MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_008044	GCTC	2	8	1328529	1328536	0 %	25 %	25 %	50 %	99081073
27003	NC_008044	CGC	2	6	1328539	1328544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081073
27004	NC_008044	CAA	2	6	1328572	1328577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081073
27005	NC_008044	CAT	2	6	1328659	1328664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081073
27006	NC_008044	GAT	2	6	1328672	1328677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081073
27007	NC_008044	GC	3	6	1328749	1328754	0 %	0 %	50 %	50 %	99081073
27008	NC_008044	GCG	2	6	1328802	1328807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081073
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27011	NC_008044	GCG	3	9	1329072	1329080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081073
27012	NC_008044	CGG	2	6	1329109	1329114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081073
27013	NC_008044	CTG	2	6	1329212	1329217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081073
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27015	NC_008044	GAT	2	6	1329263	1329268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081073
27016	NC_008044	CTG	2	6	1329285	1329290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081073
27017	NC_008044	GGC	2	6	1329304	1329309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081073
27018	NC_008044	GGC	2	6	1329323	1329328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081073
27019	NC_008044	GGT	2	6	1329338	1329343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081073
27020	NC_008044	GCG	2	6	1329363	1329368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081073
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27026	NC_008044	GA	3	6	1329811	1329816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27027	NC_008044	GAG	2	6	1329832	1329837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27028	NC_008044	CAT	2	6	1329840	1329845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081075
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27031	NC_008044	ACCC	2	8	1330024	1330031	25 %	0 %	0 %	75 %	99081075
27032	NC_008044	TCCGA	2	10	1330039	1330048	20 %	20 %	20 %	40 %	99081075
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27035	NC_008044	GC	3	6	1330335	1330340	0 %	0 %	50 %	50 %	99081075
27036	NC_008044	AG	3	6	1330366	1330371	50 %	0 %	50 %	0 %	99081075
27037	NC_008044	CA	3	6	1330378	1330383	50 %	0 %	0 %	50 %	99081075
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27039	NC_008044	CT	3	6	1330424	1330429	0 %	50 %	0 %	50 %	99081075
27040	NC_008044	CAG	2	6	1330473	1330478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081075
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27059	NC_008044	GATC	2	8	1331708	1331715	25 %	25 %	25 %	25 %	99081076
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27087	NC_008044	GC	3	6	1333086	1333091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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27221	NC_008044	GC	4	8	1340031	1340038	0 %	0 %	50 %	50 %	99081086
27222	NC_008044	CGG	2	6	1340100	1340105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081086
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27233	NC_008044	CGC	2	6	1340501	1340506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081087
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27235	NC_008044	TGA	2	6	1340699	1340704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081087
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27238	NC_008044	GCGCC	2	10	1341092	1341101	0 %	0 %	40 %	60 %	99081087
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27256	NC_008044	CGG	2	6	1341678	1341683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081087
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27474	NC_008044	ATC	2	6	1352452	1352457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081096
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27477	NC_008044	CAG	2	6	1352626	1352631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081096
27478	NC_008044	CCG	2	6	1352636	1352641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081096
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27497	NC_008044	CT	3	6	1353749	1353754	0 %	50 %	0 %	50 %	99081097
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27499	NC_008044	GCTG	2	8	1353891	1353898	0 %	25 %	50 %	25 %	99081097
27500	NC_008044	CAAT	2	8	1353942	1353949	50 %	25 %	0 %	25 %	99081097

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