MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008044	A	7	7	617986	617992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_008044	GA	3	6	618003	618008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_008044	GCC	2	6	618009	618014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_008044	CGAG	2	8	618080	618087	25 %	0 %	50 %	25 %	99080421
12505	NC_008044	AGG	2	6	618188	618193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080421
12506	NC_008044	GC	3	6	618198	618203	0 %	0 %	50 %	50 %	99080421
12507	NC_008044	TGA	2	6	618275	618280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080421
12508	NC_008044	TGT	2	6	618334	618339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080421
12509	NC_008044	GGC	3	9	618356	618364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080421
12510	NC_008044	CTT	2	6	618368	618373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080421
12511	NC_008044	CG	3	6	618542	618547	0 %	0 %	50 %	50 %	99080421
12512	NC_008044	GCA	2	6	618701	618706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080421
12513	NC_008044	CG	3	6	618758	618763	0 %	0 %	50 %	50 %	99080421
12514	NC_008044	GTC	2	6	618807	618812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080421
12515	NC_008044	CGG	2	6	618860	618865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080421
12516	NC_008044	TGC	2	6	618932	618937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080421
12517	NC_008044	AAC	2	6	618978	618983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080421
12518	NC_008044	AGT	2	6	618998	619003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080421
12519	NC_008044	AGA	2	6	619070	619075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080421
12520	NC_008044	GCT	2	6	619251	619256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080421
12521	NC_008044	CGGG	2	8	619257	619264	0 %	0 %	75 %	25 %	99080421
12522	NC_008044	GCG	2	6	619272	619277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080421
12523	NC_008044	TGA	2	6	619308	619313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_008044	ACCT	2	8	619328	619335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_008044	CA	3	6	619347	619352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12526	NC_008044	GAA	2	6	619433	619438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080422
12527	NC_008044	AGC	2	6	619450	619455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080422
12528	NC_008044	GCA	2	6	619490	619495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080422
12529	NC_008044	GCA	2	6	619570	619575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080422
12530	NC_008044	GC	3	6	619650	619655	0 %	0 %	50 %	50 %	99080422
12531	NC_008044	TCT	2	6	619678	619683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080422
12532	NC_008044	CTGG	2	8	619710	619717	0 %	25 %	50 %	25 %	99080422
12533	NC_008044	AG	3	6	619719	619724	50 %	0 %	50 %	0 %	99080422
12534	NC_008044	TTC	2	6	619765	619770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080422
12535	NC_008044	GCA	2	6	619925	619930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_008044	ATG	2	6	619966	619971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080423
12537	NC_008044	CCGG	2	8	620001	620008	0 %	0 %	50 %	50 %	99080423
12538	NC_008044	GAA	2	6	620052	620057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080423
12539	NC_008044	GCA	2	6	620132	620137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080423
12540	NC_008044	GGC	2	6	620337	620342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080423
12541	NC_008044	CG	3	6	620422	620427	0 %	0 %	50 %	50 %	99080423
12542	NC_008044	TTA	2	6	620438	620443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080423
12543	NC_008044	CGCATT	2	12	620598	620609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99080423
12544	NC_008044	AAG	2	6	620658	620663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080423
12545	NC_008044	GC	3	6	620698	620703	0 %	0 %	50 %	50 %	99080423
12546	NC_008044	ATG	2	6	620713	620718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080423
12547	NC_008044	GTG	2	6	620865	620870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080423
12548	NC_008044	CTG	2	6	620892	620897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080423
12549	NC_008044	TCT	2	6	620902	620907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080423
12550	NC_008044	TCT	2	6	620929	620934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080423
12551	NC_008044	ATCG	2	8	620999	621006	25 %	25 %	25 %	25 %	99080423
12552	NC_008044	CAA	2	6	621020	621025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080423
12553	NC_008044	TGA	2	6	621048	621053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080423
12554	NC_008044	GGC	2	6	621074	621079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_008044	GCC	2	6	621080	621085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_008044	GTG	2	6	621159	621164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_008044	CGA	2	6	621246	621251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12558	NC_008044	CCG	2	6	621257	621262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080424
12559	NC_008044	GC	3	6	621320	621325	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12560	NC_008044	CGC	2	6	621365	621370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080424
12561	NC_008044	GGT	2	6	621388	621393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080424
12562	NC_008044	GGCT	2	8	621578	621585	0 %	25 %	50 %	25 %	99080424
12563	NC_008044	CAC	2	6	621652	621657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080424
12564	NC_008044	GC	4	8	621669	621676	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12565	NC_008044	TTG	2	6	621721	621726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080424
12566	NC_008044	CAA	2	6	621727	621732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080424
12567	NC_008044	CTT	2	6	621747	621752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080424
12568	NC_008044	GTGG	2	8	621791	621798	0 %	25 %	75 %	0 %	99080424
12569	NC_008044	TCA	2	6	621884	621889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080424
12570	NC_008044	GTCT	2	8	621943	621950	0 %	50 %	25 %	25 %	99080424
12571	NC_008044	GCAG	2	8	621965	621972	25 %	0 %	50 %	25 %	99080424
12572	NC_008044	TAT	2	6	621999	622004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080424
12573	NC_008044	GGC	2	6	622087	622092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12574	NC_008044	CCT	2	6	622125	622130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080424
12575	NC_008044	GTTG	2	8	622142	622149	0 %	50 %	50 %	0 %	99080424
12576	NC_008044	GTC	2	6	622201	622206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12577	NC_008044	TCG	2	6	622223	622228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12578	NC_008044	GCG	2	6	622272	622277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12579	NC_008044	GGC	2	6	622318	622323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12580	NC_008044	CAG	2	6	622359	622364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12581	NC_008044	TCGGTC	2	12	622367	622378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12582	NC_008044	CAG	2	6	622386	622391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12583	NC_008044	GC	3	6	622438	622443	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12584	NC_008044	TTG	2	6	622499	622504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080424
12585	NC_008044	GGC	2	6	622525	622530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12586	NC_008044	GC	3	6	622574	622579	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12587	NC_008044	ACG	2	6	622613	622618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12588	NC_008044	GCA	2	6	622643	622648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12589	NC_008044	GC	3	6	622681	622686	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12590	NC_008044	GCT	2	6	622716	622721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12591	NC_008044	GCTCGG	2	12	622756	622767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99080424
12592	NC_008044	GGC	2	6	622772	622777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12593	NC_008044	GGC	2	6	622825	622830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12594	NC_008044	CGA	2	6	622837	622842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12595	NC_008044	CTG	2	6	622914	622919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12596	NC_008044	GCG	2	6	622990	622995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12597	NC_008044	CCG	2	6	623010	623015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080424
12598	NC_008044	TCG	2	6	623108	623113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12599	NC_008044	TGG	2	6	623152	623157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080424
12600	NC_008044	GAT	2	6	623170	623175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080424
12601	NC_008044	ATC	3	9	623200	623208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080424
12602	NC_008044	CTC	2	6	623236	623241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080424
12603	NC_008044	CGG	3	9	623275	623283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12604	NC_008044	CGA	2	6	623289	623294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12605	NC_008044	AAAG	2	8	623347	623354	75 %	0 %	25 %	0 %	99080424
12606	NC_008044	GGC	2	6	623368	623373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12607	NC_008044	GCC	2	6	623462	623467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080424
12608	NC_008044	GCG	2	6	623543	623548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12609	NC_008044	GC	3	6	623563	623568	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12610	NC_008044	GCG	2	6	623643	623648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
12611	NC_008044	GC	3	6	623672	623677	0 %	0 %	50 %	50 %	99080424
12612	NC_008044	GCT	2	6	623688	623693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
12613	NC_008044	GACC	2	8	623719	623726	25 %	0 %	25 %	50 %	99080424
12614	NC_008044	TCC	2	6	623740	623745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080424
12615	NC_008044	AG	4	8	623783	623790	50 %	0 %	50 %	0 %	99080424
12616	NC_008044	TCA	2	6	623805	623810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080424
12617	NC_008044	TCA	2	6	623813	623818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_008044	GC	3	6	623832	623837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12619	NC_008044	CCG	2	6	623966	623971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12620	NC_008044	GC	3	6	624002	624007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_008044	AGA	2	6	624134	624139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080425
12622	NC_008044	GCC	2	6	624240	624245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080425
12623	NC_008044	AGG	2	6	624271	624276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080425
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12625	NC_008044	CGCAG	2	10	624305	624314	20 %	0 %	40 %	40 %	99080425
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12657	NC_008044	GCG	2	6	626222	626227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12658	NC_008044	GCAA	2	8	626233	626240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12991	NC_008044	AGATG	2	10	641955	641964	40 %	20 %	40 %	0 %	99080442
12992	NC_008044	CTG	2	6	641986	641991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080442
12993	NC_008044	TCT	2	6	642104	642109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080442
12994	NC_008044	GAT	2	6	642130	642135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080442
12995	NC_008044	ATC	2	6	642184	642189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080442
12996	NC_008044	TGA	2	6	642212	642217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080442
12997	NC_008044	TGGC	2	8	642282	642289	0 %	25 %	50 %	25 %	99080442
12998	NC_008044	CGG	2	6	642318	642323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080442
12999	NC_008044	TGG	2	6	642377	642382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080443
13000	NC_008044	TGC	2	6	642392	642397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080443

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