MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_008044	GGA	2	6	515916	515921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080334
10503	NC_008044	CG	3	6	515924	515929	0 %	0 %	50 %	50 %	99080334
10504	NC_008044	CTGCG	2	10	515991	516000	0 %	20 %	40 %	40 %	99080334
10505	NC_008044	TG	3	6	516021	516026	0 %	50 %	50 %	0 %	99080334
10506	NC_008044	GAT	2	6	516213	516218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080334
10507	NC_008044	CG	3	6	516303	516308	0 %	0 %	50 %	50 %	99080334
10508	NC_008044	CTT	2	6	516348	516353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080334
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10510	NC_008044	AGATC	2	10	516398	516407	40 %	20 %	20 %	20 %	99080334
10511	NC_008044	CTC	2	6	516501	516506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080334
10512	NC_008044	GCC	2	6	516546	516551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080334
10513	NC_008044	GC	3	6	516605	516610	0 %	0 %	50 %	50 %	99080334
10514	NC_008044	CGG	2	6	516614	516619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080334
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10517	NC_008044	CGG	2	6	516839	516844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080335
10518	NC_008044	CGCC	2	8	516914	516921	0 %	0 %	25 %	75 %	99080335
10519	NC_008044	CAC	2	6	516939	516944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080335
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10521	NC_008044	ACC	2	6	517006	517011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080335
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10523	NC_008044	CGT	2	6	517172	517177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080335
10524	NC_008044	CACC	2	8	517184	517191	25 %	0 %	0 %	75 %	99080335
10525	NC_008044	GC	3	6	517192	517197	0 %	0 %	50 %	50 %	99080335
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10528	NC_008044	GAG	2	6	517346	517351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080335
10529	NC_008044	CGGCCG	2	12	517487	517498	0 %	0 %	50 %	50 %	99080335
10530	NC_008044	CGA	2	6	517562	517567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080335
10531	NC_008044	TCA	2	6	517568	517573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080335
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10536	NC_008044	CAGA	2	8	517694	517701	50 %	0 %	25 %	25 %	99080335
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10540	NC_008044	AGGC	2	8	517811	517818	25 %	0 %	50 %	25 %	99080336
10541	NC_008044	CGC	2	6	517840	517845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080336
10542	NC_008044	ATGT	2	8	517848	517855	25 %	50 %	25 %	0 %	99080336
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10546	NC_008044	GCC	2	6	518073	518078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080336
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10554	NC_008044	ATC	2	6	518382	518387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080336
10555	NC_008044	GCCCAG	2	12	518388	518399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	99080336
10556	NC_008044	GAT	2	6	518495	518500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080336
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10559	NC_008044	CAG	2	6	518726	518731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080336
10560	NC_008044	ATC	2	6	518784	518789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080336
10561	NC_008044	TCT	2	6	518835	518840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_008044	CCG	2	6	518852	518857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10563	NC_008044	CCATG	2	10	518923	518932	20 %	20 %	20 %	40 %	99080337
10564	NC_008044	CAT	2	6	518942	518947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080337
10565	NC_008044	GAC	2	6	518998	519003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080337
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10568	NC_008044	GCC	5	15	519117	519131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080337
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10572	NC_008044	TGA	2	6	519277	519282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080337
10573	NC_008044	TCT	2	6	519283	519288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080337
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10576	NC_008044	CGGCG	2	10	519389	519398	0 %	0 %	60 %	40 %	99080337
10577	NC_008044	TCT	2	6	519414	519419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080337
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10579	NC_008044	TCACC	2	10	519511	519520	20 %	20 %	0 %	60 %	99080337
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10587	NC_008044	TCG	2	6	519799	519804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080337
10588	NC_008044	GC	3	6	519817	519822	0 %	0 %	50 %	50 %	99080337
10589	NC_008044	TTC	2	6	519827	519832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080337
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10593	NC_008044	GC	4	8	520188	520195	0 %	0 %	50 %	50 %	99080337
10594	NC_008044	ATC	2	6	520272	520277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080337
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10603	NC_008044	ATC	2	6	520925	520930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080338
10604	NC_008044	CAGC	2	8	520931	520938	25 %	0 %	25 %	50 %	99080338
10605	NC_008044	TGGCGC	2	12	520948	520959	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99080338
10606	NC_008044	GC	3	6	520968	520973	0 %	0 %	50 %	50 %	99080338
10607	NC_008044	TCCGG	2	10	521009	521018	0 %	20 %	40 %	40 %	99080338
10608	NC_008044	GCA	2	6	521107	521112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080338
10609	NC_008044	ATGC	2	8	521133	521140	25 %	25 %	25 %	25 %	99080338
10610	NC_008044	GCG	2	6	521174	521179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080338
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10615	NC_008044	GTAG	2	8	521594	521601	25 %	25 %	50 %	0 %	99080339
10616	NC_008044	AGCC	2	8	521658	521665	25 %	0 %	25 %	50 %	99080339
10617	NC_008044	CAT	2	6	521731	521736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080339
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10621	NC_008044	CGC	3	9	521924	521932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080339
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10627	NC_008044	GCC	2	6	522180	522185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080339
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10871	NC_008044	GTC	2	6	534206	534211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080347
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10873	NC_008044	GCAG	2	8	534344	534351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10992	NC_008044	TG	3	6	539657	539662	0 %	50 %	50 %	0 %	99080354
10993	NC_008044	GCAG	2	8	539776	539783	25 %	0 %	50 %	25 %	99080354
10994	NC_008044	CCA	2	6	539895	539900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080354
10995	NC_008044	GAA	2	6	539939	539944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080354
10996	NC_008044	GCA	2	6	539953	539958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080354
10997	NC_008044	GC	5	10	539980	539989	0 %	0 %	50 %	50 %	99080354
10998	NC_008044	TGG	2	6	540015	540020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080354
10999	NC_008044	ATG	2	6	540079	540084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_008044	GCA	2	6	540169	540174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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