MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_008044	CGA	2	6	1063205	1063210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080832
21503	NC_008044	CAA	2	6	1063331	1063336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080832
21504	NC_008044	CCG	2	6	1063444	1063449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080832
21505	NC_008044	AAG	2	6	1063458	1063463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080832
21506	NC_008044	GC	3	6	1063511	1063516	0 %	0 %	50 %	50 %	99080832
21507	NC_008044	GTG	2	6	1063536	1063541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080832
21508	NC_008044	GCG	2	6	1063554	1063559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080832
21509	NC_008044	CAG	2	6	1063572	1063577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080832
21510	NC_008044	GC	3	6	1063613	1063618	0 %	0 %	50 %	50 %	99080832
21511	NC_008044	GGT	2	6	1063619	1063624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080832
21512	NC_008044	CAA	2	6	1063634	1063639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080832
21513	NC_008044	AAG	2	6	1063684	1063689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080832
21514	NC_008044	GCGCG	2	10	1063715	1063724	0 %	0 %	60 %	40 %	99080832
21515	NC_008044	CGC	2	6	1063867	1063872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080832
21516	NC_008044	CCGCA	2	10	1063873	1063882	20 %	0 %	20 %	60 %	99080832
21517	NC_008044	CCAAG	2	10	1063913	1063922	40 %	0 %	20 %	40 %	99080832
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21520	NC_008044	C	6	6	1064222	1064227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21521	NC_008044	GTT	2	6	1064233	1064238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21523	NC_008044	CGC	2	6	1064441	1064446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080833
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21528	NC_008044	TGA	2	6	1064677	1064682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080833
21529	NC_008044	GAG	2	6	1064763	1064768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080833
21530	NC_008044	CGGG	2	8	1064775	1064782	0 %	0 %	75 %	25 %	99080833
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21538	NC_008044	CCTG	2	8	1065118	1065125	0 %	25 %	25 %	50 %	99080833
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21542	NC_008044	CG	3	6	1065282	1065287	0 %	0 %	50 %	50 %	99080833
21543	NC_008044	TGC	2	6	1065361	1065366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21546	NC_008044	CGG	2	6	1065577	1065582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080834
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21557	NC_008044	AAG	2	6	1066011	1066016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080834
21558	NC_008044	GAA	2	6	1066043	1066048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080834
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21562	NC_008044	A	6	6	1066151	1066156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21563	NC_008044	GGTCAA	2	12	1066265	1066276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99080835
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21595	NC_008044	GAAGGG	2	12	1067596	1067607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21978	NC_008044	ATC	2	6	1086764	1086769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080856
21979	NC_008044	GGT	2	6	1086868	1086873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080857
21980	NC_008044	ATCC	2	8	1086885	1086892	25 %	25 %	0 %	50 %	99080857
21981	NC_008044	CCA	2	6	1086948	1086953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080857
21982	NC_008044	TCA	2	6	1087043	1087048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080857
21983	NC_008044	ATC	2	6	1087136	1087141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080857
21984	NC_008044	ATG	2	6	1087172	1087177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080857
21985	NC_008044	TGC	2	6	1087190	1087195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080857
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21987	NC_008044	GAT	2	6	1087300	1087305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080857
21988	NC_008044	CGC	3	9	1087395	1087403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080857
21989	NC_008044	ATC	2	6	1087438	1087443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080857
21990	NC_008044	TCC	2	6	1087484	1087489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080857
21991	NC_008044	GC	4	8	1087562	1087569	0 %	0 %	50 %	50 %	99080857
21992	NC_008044	GC	4	8	1087620	1087627	0 %	0 %	50 %	50 %	99080857
21993	NC_008044	TTG	2	6	1087664	1087669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080857
21994	NC_008044	GAAA	2	8	1087805	1087812	75 %	0 %	25 %	0 %	99080857
21995	NC_008044	CA	3	6	1087854	1087859	50 %	0 %	0 %	50 %	99080857
21996	NC_008044	CAG	2	6	1087861	1087866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080857
21997	NC_008044	CGC	2	6	1088041	1088046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080857
21998	NC_008044	CGA	2	6	1088150	1088155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080857
21999	NC_008044	GTTC	2	8	1088166	1088173	0 %	50 %	25 %	25 %	99080857
22000	NC_008044	GGGC	3	12	1088229	1088240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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