MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008044	GC	3	6	540248	540253	0 %	0 %	50 %	50 %	99080355
11002	NC_008044	CGG	4	12	540318	540329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080355
11003	NC_008044	GCA	2	6	540403	540408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080355
11004	NC_008044	TGT	2	6	540418	540423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080355
11005	NC_008044	ACCTCC	2	12	540485	540496	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	99080355
11006	NC_008044	CGA	2	6	540504	540509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080355
11007	NC_008044	CGC	2	6	540520	540525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080355
11008	NC_008044	GGC	2	6	540586	540591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080355
11009	NC_008044	CGG	2	6	540616	540621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080355
11010	NC_008044	CG	3	6	540643	540648	0 %	0 %	50 %	50 %	99080355
11011	NC_008044	GGCA	2	8	540700	540707	25 %	0 %	50 %	25 %	99080355
11012	NC_008044	GTTG	2	8	540733	540740	0 %	50 %	50 %	0 %	99080355
11013	NC_008044	ACC	2	6	540755	540760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080355
11014	NC_008044	GCG	2	6	540785	540790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080355
11015	NC_008044	GTG	2	6	540818	540823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080355
11016	NC_008044	GGC	2	6	540949	540954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080355
11017	NC_008044	AGCGAT	2	12	541025	541036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99080355
11018	NC_008044	AGG	2	6	541083	541088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080355
11019	NC_008044	G	7	7	541183	541189	0 %	0 %	100 %	0 %	99080356
11020	NC_008044	GCG	2	6	541205	541210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080356
11021	NC_008044	GCC	2	6	541393	541398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080356
11022	NC_008044	GTC	2	6	541422	541427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080356
11023	NC_008044	GTGAT	2	10	541517	541526	20 %	40 %	40 %	0 %	99080356
11024	NC_008044	GTG	2	6	541576	541581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11025	NC_008044	CGC	2	6	541685	541690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080356
11026	NC_008044	GGT	2	6	541698	541703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11027	NC_008044	TG	3	6	541715	541720	0 %	50 %	50 %	0 %	99080356
11028	NC_008044	GAT	2	6	541788	541793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080356
11029	NC_008044	TTG	2	6	541823	541828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080356
11030	NC_008044	GCAG	2	8	541840	541847	25 %	0 %	50 %	25 %	99080356
11031	NC_008044	CGC	3	9	541854	541862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080356
11032	NC_008044	GCT	2	6	541864	541869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080356
11033	NC_008044	TGG	2	6	541899	541904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11034	NC_008044	GAC	2	6	541927	541932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080356
11035	NC_008044	GTG	2	6	541951	541956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11036	NC_008044	GC	3	6	541958	541963	0 %	0 %	50 %	50 %	99080356
11037	NC_008044	GGT	2	6	542043	542048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11038	NC_008044	CT	3	6	542056	542061	0 %	50 %	0 %	50 %	99080356
11039	NC_008044	GCT	2	6	542062	542067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080356
11040	NC_008044	CAA	2	6	542124	542129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080356
11041	NC_008044	GGT	2	6	542200	542205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11042	NC_008044	CGGG	2	8	542231	542238	0 %	0 %	75 %	25 %	99080356
11043	NC_008044	CGC	2	6	542273	542278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080356
11044	NC_008044	GGT	2	6	542313	542318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080356
11045	NC_008044	TGC	2	6	542324	542329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080356
11046	NC_008044	CGA	2	6	542334	542339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080356
11047	NC_008044	GAG	3	9	542341	542349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080356
11048	NC_008044	GGGC	2	8	542413	542420	0 %	0 %	75 %	25 %	99080356
11049	NC_008044	CG	3	6	542443	542448	0 %	0 %	50 %	50 %	99080356
11050	NC_008044	TCC	2	6	542530	542535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080356
11051	NC_008044	C	6	6	542649	542654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11052	NC_008044	TCA	2	6	542804	542809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080357
11053	NC_008044	CTG	3	9	542866	542874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080357
11054	NC_008044	GAT	2	6	542976	542981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080357
11055	NC_008044	CAT	2	6	543045	543050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080357
11056	NC_008044	GCC	2	6	543052	543057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080357
11057	NC_008044	CG	4	8	543174	543181	0 %	0 %	50 %	50 %	99080357
11058	NC_008044	ATC	2	6	543196	543201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080357
11059	NC_008044	AGG	2	6	543227	543232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080357
11060	NC_008044	CCA	2	6	543311	543316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080357
11061	NC_008044	GAT	2	6	543372	543377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080357
11062	NC_008044	GGC	2	6	543378	543383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080357
11063	NC_008044	GGCG	2	8	543441	543448	0 %	0 %	75 %	25 %	99080357
11064	NC_008044	TCG	2	6	543494	543499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080357
11065	NC_008044	AAT	2	6	543569	543574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99080357
11066	NC_008044	TGC	2	6	543638	543643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080358
11067	NC_008044	GTG	3	9	543663	543671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080358
11068	NC_008044	ACA	2	6	543697	543702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080358
11069	NC_008044	TTGTG	2	10	543730	543739	0 %	60 %	40 %	0 %	99080358
11070	NC_008044	TGG	2	6	543751	543756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080358
11071	NC_008044	GCTGAC	2	12	543758	543769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99080358
11072	NC_008044	CAT	2	6	543821	543826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080358
11073	NC_008044	GGT	2	6	543983	543988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080358
11074	NC_008044	TGA	2	6	544000	544005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080358
11075	NC_008044	CGT	2	6	544028	544033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080358
11076	NC_008044	CGGG	2	8	544089	544096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11077	NC_008044	A	6	6	544147	544152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_008044	GCC	2	6	544153	544158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11079	NC_008044	CGG	2	6	544172	544177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_008044	GTC	2	6	544215	544220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080359
11081	NC_008044	AAG	2	6	544273	544278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080359
11082	NC_008044	TTG	2	6	544384	544389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080359
11083	NC_008044	TTC	2	6	544408	544413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080359
11084	NC_008044	AGCCCA	2	12	544426	544437	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99080359
11085	NC_008044	GCT	2	6	544445	544450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080359
11086	NC_008044	GC	3	6	544458	544463	0 %	0 %	50 %	50 %	99080359
11087	NC_008044	CAG	2	6	544485	544490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080359
11088	NC_008044	GC	3	6	544534	544539	0 %	0 %	50 %	50 %	99080359
11089	NC_008044	TCG	2	6	544588	544593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080359
11090	NC_008044	GC	4	8	544632	544639	0 %	0 %	50 %	50 %	99080359
11091	NC_008044	GCG	2	6	544721	544726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080359
11092	NC_008044	GGT	2	6	544818	544823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080359
11093	NC_008044	GC	3	6	544940	544945	0 %	0 %	50 %	50 %	99080359
11094	NC_008044	GTC	2	6	545115	545120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080359
11095	NC_008044	CAG	2	6	545192	545197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080359
11096	NC_008044	CTG	2	6	545329	545334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080360
11097	NC_008044	GTA	2	6	545347	545352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080360
11098	NC_008044	CTT	2	6	545368	545373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080360
11099	NC_008044	GC	3	6	545388	545393	0 %	0 %	50 %	50 %	99080360
11100	NC_008044	CCG	2	6	545418	545423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080360
11101	NC_008044	GAA	2	6	545425	545430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080360
11102	NC_008044	GAT	2	6	545485	545490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080360
11103	NC_008044	TAG	2	6	545561	545566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080360
11104	NC_008044	CCTT	2	8	545582	545589	0 %	50 %	0 %	50 %	99080360
11105	NC_008044	GGAT	2	8	545615	545622	25 %	25 %	50 %	0 %	99080360
11106	NC_008044	GAG	2	6	545624	545629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080360
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11108	NC_008044	TCA	2	6	545703	545708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080360
11109	NC_008044	CGGT	2	8	545783	545790	0 %	25 %	50 %	25 %	99080360
11110	NC_008044	AAG	2	6	545825	545830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080360
11111	NC_008044	GACCAA	2	12	546015	546026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	99080360
11112	NC_008044	CTT	2	6	546036	546041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080360
11113	NC_008044	GC	3	6	546102	546107	0 %	0 %	50 %	50 %	99080360
11114	NC_008044	TGCC	2	8	546126	546133	0 %	25 %	25 %	50 %	99080360
11115	NC_008044	GTC	2	6	546217	546222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080360
11116	NC_008044	ATG	2	6	546326	546331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080360
11117	NC_008044	GAA	2	6	546373	546378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080360
11118	NC_008044	CG	5	10	546379	546388	0 %	0 %	50 %	50 %	99080360
11119	NC_008044	TCT	2	6	546393	546398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080360
11120	NC_008044	CCA	2	6	546420	546425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080360
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11122	NC_008044	CAC	2	6	546553	546558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080360
11123	NC_008044	CCGCGC	2	12	546657	546668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080360
11124	NC_008044	AAG	2	6	546712	546717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080360
11125	NC_008044	TCA	2	6	546720	546725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080360
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11127	NC_008044	CGC	2	6	546813	546818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080360
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11144	NC_008044	GAG	2	6	547596	547601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080361
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11153	NC_008044	CCG	2	6	548151	548156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11154	NC_008044	GTC	2	6	548159	548164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11156	NC_008044	GCA	2	6	548280	548285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11158	NC_008044	GGT	2	6	548394	548399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11159	NC_008044	CAGGG	2	10	548412	548421	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11160	NC_008044	CGC	2	6	548585	548590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11161	NC_008044	CACCT	2	10	548731	548740	20 %	20 %	0 %	60 %	99080363
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11212	NC_008044	CG	3	6	550609	550614	0 %	0 %	50 %	50 %	99080365
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11224	NC_008044	CACC	2	8	551313	551320	25 %	0 %	0 %	75 %	99080366
11225	NC_008044	ATC	2	6	551321	551326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080366
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11227	NC_008044	CGTTC	2	10	551392	551401	0 %	40 %	20 %	40 %	99080366
11228	NC_008044	CCT	2	6	551517	551522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080366
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11230	NC_008044	CG	4	8	551556	551563	0 %	0 %	50 %	50 %	99080366
11231	NC_008044	GTGA	2	8	551582	551589	25 %	25 %	50 %	0 %	99080366
11232	NC_008044	GGT	3	9	551677	551685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080366
11233	NC_008044	GC	5	10	551710	551719	0 %	0 %	50 %	50 %	99080366
11234	NC_008044	GCA	2	6	551814	551819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080366
11235	NC_008044	GTG	2	6	551846	551851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080366
11236	NC_008044	CGC	2	6	551923	551928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080366
11237	NC_008044	T	6	6	551963	551968	0 %	100 %	0 %	0 %	99080366
11238	NC_008044	AGA	2	6	552170	552175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080366
11239	NC_008044	CTG	2	6	552301	552306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11240	NC_008044	GT	3	6	552345	552350	0 %	50 %	50 %	0 %	99080367
11241	NC_008044	GTC	2	6	552360	552365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080367
11242	NC_008044	AGGGC	2	10	552404	552413	20 %	0 %	60 %	20 %	99080367
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11244	NC_008044	GGC	2	6	552564	552569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080367
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11365	NC_008044	TGCG	2	8	559689	559696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11366	NC_008044	GCA	2	6	559723	559728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11368	NC_008044	CG	3	6	559905	559910	0 %	0 %	50 %	50 %	99080372
11369	NC_008044	TTG	2	6	560089	560094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080372
11370	NC_008044	CAT	2	6	560099	560104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080372
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11372	NC_008044	GCT	2	6	560220	560225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080372
11373	NC_008044	CAT	2	6	560249	560254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080372
11374	NC_008044	GTG	2	6	560299	560304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080372
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11377	NC_008044	GCT	2	6	560463	560468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080372
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11379	NC_008044	CTG	2	6	560562	560567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080372
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11422	NC_008044	ACTT	2	8	562423	562430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11423	NC_008044	GGGGT	2	10	562590	562599	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11424	NC_008044	GGC	2	6	562612	562617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11425	NC_008044	GC	4	8	562616	562623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11426	NC_008044	AC	3	6	562668	562673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11427	NC_008044	AG	4	8	562839	562846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11428	NC_008044	CAA	2	6	562888	562893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11429	NC_008044	AGG	2	6	562963	562968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11431	NC_008044	AGG	2	6	562988	562993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11432	NC_008044	CG	3	6	563047	563052	0 %	0 %	50 %	50 %	99080373
11433	NC_008044	GGA	2	6	563249	563254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080373
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11479	NC_008044	CTTT	2	8	565881	565888	0 %	75 %	0 %	25 %	99080375
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11488	NC_008044	ACCGCC	2	12	566293	566304	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	99080376
11489	NC_008044	C	6	6	566303	566308	0 %	0 %	0 %	100 %	99080376
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11491	NC_008044	ATT	2	6	566419	566424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080376
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11493	NC_008044	TGA	2	6	566511	566516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080376
11494	NC_008044	TCA	2	6	566561	566566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080376
11495	NC_008044	GCG	2	6	566638	566643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080376
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