MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_008044	GCCC	2	8	1180812	1180819	0 %	0 %	25 %	75 %	99080940
24003	NC_008044	CAT	2	6	1180828	1180833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080940
24004	NC_008044	TGT	2	6	1180859	1180864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080940
24005	NC_008044	CCAGCA	2	12	1180935	1180946	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99080940
24006	NC_008044	AAG	2	6	1180954	1180959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080940
24007	NC_008044	GCG	2	6	1180970	1180975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080940
24008	NC_008044	TGC	2	6	1180993	1180998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080940
24009	NC_008044	TCA	2	6	1181010	1181015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080940
24010	NC_008044	AGGGA	2	10	1181060	1181069	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24011	NC_008044	TGC	2	6	1181281	1181286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080941
24012	NC_008044	TGC	3	9	1181302	1181310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080941
24013	NC_008044	GCT	2	6	1181330	1181335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080941
24014	NC_008044	GCG	2	6	1181340	1181345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080941
24015	NC_008044	GCCT	2	8	1181354	1181361	0 %	25 %	25 %	50 %	99080941
24016	NC_008044	GGA	2	6	1181378	1181383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080941
24017	NC_008044	GCGG	2	8	1181402	1181409	0 %	0 %	75 %	25 %	99080941
24018	NC_008044	GCG	2	6	1181481	1181486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080941
24019	NC_008044	CTG	2	6	1181541	1181546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080941
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24023	NC_008044	GC	3	6	1181761	1181766	0 %	0 %	50 %	50 %	99080941
24024	NC_008044	T	7	7	1181778	1181784	0 %	100 %	0 %	0 %	99080941
24025	NC_008044	GGA	2	6	1181810	1181815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080941
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24033	NC_008044	GAG	2	6	1182171	1182176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080942
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24039	NC_008044	CCGC	2	8	1182384	1182391	0 %	0 %	25 %	75 %	99080942
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24047	NC_008044	GCCT	2	8	1182704	1182711	0 %	25 %	25 %	50 %	99080942
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24052	NC_008044	GC	3	6	1182901	1182906	0 %	0 %	50 %	50 %	99080943
24053	NC_008044	ATC	2	6	1183009	1183014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080943
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24063	NC_008044	GGT	2	6	1183323	1183328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080943
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24073	NC_008044	GC	3	6	1183783	1183788	0 %	0 %	50 %	50 %	99080943
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24100	NC_008044	ACT	2	6	1185201	1185206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24101	NC_008044	CCT	2	6	1185220	1185225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24102	NC_008044	ATAGG	2	10	1185233	1185242	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24103	NC_008044	AAG	2	6	1185326	1185331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080945
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24105	NC_008044	ATGAA	2	10	1185396	1185405	60 %	20 %	20 %	0 %	99080945
24106	NC_008044	GCA	2	6	1185417	1185422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080945
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24109	NC_008044	GAT	2	6	1185781	1185786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080945
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24111	NC_008044	GAT	2	6	1185815	1185820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080945
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24114	NC_008044	GAT	2	6	1185902	1185907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080945
24115	NC_008044	GCG	2	6	1185908	1185913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080945
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24117	NC_008044	CCA	2	6	1186050	1186055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080945
24118	NC_008044	G	7	7	1186066	1186072	0 %	0 %	100 %	0 %	99080945
24119	NC_008044	CTG	2	6	1186073	1186078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080945
24120	NC_008044	GC	4	8	1186153	1186160	0 %	0 %	50 %	50 %	99080945
24121	NC_008044	GGC	2	6	1186278	1186283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080945
24122	NC_008044	TGG	2	6	1186371	1186376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080945
24123	NC_008044	GCCA	2	8	1186499	1186506	25 %	0 %	25 %	50 %	99080945
24124	NC_008044	TCC	2	6	1186535	1186540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080945
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24128	NC_008044	CCT	2	6	1186591	1186596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080945
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24131	NC_008044	CG	3	6	1186677	1186682	0 %	0 %	50 %	50 %	99080945
24132	NC_008044	GC	3	6	1186694	1186699	0 %	0 %	50 %	50 %	99080945
24133	NC_008044	ATC	2	6	1186700	1186705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080945
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24136	NC_008044	TCAACG	2	12	1186776	1186787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99080945
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24138	NC_008044	GGGC	2	8	1186815	1186822	0 %	0 %	75 %	25 %	99080945
24139	NC_008044	CGC	2	6	1186855	1186860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080945
24140	NC_008044	GCA	2	6	1186872	1186877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080945
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24143	NC_008044	GGC	2	6	1186993	1186998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080945
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24146	NC_008044	GGCG	2	8	1187229	1187236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24147	NC_008044	AGA	2	6	1187319	1187324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080946
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24149	NC_008044	GC	3	6	1187393	1187398	0 %	0 %	50 %	50 %	99080946
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24154	NC_008044	CGC	2	6	1187588	1187593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080946
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24156	NC_008044	GCT	3	9	1187672	1187680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080946
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24161	NC_008044	CAA	2	6	1187997	1188002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24162	NC_008044	A	6	6	1188001	1188006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24163	NC_008044	GCC	2	6	1188008	1188013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24187	NC_008044	CAGG	2	8	1189264	1189271	25 %	0 %	50 %	25 %	99080947
24188	NC_008044	TGA	2	6	1189324	1189329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080947
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24191	NC_008044	CGG	2	6	1189399	1189404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080947
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24195	NC_008044	CGC	2	6	1189578	1189583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24198	NC_008044	GGA	2	6	1189693	1189698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24199	NC_008044	CG	3	6	1189749	1189754	0 %	0 %	50 %	50 %	99080948
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24202	NC_008044	GCGGG	2	10	1189774	1189783	0 %	0 %	80 %	20 %	99080948
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24211	NC_008044	GCT	2	6	1190166	1190171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080948
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24214	NC_008044	GTG	2	6	1190413	1190418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080948
24215	NC_008044	GAAG	2	8	1190463	1190470	50 %	0 %	50 %	0 %	99080948
24216	NC_008044	CAGCG	2	10	1190518	1190527	20 %	0 %	40 %	40 %	99080948
24217	NC_008044	CGG	2	6	1190558	1190563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080948
24218	NC_008044	CTTGA	2	10	1190595	1190604	20 %	40 %	20 %	20 %	99080948
24219	NC_008044	GAAA	2	8	1190634	1190641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24220	NC_008044	GGC	3	9	1190734	1190742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080949
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24222	NC_008044	GC	3	6	1190991	1190996	0 %	0 %	50 %	50 %	99080949
24223	NC_008044	TGG	2	6	1190997	1191002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080949
24224	NC_008044	ATC	2	6	1191005	1191010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080949
24225	NC_008044	GCG	3	9	1191113	1191121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24226	NC_008044	GCAG	2	8	1191203	1191210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24227	NC_008044	CGG	2	6	1191283	1191288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080950
24228	NC_008044	CTG	2	6	1191295	1191300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080950
24229	NC_008044	GTT	2	6	1191348	1191353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080950
24230	NC_008044	TCG	2	6	1191425	1191430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080950
24231	NC_008044	CTG	2	6	1191448	1191453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080950
24232	NC_008044	GC	3	6	1191476	1191481	0 %	0 %	50 %	50 %	99080950
24233	NC_008044	GC	3	6	1191501	1191506	0 %	0 %	50 %	50 %	99080950
24234	NC_008044	CG	3	6	1191550	1191555	0 %	0 %	50 %	50 %	99080950
24235	NC_008044	CCAG	2	8	1191721	1191728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24236	NC_008044	CG	4	8	1191758	1191765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24237	NC_008044	GCGATG	2	12	1191906	1191917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99080951
24238	NC_008044	TTC	2	6	1192142	1192147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080952
24239	NC_008044	GTCG	2	8	1192160	1192167	0 %	25 %	50 %	25 %	99080952
24240	NC_008044	GCG	2	6	1192174	1192179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080952
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24478	NC_008044	TGGA	2	8	1204676	1204683	25 %	25 %	50 %	0 %	99080961
24479	NC_008044	GCG	2	6	1204713	1204718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080961
24480	NC_008044	GCG	2	6	1204823	1204828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080961
24481	NC_008044	CAG	2	6	1204895	1204900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080961
24482	NC_008044	GC	3	6	1204942	1204947	0 %	0 %	50 %	50 %	99080961
24483	NC_008044	AGA	2	6	1204987	1204992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080961
24484	NC_008044	GC	3	6	1205035	1205040	0 %	0 %	50 %	50 %	99080961
24485	NC_008044	CTGCG	2	10	1205110	1205119	0 %	20 %	40 %	40 %	99080961
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24487	NC_008044	GCG	2	6	1205211	1205216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080961
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24491	NC_008044	GTG	2	6	1205438	1205443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080961
24492	NC_008044	GGC	2	6	1205456	1205461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080961
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