MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

< Previous12...3233343536373839404142...130131Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008044	AGA	2	6	897186	897191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080686
18003	NC_008044	CGC	2	6	897223	897228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080686
18004	NC_008044	ATG	2	6	897455	897460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080686
18005	NC_008044	CG	3	6	897470	897475	0 %	0 %	50 %	50 %	99080686
18006	NC_008044	GGA	2	6	897490	897495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080686
18007	NC_008044	GC	3	6	897544	897549	0 %	0 %	50 %	50 %	99080687
18008	NC_008044	CGA	2	6	897555	897560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080687
18009	NC_008044	CGC	2	6	897599	897604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080687
18010	NC_008044	GGA	2	6	897630	897635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080687
18011	NC_008044	ACA	2	6	897668	897673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080687
18012	NC_008044	CGGG	2	8	897723	897730	0 %	0 %	75 %	25 %	99080687
18013	NC_008044	GCGCC	2	10	897801	897810	0 %	0 %	40 %	60 %	99080687
18014	NC_008044	CCG	2	6	897827	897832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080687
18015	NC_008044	TGGG	2	8	897881	897888	0 %	25 %	75 %	0 %	99080687
18016	NC_008044	CCT	2	6	897914	897919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080687
18017	NC_008044	AGGCCG	2	12	897944	897955	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99080687
18018	NC_008044	CG	3	6	898141	898146	0 %	0 %	50 %	50 %	99080687
18019	NC_008044	GAA	2	6	898192	898197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080687
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18022	NC_008044	GCA	2	6	898287	898292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080687
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18027	NC_008044	TGCG	2	8	898466	898473	0 %	25 %	50 %	25 %	99080687
18028	NC_008044	CGA	2	6	898515	898520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080687
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18030	NC_008044	TGGC	2	8	898630	898637	0 %	25 %	50 %	25 %	99080687
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18040	NC_008044	CTGC	2	8	899298	899305	0 %	25 %	25 %	50 %	99080688
18041	NC_008044	GTG	2	6	899310	899315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080688
18042	NC_008044	TGT	2	6	899318	899323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080688
18043	NC_008044	ACCGG	2	10	899331	899340	20 %	0 %	40 %	40 %	99080688
18044	NC_008044	GC	3	6	899347	899352	0 %	0 %	50 %	50 %	99080688
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18053	NC_008044	GC	6	12	899729	899740	0 %	0 %	50 %	50 %	99080688
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18061	NC_008044	CGG	2	6	900062	900067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080688
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18110	NC_008044	AGC	2	6	902544	902549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080690
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18112	NC_008044	CGTGA	2	10	902612	902621	20 %	20 %	40 %	20 %	99080690
18113	NC_008044	GCC	2	6	902681	902686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080690
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18118	NC_008044	CGC	2	6	902921	902926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080691
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18122	NC_008044	GTG	2	6	903123	903128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080691
18123	NC_008044	TGG	2	6	903304	903309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080691
18124	NC_008044	GCG	2	6	903360	903365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080691
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18141	NC_008044	TTC	2	6	904052	904057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080692
18142	NC_008044	TCA	2	6	904068	904073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080692
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18190	NC_008044	GTT	2	6	906408	906413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080694
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18217	NC_008044	CT	3	6	907305	907310	0 %	50 %	0 %	50 %	99080695
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18226	NC_008044	GC	3	6	907668	907673	0 %	0 %	50 %	50 %	99080696
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18231	NC_008044	TGG	2	6	907892	907897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080696
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18242	NC_008044	GC	4	8	908253	908260	0 %	0 %	50 %	50 %	99080696
18243	NC_008044	GGC	2	6	908293	908298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080696
18244	NC_008044	CTGAAC	2	12	908323	908334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99080696
18245	NC_008044	GGC	2	6	908361	908366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080696
18246	NC_008044	CTG	2	6	908416	908421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080696
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18256	NC_008044	GAT	2	6	908959	908964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080696
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18263	NC_008044	CCT	2	6	909217	909222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18264	NC_008044	TGAAA	2	10	909267	909276	60 %	20 %	20 %	0 %	99080697
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18274	NC_008044	A	6	6	909865	909870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18275	NC_008044	CTTT	2	8	909891	909898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18283	NC_008044	CCTG	2	8	910438	910445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18284	NC_008044	CGG	2	6	910786	910791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18333	NC_008044	TGA	2	6	912822	912827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18337	NC_008044	CTG	2	6	912948	912953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18365	NC_008044	CGT	2	6	914653	914658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080702
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18367	NC_008044	ATG	2	6	914716	914721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080702
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18490	NC_008044	GCG	2	6	920962	920967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080707
18491	NC_008044	CTG	2	6	920969	920974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080707
18492	NC_008044	GCCG	2	8	921009	921016	0 %	0 %	50 %	50 %	99080707
18493	NC_008044	CG	3	6	921035	921040	0 %	0 %	50 %	50 %	99080707
18494	NC_008044	TTG	2	6	921056	921061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080707
18495	NC_008044	TGA	2	6	921062	921067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080707
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18499	NC_008044	AC	3	6	921332	921337	50 %	0 %	0 %	50 %	99080707
18500	NC_008044	CTG	2	6	921400	921405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080707

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