MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_008044	TGC	2	6	1279771	1279776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081030
26003	NC_008044	CAC	2	6	1279781	1279786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081030
26004	NC_008044	GCC	3	9	1279827	1279835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081030
26005	NC_008044	AAG	2	6	1279854	1279859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99081030
26006	NC_008044	GTG	2	6	1279860	1279865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081030
26007	NC_008044	ACG	2	6	1279875	1279880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081030
26008	NC_008044	ATC	2	6	1279911	1279916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081030
26009	NC_008044	GC	3	6	1279923	1279928	0 %	0 %	50 %	50 %	99081030
26010	NC_008044	CGC	2	6	1279979	1279984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081030
26011	NC_008044	CGG	2	6	1279994	1279999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081030
26012	NC_008044	CGG	2	6	1280012	1280017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081030
26013	NC_008044	TGT	2	6	1280056	1280061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081030
26014	NC_008044	GGT	2	6	1280063	1280068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081030
26015	NC_008044	GTC	2	6	1280069	1280074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081030
26016	NC_008044	TCGC	2	8	1280076	1280083	0 %	25 %	25 %	50 %	99081030
26017	NC_008044	CAT	2	6	1280114	1280119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081030
26018	NC_008044	GGC	2	6	1280138	1280143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081030
26019	NC_008044	CAA	2	6	1280165	1280170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99081030
26020	NC_008044	TC	3	6	1280327	1280332	0 %	50 %	0 %	50 %	99081031
26021	NC_008044	AGATCG	2	12	1280357	1280368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99081031
26022	NC_008044	GAG	2	6	1280398	1280403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081031
26023	NC_008044	GCA	2	6	1280478	1280483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081031
26024	NC_008044	GCGATG	2	12	1280525	1280536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99081031
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26028	NC_008044	TGC	3	9	1280708	1280716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081031
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26030	NC_008044	CAGC	2	8	1280839	1280846	25 %	0 %	25 %	50 %	99081031
26031	NC_008044	CGG	2	6	1281041	1281046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081031
26032	NC_008044	GGC	2	6	1281072	1281077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081031
26033	NC_008044	GCTC	2	8	1281098	1281105	0 %	25 %	25 %	50 %	99081031
26034	NC_008044	TGC	2	6	1281134	1281139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081031
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26037	NC_008044	CGC	2	6	1281283	1281288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081032
26038	NC_008044	CGCC	2	8	1281333	1281340	0 %	0 %	25 %	75 %	99081032
26039	NC_008044	GAG	2	6	1281359	1281364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081032
26040	NC_008044	TCG	2	6	1281366	1281371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081032
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26042	NC_008044	CTT	2	6	1281454	1281459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081032
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26045	NC_008044	ATC	2	6	1281506	1281511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081032
26046	NC_008044	ACG	2	6	1281587	1281592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081032
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26051	NC_008044	CTCG	2	8	1281811	1281818	0 %	25 %	25 %	50 %	99081032
26052	NC_008044	CGA	2	6	1281868	1281873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081032
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26055	NC_008044	GCA	2	6	1282003	1282008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081032
26056	NC_008044	GC	3	6	1282037	1282042	0 %	0 %	50 %	50 %	99081032
26057	NC_008044	CTG	2	6	1282079	1282084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081032
26058	NC_008044	GCC	2	6	1282121	1282126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081032
26059	NC_008044	CCA	2	6	1282173	1282178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26060	NC_008044	CGA	2	6	1282200	1282205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26061	NC_008044	CGT	2	6	1282285	1282290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081033
26062	NC_008044	TTC	2	6	1282356	1282361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081033
26063	NC_008044	GCG	2	6	1282397	1282402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081033
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26082	NC_008044	CGGG	2	8	1283101	1283108	0 %	0 %	75 %	25 %	99081033
26083	NC_008044	GC	3	6	1283168	1283173	0 %	0 %	50 %	50 %	99081033
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26086	NC_008044	CG	3	6	1283334	1283339	0 %	0 %	50 %	50 %	99081033
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26101	NC_008044	GCC	2	6	1284134	1284139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99081034
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26105	NC_008044	CGG	3	9	1284272	1284280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081034
26106	NC_008044	TGG	2	6	1284281	1284286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99081034
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26109	NC_008044	TGA	2	6	1284386	1284391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081034
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26112	NC_008044	CAT	2	6	1284501	1284506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081034
26113	NC_008044	CGA	2	6	1284522	1284527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081034
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26116	NC_008044	GC	3	6	1284559	1284564	0 %	0 %	50 %	50 %	99081034
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26118	NC_008044	GC	3	6	1284603	1284608	0 %	0 %	50 %	50 %	99081034
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26235	NC_008044	TTGACT	2	12	1290806	1290817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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26237	NC_008044	GC	3	6	1290895	1290900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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26354	NC_008044	GCG	2	6	1296348	1296353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26355	NC_008044	TCT	2	6	1296395	1296400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081047
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26478	NC_008044	TCG	2	6	1301369	1301374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99081053
26479	NC_008044	CCCA	2	8	1301425	1301432	25 %	0 %	0 %	75 %	99081053
26480	NC_008044	GCA	2	6	1301435	1301440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99081053
26481	NC_008044	TCA	2	6	1301519	1301524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081053
26482	NC_008044	CG	4	8	1301583	1301590	0 %	0 %	50 %	50 %	99081053
26483	NC_008044	GATT	2	8	1301668	1301675	25 %	50 %	25 %	0 %	99081053
26484	NC_008044	TGGT	2	8	1301839	1301846	0 %	50 %	50 %	0 %	99081053
26485	NC_008044	ATC	2	6	1301859	1301864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99081053
26486	NC_008044	TTG	2	6	1301940	1301945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081053
26487	NC_008044	GC	4	8	1301951	1301958	0 %	0 %	50 %	50 %	99081053
26488	NC_008044	CTC	2	6	1301964	1301969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99081053
26489	NC_008044	GTT	2	6	1301990	1301995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99081053
26490	NC_008044	GCG	2	6	1302079	1302084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99081054
26491	NC_008044	CG	3	6	1302178	1302183	0 %	0 %	50 %	50 %	99081054
26492	NC_008044	TG	3	6	1302266	1302271	0 %	50 %	50 %	0 %	99081054
26493	NC_008044	GGA	2	6	1302408	1302413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99081054
26494	NC_008044	TCT	2	6	1302416	1302421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99081054
26495	NC_008044	TGA	2	6	1302424	1302429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99081054
26496	NC_008044	CCA	2	6	1302452	1302457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99081054
26497	NC_008044	GC	3	6	1302486	1302491	0 %	0 %	50 %	50 %	99081054
26498	NC_008044	CCTC	2	8	1302524	1302531	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26499	NC_008044	TGG	2	6	1302546	1302551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26500	NC_008044	GAATTT	2	12	1302581	1302592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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