MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008044	TGCA	2	8	740630	740637	25 %	25 %	25 %	25 %	99080531
15002	NC_008044	TGA	2	6	740658	740663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080531
15003	NC_008044	GGCG	2	8	740709	740716	0 %	0 %	75 %	25 %	99080531
15004	NC_008044	GGGCA	2	10	740747	740756	20 %	0 %	60 %	20 %	99080531
15005	NC_008044	CTT	2	6	740773	740778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080531
15006	NC_008044	CG	3	6	740838	740843	0 %	0 %	50 %	50 %	99080531
15007	NC_008044	CCTG	2	8	740844	740851	0 %	25 %	25 %	50 %	99080531
15008	NC_008044	CG	3	6	740907	740912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15009	NC_008044	GC	3	6	740924	740929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15010	NC_008044	T	6	6	740976	740981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_008044	CAT	2	6	741119	741124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_008044	GCA	2	6	741265	741270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080532
15013	NC_008044	GCG	3	9	741317	741325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080532
15014	NC_008044	GTC	2	6	741345	741350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080532
15015	NC_008044	CGCC	2	8	741371	741378	0 %	0 %	25 %	75 %	99080532
15016	NC_008044	GCG	2	6	741392	741397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080532
15017	NC_008044	CCG	2	6	741548	741553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080532
15018	NC_008044	GCC	2	6	741592	741597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080532
15019	NC_008044	TCT	2	6	741609	741614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080532
15020	NC_008044	CTA	2	6	741624	741629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080532
15021	NC_008044	ACC	2	6	741764	741769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080532
15022	NC_008044	TAT	2	6	741799	741804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080532
15023	NC_008044	GTG	3	9	741847	741855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080532
15024	NC_008044	CTG	2	6	741947	741952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080532
15025	NC_008044	CAA	2	6	742047	742052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080532
15026	NC_008044	GCG	2	6	742132	742137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_008044	CG	3	6	742146	742151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15028	NC_008044	TGC	2	6	742179	742184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080533
15029	NC_008044	GC	4	8	742183	742190	0 %	0 %	50 %	50 %	99080533
15030	NC_008044	ATC	2	6	742211	742216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080533
15031	NC_008044	ATCC	2	8	742282	742289	25 %	25 %	0 %	50 %	99080533
15032	NC_008044	CT	3	6	742297	742302	0 %	50 %	0 %	50 %	99080533
15033	NC_008044	GCTGG	2	10	742312	742321	0 %	20 %	60 %	20 %	99080533
15034	NC_008044	CGGG	2	8	742324	742331	0 %	0 %	75 %	25 %	99080533
15035	NC_008044	TGC	3	9	742449	742457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080533
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15037	NC_008044	ACG	2	6	742569	742574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080533
15038	NC_008044	CTG	2	6	742583	742588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080533
15039	NC_008044	TGA	2	6	742645	742650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080533
15040	NC_008044	GC	3	6	742654	742659	0 %	0 %	50 %	50 %	99080533
15041	NC_008044	G	6	6	742665	742670	0 %	0 %	100 %	0 %	99080533
15042	NC_008044	GCCCGC	2	12	742676	742687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080533
15043	NC_008044	CGC	2	6	742708	742713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080533
15044	NC_008044	GCGT	2	8	742722	742729	0 %	25 %	50 %	25 %	99080533
15045	NC_008044	AGA	3	9	742732	742740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080533
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15047	NC_008044	GCC	2	6	742832	742837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080533
15048	NC_008044	CG	3	6	742862	742867	0 %	0 %	50 %	50 %	99080533
15049	NC_008044	AGGCG	2	10	742945	742954	20 %	0 %	60 %	20 %	99080533
15050	NC_008044	CG	3	6	742982	742987	0 %	0 %	50 %	50 %	99080533
15051	NC_008044	GAG	2	6	743072	743077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080533
15052	NC_008044	GC	3	6	743102	743107	0 %	0 %	50 %	50 %	99080533
15053	NC_008044	ATG	2	6	743112	743117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080533
15054	NC_008044	GAT	2	6	743126	743131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080533
15055	NC_008044	GCG	2	6	743240	743245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080533
15056	NC_008044	CGG	2	6	743270	743275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080533
15057	NC_008044	GC	3	6	743335	743340	0 %	0 %	50 %	50 %	99080533
15058	NC_008044	GCCCG	2	10	743371	743380	0 %	0 %	40 %	60 %	99080533
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15061	NC_008044	GTG	2	6	743550	743555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080533
15062	NC_008044	CCG	2	6	743568	743573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080533
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15064	NC_008044	TGC	2	6	743647	743652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080533
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15068	NC_008044	CGC	3	9	743794	743802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080533
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15089	NC_008044	G	6	6	744978	744983	0 %	0 %	100 %	0 %	99080534
15090	NC_008044	CGA	2	6	745046	745051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080534
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15100	NC_008044	CAT	2	6	745540	745545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080534
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15103	NC_008044	GAA	2	6	745594	745599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080534
15104	NC_008044	GCTGC	2	10	745632	745641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15105	NC_008044	ATT	2	6	745668	745673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_008044	GGGGGC	2	12	745691	745702	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15107	NC_008044	CAGCGC	2	12	745728	745739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	99080535
15108	NC_008044	CGCC	2	8	745834	745841	0 %	0 %	25 %	75 %	99080535
15109	NC_008044	TCG	2	6	745849	745854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080535
15110	NC_008044	CCGAC	2	10	745893	745902	20 %	0 %	20 %	60 %	99080535
15111	NC_008044	GGC	2	6	745904	745909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080535
15112	NC_008044	CAAG	2	8	745933	745940	50 %	0 %	25 %	25 %	99080535
15113	NC_008044	AGA	2	6	745957	745962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080535
15114	NC_008044	G	6	6	745977	745982	0 %	0 %	100 %	0 %	99080535
15115	NC_008044	AGGC	2	8	746087	746094	25 %	0 %	50 %	25 %	99080535
15116	NC_008044	CGG	3	9	746116	746124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080535
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15119	NC_008044	CAT	2	6	746192	746197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080535
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15123	NC_008044	CCCCA	2	10	746339	746348	20 %	0 %	0 %	80 %	99080535
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15153	NC_008044	GTC	2	6	747936	747941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15241	NC_008044	TGA	2	6	752319	752324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080544
15242	NC_008044	GCA	2	6	752409	752414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080544
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15244	NC_008044	GGC	2	6	752436	752441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080544
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15246	NC_008044	GAT	2	6	752520	752525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080544
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15248	NC_008044	CTG	2	6	752579	752584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080544
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15354	NC_008044	G	6	6	759277	759282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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15357	NC_008044	CGG	2	6	759516	759521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15359	NC_008044	CTT	2	6	759602	759607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15367	NC_008044	CGG	2	6	760026	760031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080548
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15492	NC_008044	CAG	2	6	765390	765395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080552
15493	NC_008044	GCG	2	6	765399	765404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080552
15494	NC_008044	GTCGC	2	10	765412	765421	0 %	20 %	40 %	40 %	99080552
15495	NC_008044	CCG	2	6	765512	765517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080552
15496	NC_008044	CAT	2	6	765635	765640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080552
15497	NC_008044	ACC	2	6	765700	765705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080552
15498	NC_008044	CAT	2	6	765824	765829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080552
15499	NC_008044	AAG	2	6	765894	765899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080552
15500	NC_008044	CCT	2	6	765956	765961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080552

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