MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008044	GC	3	6	642396	642401	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
13002	NC_008044	AG	3	6	642469	642474	50 %	0 %	50 %	0 %	99080443
13003	NC_008044	CCT	2	6	642495	642500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080443
13004	NC_008044	C	6	6	642548	642553	0 %	0 %	0 %	100 %	99080443
13005	NC_008044	TTCGA	2	10	642752	642761	20 %	40 %	20 %	20 %	99080443
13006	NC_008044	GCC	2	6	642876	642881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080443
13007	NC_008044	TGC	2	6	642938	642943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080443
13008	NC_008044	TCT	2	6	642999	643004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080443
13009	NC_008044	ATG	2	6	643034	643039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080443
13010	NC_008044	GC	3	6	643046	643051	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
13011	NC_008044	GC	4	8	643068	643075	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
13012	NC_008044	GC	3	6	643079	643084	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
13013	NC_008044	GCC	2	6	643123	643128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080443
13014	NC_008044	CAT	2	6	643146	643151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080443
13015	NC_008044	CGG	2	6	643202	643207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080443
13016	NC_008044	GCG	2	6	643276	643281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080443
13017	NC_008044	CTG	2	6	643303	643308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080443
13018	NC_008044	CCGGC	2	10	643340	643349	0 %	0 %	40 %	60 %	99080443
13019	NC_008044	GGCG	2	8	643450	643457	0 %	0 %	75 %	25 %	99080443
13020	NC_008044	TGC	2	6	643482	643487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080443
13021	NC_008044	GC	3	6	643486	643491	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
13022	NC_008044	CTGCAT	2	12	643510	643521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_008044	GCG	2	6	643555	643560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_008044	GAG	2	6	643601	643606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_008044	GTG	2	6	643615	643620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_008044	CTC	2	6	643632	643637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_008044	TGG	2	6	643694	643699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_008044	CG	3	6	643979	643984	0 %	0 %	50 %	50 %	99080444
13029	NC_008044	CGT	2	6	644106	644111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080444
13030	NC_008044	GGT	3	9	644127	644135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080444
13031	NC_008044	GGC	2	6	644274	644279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080444
13032	NC_008044	CTT	2	6	644294	644299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080444
13033	NC_008044	ATG	2	6	644308	644313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080444
13034	NC_008044	CAT	2	6	644330	644335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080444
13035	NC_008044	CGC	2	6	644344	644349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080444
13036	NC_008044	GGC	2	6	644400	644405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080444
13037	NC_008044	ATC	2	6	644406	644411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080444
13038	NC_008044	GC	3	6	644599	644604	0 %	0 %	50 %	50 %	99080444
13039	NC_008044	GCC	2	6	644608	644613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080444
13040	NC_008044	CGGC	2	8	644672	644679	0 %	0 %	50 %	50 %	99080444
13041	NC_008044	GTG	2	6	644692	644697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080444
13042	NC_008044	ACC	2	6	644742	644747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080444
13043	NC_008044	CTC	2	6	644809	644814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080445
13044	NC_008044	GGC	2	6	644824	644829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080445
13045	NC_008044	GCG	2	6	644867	644872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080445
13046	NC_008044	TGG	2	6	644877	644882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080445
13047	NC_008044	CGG	2	6	644892	644897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080445
13048	NC_008044	TGG	2	6	644940	644945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080445
13049	NC_008044	CAT	2	6	645055	645060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080445
13050	NC_008044	GCGCC	2	10	645072	645081	0 %	0 %	40 %	60 %	99080445
13051	NC_008044	CTG	2	6	645117	645122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080445
13052	NC_008044	GCT	2	6	645215	645220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080445
13053	NC_008044	ATG	2	6	645254	645259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080445
13054	NC_008044	GC	3	6	645306	645311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_008044	G	6	6	645348	645353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_008044	TGC	2	6	645357	645362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_008044	CT	3	6	645373	645378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_008044	GC	4	8	645462	645469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13059	NC_008044	GCTTGA	2	12	645471	645482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13060	NC_008044	CAT	2	6	645508	645513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_008044	GGC	2	6	645583	645588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080446
13062	NC_008044	GC	3	6	645614	645619	0 %	0 %	50 %	50 %	99080446
13063	NC_008044	GA	3	6	645734	645739	50 %	0 %	50 %	0 %	99080446
13064	NC_008044	CGC	2	6	645774	645779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080446
13065	NC_008044	GCA	2	6	645876	645881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080446
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13067	NC_008044	TGC	2	6	646032	646037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080446
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13069	NC_008044	GC	3	6	646071	646076	0 %	0 %	50 %	50 %	99080446
13070	NC_008044	TGC	2	6	646169	646174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080446
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13073	NC_008044	CAT	2	6	646240	646245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080446
13074	NC_008044	AGCAG	2	10	646272	646281	40 %	0 %	40 %	20 %	99080446
13075	NC_008044	TCG	2	6	646322	646327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080446
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13077	NC_008044	GTTTT	2	10	646370	646379	0 %	80 %	20 %	0 %	99080446
13078	NC_008044	GAAG	2	8	646566	646573	50 %	0 %	50 %	0 %	99080447
13079	NC_008044	CTG	2	6	646574	646579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080447
13080	NC_008044	GC	3	6	646606	646611	0 %	0 %	50 %	50 %	99080447
13081	NC_008044	C	6	6	646611	646616	0 %	0 %	0 %	100 %	99080447
13082	NC_008044	ATG	2	6	646620	646625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080447
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13086	NC_008044	GA	3	6	646795	646800	50 %	0 %	50 %	0 %	99080447
13087	NC_008044	AGA	2	6	646811	646816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080447
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13089	NC_008044	CGT	2	6	646963	646968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080448
13090	NC_008044	GAC	2	6	647147	647152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080448
13091	NC_008044	TCGG	2	8	647245	647252	0 %	25 %	50 %	25 %	99080448
13092	NC_008044	AGCCA	2	10	647317	647326	40 %	0 %	20 %	40 %	99080448
13093	NC_008044	GC	3	6	647402	647407	0 %	0 %	50 %	50 %	99080448
13094	NC_008044	CAT	2	6	647429	647434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080448
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13096	NC_008044	CCTGA	2	10	647506	647515	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13097	NC_008044	GGGC	2	8	647537	647544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13098	NC_008044	G	6	6	647566	647571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_008044	CCA	2	6	647579	647584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080449
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13102	NC_008044	TGA	2	6	647639	647644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080449
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13105	NC_008044	GCG	2	6	647757	647762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080449
13106	NC_008044	GAA	2	6	647781	647786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080449
13107	NC_008044	CGC	2	6	647801	647806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080449
13108	NC_008044	TG	3	6	647818	647823	0 %	50 %	50 %	0 %	99080449
13109	NC_008044	CCA	2	6	647927	647932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080449
13110	NC_008044	ATC	2	6	647992	647997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080449
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13113	NC_008044	CCAGA	2	10	648219	648228	40 %	0 %	20 %	40 %	99080449
13114	NC_008044	ATC	2	6	648247	648252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080449
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13118	NC_008044	GC	3	6	648357	648362	0 %	0 %	50 %	50 %	99080449
13119	NC_008044	GAT	2	6	648387	648392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080449
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13124	NC_008044	CGG	2	6	648506	648511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080449
13125	NC_008044	GTG	2	6	648553	648558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080449
13126	NC_008044	GGC	2	6	648615	648620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080449
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13128	NC_008044	GAT	2	6	648669	648674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080449
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13137	NC_008044	GTCGG	2	10	649186	649195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13138	NC_008044	CGGGGG	2	12	649253	649264	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
13139	NC_008044	A	8	8	649290	649297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13140	NC_008044	GC	3	6	649342	649347	0 %	0 %	50 %	50 %	99080450
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13154	NC_008044	GGC	2	6	650413	650418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13155	NC_008044	A	7	7	650477	650483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13156	NC_008044	GTT	2	6	650504	650509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13232	NC_008044	GGT	2	6	654253	654258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_008044	TGC	2	6	654275	654280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13234	NC_008044	GC	3	6	654286	654291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13235	NC_008044	GC	3	6	654357	654362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13236	NC_008044	CG	3	6	654378	654383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13237	NC_008044	GGC	2	6	654442	654447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080455
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13363	NC_008044	TG	3	6	660704	660709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13366	NC_008044	GC	3	6	660854	660859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13367	NC_008044	GCAA	2	8	660935	660942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13368	NC_008044	CGC	2	6	660980	660985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13369	NC_008044	ACC	2	6	660998	661003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13370	NC_008044	GA	3	6	661031	661036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13372	NC_008044	CCAT	2	8	661071	661078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13498	NC_008044	CCG	2	6	667352	667357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080470
13499	NC_008044	AGA	2	6	667403	667408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080470
13500	NC_008044	GAA	2	6	667482	667487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080470

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