MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

< Previous12...4243444546474849505152...130131Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23005	NC_008044	CGGGG	2	10	1136266	1136275	0 %	0 %	80 %	20 %	99080898
23006	NC_008044	CG	3	6	1136280	1136285	0 %	0 %	50 %	50 %	99080898
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23121	NC_008044	TGA	2	6	1140595	1140600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080902
23122	NC_008044	CGG	2	6	1140610	1140615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080902
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23127	NC_008044	TGA	2	6	1140907	1140912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080902
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23133	NC_008044	GC	3	6	1141036	1141041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23134	NC_008044	CAG	2	6	1141063	1141068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23346	NC_008044	A	6	6	1150327	1150332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23347	NC_008044	GCCAGA	2	12	1150416	1150427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080915
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23350	NC_008044	GCG	2	6	1150656	1150661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23351	NC_008044	CTC	2	6	1150721	1150726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23352	NC_008044	GTT	2	6	1150825	1150830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23353	NC_008044	GAT	2	6	1150842	1150847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23354	NC_008044	ATAG	2	8	1150885	1150892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23355	NC_008044	CTAGG	2	10	1150893	1150902	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23356	NC_008044	CG	3	6	1150942	1150947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23357	NC_008044	GAA	2	6	1151034	1151039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080916
23358	NC_008044	AAC	2	6	1151059	1151064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080916
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23360	NC_008044	CCA	2	6	1151099	1151104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080916
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23362	NC_008044	CTGC	2	8	1151269	1151276	0 %	25 %	25 %	50 %	99080916
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23369	NC_008044	TGC	2	6	1151518	1151523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080916
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23375	NC_008044	GCG	2	6	1151788	1151793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23376	NC_008044	GC	3	6	1151810	1151815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23377	NC_008044	CG	3	6	1151878	1151883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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23392	NC_008044	CG	3	6	1152692	1152697	0 %	0 %	50 %	50 %	99080918
23393	NC_008044	CCG	2	6	1152781	1152786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080918
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23473	NC_008044	GC	3	6	1156382	1156387	0 %	0 %	50 %	50 %	99080921
23474	NC_008044	AG	3	6	1156489	1156494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23475	NC_008044	GC	3	6	1156521	1156526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23476	NC_008044	G	6	6	1156553	1156558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23477	NC_008044	GAT	3	9	1156595	1156603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080922
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23479	NC_008044	GC	3	6	1156634	1156639	0 %	0 %	50 %	50 %	99080922
23480	NC_008044	AGA	2	6	1156650	1156655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080922
23481	NC_008044	CG	3	6	1156704	1156709	0 %	0 %	50 %	50 %	99080922
23482	NC_008044	TCGGCC	2	12	1156749	1156760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99080922
23483	NC_008044	CGG	2	6	1156801	1156806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080922
23484	NC_008044	TCT	2	6	1157038	1157043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23485	NC_008044	CCA	2	6	1157158	1157163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080923
23486	NC_008044	TGCA	2	8	1157172	1157179	25 %	25 %	25 %	25 %	99080923
23487	NC_008044	CCG	2	6	1157374	1157379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080923
23488	NC_008044	GCA	2	6	1157388	1157393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080923
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23490	NC_008044	CGTT	2	8	1157576	1157583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23491	NC_008044	C	6	6	1157596	1157601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23492	NC_008044	AGG	2	6	1157606	1157611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23493	NC_008044	A	6	6	1157619	1157624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23494	NC_008044	CG	3	6	1157680	1157685	0 %	0 %	50 %	50 %	99080924
23495	NC_008044	TGCC	2	8	1157710	1157717	0 %	25 %	25 %	50 %	99080924
23496	NC_008044	TGGC	2	8	1157774	1157781	0 %	25 %	50 %	25 %	99080924
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23500	NC_008044	CGG	2	6	1157952	1157957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080924

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