MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_008044	ATG	2	6	1404150	1404155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081157
28503	NC_008044	TAC	2	6	1404212	1404217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081157
28504	NC_008044	CGC	2	6	1404220	1404225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081157
28505	NC_008044	GGT	2	6	1404277	1404282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081157
28506	NC_008044	GCG	2	6	1404392	1404397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081157
28507	NC_008044	CCT	2	6	1404430	1404435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081158
28508	NC_008044	TGACGG	2	12	1404445	1404456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99081158
28509	NC_008044	GCCC	2	8	1404474	1404481	0 %	0 %	25 %	75 %	99081158
28510	NC_008044	CT	3	6	1404516	1404521	0 %	50 %	0 %	50 %	99081158
28511	NC_008044	AGG	2	6	1404662	1404667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081158
28512	NC_008044	CAG	2	6	1404668	1404673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081158
28513	NC_008044	GAC	2	6	1404689	1404694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081158
28514	NC_008044	TTCAC	2	10	1404738	1404747	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28515	NC_008044	AG	3	6	1404755	1404760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28516	NC_008044	GCTT	2	8	1404790	1404797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28517	NC_008044	CAT	2	6	1404835	1404840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28519	NC_008044	CGC	2	6	1405187	1405192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081160
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28521	NC_008044	GGTC	2	8	1405231	1405238	0 %	25 %	50 %	25 %	99081160
28522	NC_008044	TGGC	3	12	1405260	1405271	0 %	25 %	50 %	25 %	99081160
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28525	NC_008044	GAC	2	6	1405368	1405373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081160
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28530	NC_008044	TGC	2	6	1405655	1405660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28531	NC_008044	CAG	2	6	1405674	1405679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28532	NC_008044	TTTA	2	8	1405731	1405738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28533	NC_008044	CAA	2	6	1405779	1405784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28534	NC_008044	ACC	2	6	1405845	1405850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081161
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28536	NC_008044	GTTGAG	2	12	1406151	1406162	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	99081161
28537	NC_008044	TTG	2	6	1406199	1406204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081161
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28539	NC_008044	GGGT	2	8	1406286	1406293	0 %	25 %	75 %	0 %	99081161
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28544	NC_008044	TGC	2	6	1406542	1406547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28545	NC_008044	GAG	2	6	1406641	1406646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28546	NC_008044	GCG	2	6	1406760	1406765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28547	NC_008044	ACC	2	6	1406949	1406954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081162
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28555	NC_008044	CCG	2	6	1407327	1407332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081162
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28602	NC_008044	GCCA	2	8	1409745	1409752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28603	NC_008044	GCC	2	6	1409778	1409783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28604	NC_008044	GTTA	2	8	1409790	1409797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28605	NC_008044	TGA	2	6	1409802	1409807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28864	NC_008044	AAG	2	6	1423168	1423173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081176
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28979	NC_008044	CAT	2	6	1428527	1428532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081182
28980	NC_008044	CTT	2	6	1428569	1428574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081182
28981	NC_008044	CG	3	6	1428615	1428620	0 %	0 %	50 %	50 %	99081182
28982	NC_008044	GCA	2	6	1428629	1428634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081182
28983	NC_008044	CAA	2	6	1428725	1428730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081182
28984	NC_008044	GTC	2	6	1428735	1428740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081182
28985	NC_008044	GTC	2	6	1428747	1428752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081182
28986	NC_008044	GCC	2	6	1428789	1428794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081182
28987	NC_008044	GCAG	2	8	1428860	1428867	25 %	0 %	50 %	25 %	99081182
28988	NC_008044	GTCGAA	2	12	1428984	1428995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99081182
28989	NC_008044	GC	3	6	1429103	1429108	0 %	0 %	50 %	50 %	99081182
28990	NC_008044	GCG	2	6	1429120	1429125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081182
28991	NC_008044	C	6	6	1429328	1429333	0 %	0 %	0 %	100 %	99081182
28992	NC_008044	GCC	3	9	1429353	1429361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081182
28993	NC_008044	GC	3	6	1429445	1429450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28994	NC_008044	CG	3	6	1429471	1429476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28995	NC_008044	GCC	2	6	1429501	1429506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081183
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28999	NC_008044	TGT	2	6	1429653	1429658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081183
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