_008044	TCG	2	6	1482647	1482652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081229
30023	NC_008044	GCA	2	6	1482664	1482669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081229
30024	NC_008044	TAT	2	6	1482741	1482746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99081230
30025	NC_008044	ACC	2	6	1482831	1482836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081230
30026	NC_008044	GCC	2	6	1482897	1482902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081230
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30029	NC_008044	GC	3	6	1482942	1482947	0 %	0 %	50 %	50 %	99081230
30030	NC_008044	TGG	2	6	1482985	1482990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081230
30031	NC_008044	TCA	2	6	1483129	1483134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081230
30032	NC_008044	TCGAC	2	10	1483138	1483147	20 %	20 %	20 %	40 %	99081230
30033	NC_008044	CAT	2	6	1483226	1483231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081230
30034	NC_008044	CGA	2	6	1483330	1483335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081230
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30036	NC_008044	ACT	2	6	1483453	1483458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081230
30037	NC_008044	GGC	2	6	1483478	1483483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081230
30038	NC_008044	CTTA	2	8	1483529	1483536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30039	NC_008044	CGG	2	6	1483590	1483595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081231
30040	NC_008044	GC	3	6	1483617	1483622	0 %	0 %	50 %	50 %	99081231
30041	NC_008044	AAC	2	6	1483648	1483653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081231
30042	NC_008044	CGAG	2	8	1483745	1483752	25 %	0 %	50 %	25 %	99081231
30043	NC_008044	AGCG	2	8	1483821	1483828	25 %	0 %	50 %	25 %	99081231
30044	NC_008044	TCC	2	6	1483854	1483859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081231
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30046	NC_008044	AAG	2	6	1484198	1484203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30047	NC_008044	CCT	2	6	1484273	1484278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30048	NC_008044	TC	3	6	1484285	1484290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30049	NC_008044	AAT	2	6	1484324	1484329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_008044	GC	3	6	1484349	1484354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30051	NC_008044	ACG	2	6	1484355	1484360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30052	NC_008044	GCC	2	6	1484376	1484381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30053	NC_008044	TCG	2	6	1484419	1484424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081232
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30055	NC_008044	GCC	2	6	1484448	1484453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081232
30056	NC_008044	GGC	2	6	1484459	1484464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081232
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30060	NC_008044	ACC	2	6	1484643	1484648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081232
30061	NC_008044	GTG	2	6	1485204	1485209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081232
30062	NC_008044	GC	3	6	1485280	1485285	0 %	0 %	50 %	50 %	99081232
30063	NC_008044	GAT	2	6	1485302	1485307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081232
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30065	NC_008044	GCT	2	6	1485380	1485385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081232
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30071	NC_008044	CGT	2	6	1485660	1485665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081232
30072	NC_008044	TGGCA	2	10	1485709	1485718	20 %	20 %	40 %	20 %	99081232
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30076	NC_008044	CTG	2	6	1486224	1486229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081233
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30078	NC_008044	GC	3	6	1486475	1486480	0 %	0 %	50 %	50 %	99081234
30079	NC_008044	CAG	2	6	1486481	1486486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081234
30080	NC_008044	CTG	2	6	1486499	1486504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081234
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30082	NC_008044	CCGCG	2	10	1486633	1486642	0 %	0 %	40 %	60 %	99081234
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30104	NC_008044	GCC	2	6	1487929	1487934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081236
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30107	NC_008044	CCG	2	6	1488186	1488191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30108	NC_008044	GGC	3	9	1488207	1488215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30109	NC_008044	CG	3	6	1488223	1488228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30110	NC_008044	AGA	2	6	1488343	1488348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081237
30111	NC_008044	GCA	2	6	1488455	1488460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081237
30112	NC_008044	CCT	2	6	1488514	1488519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081237
30113	NC_008044	TCTG	2	8	1488525	1488532	0 %	50 %	25 %	25 %	99081237
30114	NC_008044	TTG	2	6	1488547	1488552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30115	NC_008044	CAA	2	6	1488692	1488697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081238
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30117	NC_008044	GC	3	6	1488717	1488722	0 %	0 %	50 %	50 %	99081238
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30119	NC_008044	GA	3	6	1488735	1488740	50 %	0 %	50 %	0 %	99081238
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30231	NC_008044	TGT	2	6	1493889	1493894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30232	NC_008044	TGC	2	6	1493914	1493919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30233	NC_008044	T	6	6	1493954	1493959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30234	NC_008044	CA	3	6	1493965	1493970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30235	NC_008044	CGG	2	6	1493979	1493984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30236	NC_008044	CGG	2	6	1494055	1494060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081241
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30238	NC_008044	AATC	2	8	1494122	1494129	50 %	25 %	0 %	25 %	99081241
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30358	NC_008044	CGAT	2	8	1499971	1499978	25 %	25 %	25 %	25 %	99081248
30359	NC_008044	AGCC	2	8	1500001	1500008	25 %	0 %	25 %	50 %	99081248
30360	NC_008044	GC	3	6	1500031	1500036	0 %	0 %	50 %	50 %	99081248
30361	NC_008044	TGG	2	6	1500083	1500088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081248
30362	NC_008044	CCA	2	6	1500109	1500114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081248
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30364	NC_008044	TTG	2	6	1500271	1500276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081248
30365	NC_008044	GATG	2	8	1500360	1500367	25 %	25 %	50 %	0 %	99081248
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30368	NC_008044	T	7	7	1500553	1500559	0 %	100 %	0 %	0 %	99081248
30369	NC_008044	CGT	2	6	1500587	1500592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081248
30370	NC_008044	ACC	2	6	1500606	1500611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081248
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30372	NC_008044	CAA	2	6	1500653	1500658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081248
30373	NC_008044	TGC	2	6	1500674	1500679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081248
30374	NC_008044	GAA	2	6	1500708	1500713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081248
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30376	NC_008044	AATC	2	8	1500938	1500945	50 %	25 %	0 %	25 %	99081248
30377	NC_008044	GCG	2	6	1500998	1501003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081248
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30381	NC_008044	CG	3	6	1501335	1501340	0 %	0 %	50 %	50 %	99081248
30382	NC_008044	GCG	2	6	1501422	1501427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081248
30383	NC_008044	GAT	2	6	1501428	1501433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081248
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30388	NC_008044	CGT	2	6	1501562	1501567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081248
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30390	NC_008044	TGG	2	6	1501607	1501612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081248
30391	NC_008044	CCA	2	6	1501619	1501624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081248
30392	NC_008044	TGA	2	6	1501628	1501633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081248
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30399	NC_008044	ATT	2	6	1501983	1501988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30400	NC_008044	AGC	2	6	1501991	1501996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30401	NC_008044	AGC	2	6	1502045	1502050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30402	NC_008044	GCT	2	6	1502063	1502068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30403	NC_008044	GCC	2	6	1502287	1502292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30404	NC_008044	TCAC	2	8	1502297	1502304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30405	NC_008044	CAG	2	6	1502395	1502400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081250
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30409	NC_008044	AG	3	6	1502670	1502675	50 %	0 %	50 %	0 %	99081250
30410	NC_008044	CGG	2	6	1502768	1502773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081250
30411	NC_008044	CG	3	6	1502792	1502797	0 %	0 %	50 %	50 %	99081250
30412	NC_008044	CGATCC	2	12	1502822	1502833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99081250
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30448	NC_008044	CCCGC	2	10	1504941	1504950	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
30449	NC_008044	GAT	2	6	1504979	1504984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081252
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30452	NC_008044	CTG	2	6	1505206	1505211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081252
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30465	NC_008044	TGG	2	6	1505772	1505777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081253
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30467	NC_008044	GC	3	6	1505818	1505823	0 %	0 %	50 %	50 %	99081253
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30470	NC_008044	GCA	2	6	1505952	1505957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081253
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30472	NC_008044	GCC	2	6	1506012	1506017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081253
30473	NC_008044	CCCG	2	8	1506066	1506073	0 %	0 %	25 %	75 %	99081253
30474	NC_008044	GGTGA	2	10	1506091	1506100	20 %	20 %	60 %	0 %	99081253
30475	NC_008044	TCGAGC	2	12	1506122	1506133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99081253
30476	NC_008044	CATC	2	8	1506135	1506142	25 %	25 %	0 %	50 %	99081253
30477	NC_008044	AACG	2	8	1506186	1506193	50 %	0 %	25 %	25 %	99081253
30478	NC_008044	GCC	2	6	1506206	1506211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081253
30479	NC_008044	TCA	2	6	1506252	1506257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081253
30480	NC_008044	CGACCT	2	12	1506264	1506275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99081253
30481	NC_008044	CCA	2	6	1506348	1506353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081253
30482	NC_008044	CGCGC	2	10	1506363	1506372	0 %	0 %	40 %	60 %	99081253
30483	NC_008044	ATG	2	6	1506379	1506384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081253
30484	NC_008044	GCC	2	6	1506399	1506404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081253
30485	NC_008044	CG	3	6	1506405	1506410	0 %	0 %	50 %	50 %	99081253
30486	NC_008044	CCAT	2	8	1506431	1506438	25 %	25 %	0 %	50 %	99081253
30487	NC_008044	GAT	2	6	1506439	1506444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081253
30488	NC_008044	GCTT	2	8	1506563	1506570	0 %	50 %	25 %	25 %	99081254
30489	NC_008044	CAGCG	2	10	1506577	1506586	20 %	0 %	40 %	40 %	99081254
30490	NC_008044	ATC	2	6	1506599	1506604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081254
30491	NC_008044	GTC	2	6	1506646	1506651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081254
30492	NC_008044	GGCTTT	2	12	1506667	1506678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	99081254
30493	NC_008044	TGATC	2	10	1506681	1506690	20 %	40 %	20 %	20 %	99081254
30494	NC_008044	CGG	2	6	1506767	1506772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081254
30495	NC_008044	GCA	2	6	1506798	1506803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081254
30496	NC_008044	TGA	2	6	1506804	1506809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081254
30497	NC_008044	CCA	2	6	1506972	1506977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081254
30498	NC_008044	GCG	2	6	1507063	1507068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081254
30499	NC_008044	ATC	2	6	1507075	1507080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081254
30500	NC_008044	CTTG	2	8	1507119	1507126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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