MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008044	CGC	2	6	566863	566868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080376
11502	NC_008044	GCA	2	6	566874	566879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080376
11503	NC_008044	GC	3	6	566909	566914	0 %	0 %	50 %	50 %	99080376
11504	NC_008044	GATGCG	2	12	566953	566964	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99080376
11505	NC_008044	TGA	2	6	567137	567142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080376
11506	NC_008044	TAC	2	6	567169	567174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080376
11507	NC_008044	GAT	2	6	567219	567224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080376
11508	NC_008044	GAT	2	6	567228	567233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080376
11509	NC_008044	CA	3	6	567241	567246	50 %	0 %	0 %	50 %	99080376
11510	NC_008044	GAT	2	6	567318	567323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080376
11511	NC_008044	GGA	3	9	567357	567365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080376
11512	NC_008044	TC	3	6	567465	567470	0 %	50 %	0 %	50 %	99080376
11513	NC_008044	GAT	2	6	567511	567516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080376
11514	NC_008044	CG	3	6	567556	567561	0 %	0 %	50 %	50 %	99080376
11515	NC_008044	CCG	2	6	567576	567581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080376
11516	NC_008044	CGGA	2	8	567779	567786	25 %	0 %	50 %	25 %	99080376
11517	NC_008044	A	6	6	567815	567820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_008044	GGC	2	6	567821	567826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_008044	AGG	2	6	567830	567835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_008044	T	6	6	567846	567851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_008044	CTT	2	6	567862	567867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080377
11522	NC_008044	TGATC	2	10	567925	567934	20 %	40 %	20 %	20 %	99080377
11523	NC_008044	ATC	2	6	567954	567959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080377
11524	NC_008044	GATC	2	8	567961	567968	25 %	25 %	25 %	25 %	99080377
11525	NC_008044	CGC	2	6	568027	568032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080377
11526	NC_008044	CCG	2	6	568099	568104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080377
11527	NC_008044	GAT	3	9	568115	568123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080377
11528	NC_008044	AGTGC	2	10	568155	568164	20 %	20 %	40 %	20 %	99080377
11529	NC_008044	CCG	2	6	568209	568214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080377
11530	NC_008044	CAA	2	6	568225	568230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080377
11531	NC_008044	CCA	2	6	568237	568242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080377
11532	NC_008044	CGA	2	6	568330	568335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080377
11533	NC_008044	CGT	2	6	568457	568462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080377
11534	NC_008044	CGC	2	6	568465	568470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080377
11535	NC_008044	AGC	2	6	568561	568566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080377
11536	NC_008044	CGTCC	2	10	568586	568595	0 %	20 %	20 %	60 %	99080377
11537	NC_008044	AGA	2	6	568626	568631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080377
11538	NC_008044	ATC	2	6	568826	568831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080377
11539	NC_008044	TCG	2	6	568848	568853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080377
11540	NC_008044	CGA	2	6	568882	568887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080377
11541	NC_008044	CGCC	2	8	568894	568901	0 %	0 %	25 %	75 %	99080377
11542	NC_008044	GCG	2	6	568962	568967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080377
11543	NC_008044	ATC	2	6	568977	568982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080377
11544	NC_008044	CTT	2	6	568991	568996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_008044	CTG	2	6	569021	569026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_008044	GGC	2	6	569035	569040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_008044	CAG	2	6	569134	569139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_008044	GCGCC	2	10	569172	569181	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11549	NC_008044	GGC	2	6	569221	569226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_008044	GA	3	6	569227	569232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_008044	TGC	2	6	569257	569262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_008044	GAC	2	6	569296	569301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_008044	TTGC	2	8	569308	569315	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11554	NC_008044	GTC	2	6	569317	569322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_008044	GAT	2	6	569337	569342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_008044	GTA	2	6	569343	569348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_008044	GCG	2	6	569403	569408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080378
11558	NC_008044	GAG	2	6	569499	569504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080378
11559	NC_008044	GAC	2	6	569595	569600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080378
11560	NC_008044	GGC	2	6	569675	569680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080378
11561	NC_008044	CTG	2	6	569711	569716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080378
11562	NC_008044	CCGAT	2	10	569770	569779	20 %	20 %	20 %	40 %	99080378
11563	NC_008044	GAT	2	6	569782	569787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080378
11564	NC_008044	CAGG	2	8	569788	569795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_008044	GGCGC	2	10	569864	569873	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11566	NC_008044	TC	3	6	569927	569932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11569	NC_008044	CCT	2	6	570166	570171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11570	NC_008044	ACG	2	6	570237	570242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_008044	CT	3	6	570330	570335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11572	NC_008044	TTTA	2	8	570362	570369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11577	NC_008044	TTAT	2	8	570529	570536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_008044	TTGT	2	8	570567	570574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11588	NC_008044	TGA	2	6	571520	571525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080380
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11595	NC_008044	GTG	2	6	571900	571905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080380
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11597	NC_008044	GGC	2	6	571986	571991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080380
11598	NC_008044	GC	3	6	571990	571995	0 %	0 %	50 %	50 %	99080380
11599	NC_008044	TGA	2	6	572132	572137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080380
11600	NC_008044	TC	3	6	572153	572158	0 %	50 %	0 %	50 %	99080380
11601	NC_008044	CA	3	6	572256	572261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_008044	GTT	2	6	572321	572326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_008044	TCC	2	6	572357	572362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_008044	CAT	2	6	572380	572385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_008044	T	7	7	572416	572422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_008044	T	8	8	572433	572440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_008044	CA	4	8	572488	572495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11608	NC_008044	ACC	2	6	572562	572567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11609	NC_008044	CCAG	2	8	572568	572575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_008044	GCA	2	6	572592	572597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_008044	TGAGC	2	10	572667	572676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11612	NC_008044	AACA	2	8	572805	572812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11613	NC_008044	AGA	2	6	572816	572821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_008044	CGG	2	6	572853	572858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_008044	AGC	2	6	572859	572864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_008044	GCC	2	6	572913	572918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11617	NC_008044	ATACCT	2	12	572949	572960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_008044	GC	4	8	572975	572982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_008044	CT	3	6	573015	573020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_008044	CGA	2	6	573024	573029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_008044	GTG	2	6	573101	573106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080381
11622	NC_008044	TTG	2	6	573155	573160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080381
11623	NC_008044	GGC	2	6	573248	573253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080381
11624	NC_008044	GGC	2	6	573312	573317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080381
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11995	NC_008044	GAT	2	6	591670	591675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080395
11996	NC_008044	CAT	2	6	591688	591693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080395
11997	NC_008044	ATG	2	6	591738	591743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080395
11998	NC_008044	CG	3	6	591898	591903	0 %	0 %	50 %	50 %	99080395
11999	NC_008044	CGT	2	6	592160	592165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12000	NC_008044	GAT	2	6	592174	592179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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