MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_008044	TGG	2	6	841626	841631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080630
17003	NC_008044	T	6	6	841741	841746	0 %	100 %	0 %	0 %	99080630
17004	NC_008044	GCT	2	6	841749	841754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080630
17005	NC_008044	CAGC	2	8	841776	841783	25 %	0 %	25 %	50 %	99080630
17006	NC_008044	CTT	2	6	841827	841832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080630
17007	NC_008044	GAAA	2	8	841834	841841	75 %	0 %	25 %	0 %	99080630
17008	NC_008044	GA	3	6	841850	841855	50 %	0 %	50 %	0 %	99080630
17009	NC_008044	GAT	2	6	841887	841892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080630
17010	NC_008044	CAA	2	6	841943	841948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_008044	TC	3	6	841976	841981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17012	NC_008044	CG	3	6	842012	842017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17013	NC_008044	CATG	2	8	842098	842105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17014	NC_008044	ACG	2	6	842121	842126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_008044	GCC	2	6	842135	842140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17016	NC_008044	CT	3	6	842148	842153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17017	NC_008044	GGA	2	6	842191	842196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_008044	GGA	2	6	842347	842352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080631
17019	NC_008044	TGG	2	6	842368	842373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080631
17020	NC_008044	AGG	2	6	842481	842486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080631
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17022	NC_008044	GCA	2	6	842561	842566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080631
17023	NC_008044	GAGGCA	2	12	842609	842620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	99080631
17024	NC_008044	GCG	2	6	842673	842678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080631
17025	NC_008044	CGG	2	6	842722	842727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_008044	CCA	2	6	842823	842828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17027	NC_008044	GGA	2	6	842926	842931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_008044	GCA	2	6	842983	842988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080632
17029	NC_008044	GC	3	6	842999	843004	0 %	0 %	50 %	50 %	99080632
17030	NC_008044	CGC	2	6	843019	843024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080632
17031	NC_008044	CGG	2	6	843040	843045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080632
17032	NC_008044	GAC	2	6	843098	843103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080632
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17037	NC_008044	CAT	2	6	843495	843500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080633
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17039	NC_008044	GAT	2	6	843537	843542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080633
17040	NC_008044	CA	3	6	843598	843603	50 %	0 %	0 %	50 %	99080633
17041	NC_008044	TGC	2	6	843629	843634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080633
17042	NC_008044	GGT	2	6	843639	843644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080633
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17049	NC_008044	CA	3	6	843854	843859	50 %	0 %	0 %	50 %	99080634
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17052	NC_008044	CGTTT	2	10	843925	843934	0 %	60 %	20 %	20 %	99080634
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17055	NC_008044	CGAT	2	8	843994	844001	25 %	25 %	25 %	25 %	99080634
17056	NC_008044	TGA	2	6	844025	844030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080634
17057	NC_008044	GGGCG	2	10	844079	844088	0 %	0 %	80 %	20 %	99080634
17058	NC_008044	GCCA	2	8	844108	844115	25 %	0 %	25 %	50 %	99080634
17059	NC_008044	CAT	2	6	844126	844131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080635
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17063	NC_008044	GAGC	2	8	844265	844272	25 %	0 %	50 %	25 %	99080635
17064	NC_008044	C	6	6	844382	844387	0 %	0 %	0 %	100 %	99080635
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17072	NC_008044	CGG	2	6	844798	844803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080635
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17085	NC_008044	GC	3	6	845467	845472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17099	NC_008044	CG	4	8	846252	846259	0 %	0 %	50 %	50 %	99080638
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17110	NC_008044	GCG	2	6	846993	846998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_008044	GTC	2	6	847005	847010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17122	NC_008044	CGGG	2	8	847745	847752	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17123	NC_008044	CA	3	6	847782	847787	50 %	0 %	0 %	50 %	99080641
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17125	NC_008044	TCGG	2	8	847892	847899	0 %	25 %	50 %	25 %	99080641
17126	NC_008044	A	6	6	847913	847918	100 %	0 %	0 %	0 %	99080641
17127	NC_008044	TGC	2	6	847992	847997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080641
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17130	NC_008044	GCG	2	6	848085	848090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080641
17131	NC_008044	GCG	2	6	848193	848198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080641
17132	NC_008044	GAT	2	6	848285	848290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080641
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17141	NC_008044	GAT	2	6	848667	848672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080642
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17144	NC_008044	GCC	2	6	848751	848756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080642
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17184	NC_008044	ATG	2	6	850673	850678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080643
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17193	NC_008044	GCT	2	6	851048	851053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080644
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17197	NC_008044	CTG	3	9	851287	851295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080644
17198	NC_008044	GCT	2	6	851307	851312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080644
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17200	NC_008044	CCGGG	2	10	851402	851411	0 %	0 %	60 %	40 %	99080644
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17208	NC_008044	GACA	2	8	852013	852020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17209	NC_008044	CGC	2	6	852105	852110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17210	NC_008044	GGCG	2	8	852119	852126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17211	NC_008044	GCGG	2	8	852193	852200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17212	NC_008044	GACC	2	8	852249	852256	25 %	0 %	25 %	50 %	99080645
17213	NC_008044	AAG	2	6	852454	852459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080645
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17216	NC_008044	ATG	2	6	852565	852570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080645
17217	NC_008044	TC	3	6	852589	852594	0 %	50 %	0 %	50 %	99080645
17218	NC_008044	GAC	2	6	852637	852642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080645
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17225	NC_008044	CCTG	2	8	852903	852910	0 %	25 %	25 %	50 %	99080645
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17229	NC_008044	CTT	2	6	853083	853088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080646
17230	NC_008044	GCC	2	6	853099	853104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080646
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17232	NC_008044	CAG	2	6	853255	853260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080646
17233	NC_008044	GCT	2	6	853293	853298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080646
17234	NC_008044	TGA	2	6	853463	853468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080646
17235	NC_008044	CAACGT	2	12	853536	853547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	99080646
17236	NC_008044	AGGC	2	8	853601	853608	25 %	0 %	50 %	25 %	99080646
17237	NC_008044	CAT	2	6	853674	853679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080646
17238	NC_008044	ACC	2	6	853693	853698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080646
17239	NC_008044	ACC	2	6	853720	853725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080646
17240	NC_008044	ACT	2	6	853736	853741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080646
17241	NC_008044	GGC	2	6	853786	853791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080646
17242	NC_008044	GGC	2	6	853901	853906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17243	NC_008044	CCA	2	6	853944	853949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17244	NC_008044	AAC	2	6	853955	853960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17245	NC_008044	ATC	2	6	854035	854040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080647
17246	NC_008044	CGCT	2	8	854043	854050	0 %	25 %	25 %	50 %	99080647
17247	NC_008044	CCA	2	6	854081	854086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080647
17248	NC_008044	GAT	2	6	854110	854115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080647
17249	NC_008044	GCT	2	6	854124	854129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080647
17250	NC_008044	GAT	2	6	854146	854151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080647
17251	NC_008044	TGC	2	6	854248	854253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080648
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17278	NC_008044	GCCG	2	8	856044	856051	0 %	0 %	50 %	50 %	99080652
17279	NC_008044	AGGC	2	8	856142	856149	25 %	0 %	50 %	25 %	99080652
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17282	NC_008044	GGC	2	6	856246	856251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080652
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17285	NC_008044	CGG	2	6	856465	856470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17286	NC_008044	AG	3	6	856529	856534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17287	NC_008044	GGCT	2	8	856637	856644	0 %	25 %	50 %	25 %	99080653
17288	NC_008044	GAC	2	6	856845	856850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080653
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17328	NC_008044	TCGGC	2	10	858773	858782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17329	NC_008044	GC	3	6	858805	858810	0 %	0 %	50 %	50 %	99080658
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17367	NC_008044	GTG	2	6	860643	860648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080660
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17491	NC_008044	CTC	2	6	867879	867884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080666
17492	NC_008044	CT	3	6	867913	867918	0 %	50 %	0 %	50 %	99080666
17493	NC_008044	CATC	2	8	867923	867930	25 %	25 %	0 %	50 %	99080666
17494	NC_008044	GCAGG	2	10	867935	867944	20 %	0 %	60 %	20 %	99080666
17495	NC_008044	AGA	2	6	868001	868006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080667
17496	NC_008044	ACC	2	6	868058	868063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080667
17497	NC_008044	G	6	6	868074	868079	0 %	0 %	100 %	0 %	99080667
17498	NC_008044	ATG	2	6	868112	868117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080667
17499	NC_008044	GCG	2	6	868125	868130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080667
17500	NC_008044	GGTG	2	8	868212	868219	0 %	25 %	75 %	0 %	99080667

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