MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008044	AGA	2	6	295541	295546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008044	GCG	2	6	295551	295556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_008044	ACA	2	6	295604	295609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080130
6004	NC_008044	TC	3	6	295667	295672	0 %	50 %	0 %	50 %	99080130
6005	NC_008044	GCA	2	6	295676	295681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080130
6006	NC_008044	GT	3	6	295688	295693	0 %	50 %	50 %	0 %	99080130
6007	NC_008044	ATGC	2	8	295737	295744	25 %	25 %	25 %	25 %	99080130
6008	NC_008044	GC	3	6	295812	295817	0 %	0 %	50 %	50 %	99080130
6009	NC_008044	GGCG	2	8	295834	295841	0 %	0 %	75 %	25 %	99080130
6010	NC_008044	GA	3	6	295897	295902	50 %	0 %	50 %	0 %	99080130
6011	NC_008044	CGC	2	6	295943	295948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080130
6012	NC_008044	TGA	2	6	295955	295960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080130
6013	NC_008044	GC	3	6	295971	295976	0 %	0 %	50 %	50 %	99080130
6014	NC_008044	G	6	6	296007	296012	0 %	0 %	100 %	0 %	99080130
6015	NC_008044	GCG	2	6	296031	296036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080130
6016	NC_008044	GC	3	6	296064	296069	0 %	0 %	50 %	50 %	99080130
6017	NC_008044	CCA	2	6	296080	296085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080130
6018	NC_008044	AAGG	2	8	296103	296110	50 %	0 %	50 %	0 %	99080130
6019	NC_008044	CTGCGG	2	12	296120	296131	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99080130
6020	NC_008044	TGA	2	6	296285	296290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080130
6021	NC_008044	GGCGCA	2	12	296291	296302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99080130
6022	NC_008044	GAT	2	6	296324	296329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080130
6023	NC_008044	CGC	2	6	296418	296423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080130
6024	NC_008044	GTC	2	6	296442	296447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080130
6025	NC_008044	TTC	2	6	296490	296495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080130
6026	NC_008044	GAT	2	6	296496	296501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080130
6027	NC_008044	GGATC	2	10	296615	296624	20 %	20 %	40 %	20 %	99080130
6028	NC_008044	ACC	2	6	296719	296724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080130
6029	NC_008044	CG	3	6	296728	296733	0 %	0 %	50 %	50 %	99080130
6030	NC_008044	CAC	2	6	296779	296784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080130
6031	NC_008044	CTG	2	6	296817	296822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080130
6032	NC_008044	GGGC	2	8	296900	296907	0 %	0 %	75 %	25 %	99080130
6033	NC_008044	AC	3	6	296962	296967	50 %	0 %	0 %	50 %	99080130
6034	NC_008044	CG	3	6	297004	297009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_008044	CCAC	2	8	297022	297029	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6036	NC_008044	GAG	2	6	297061	297066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008044	GC	3	6	297136	297141	0 %	0 %	50 %	50 %	99080131
6038	NC_008044	CG	3	6	297144	297149	0 %	0 %	50 %	50 %	99080131
6039	NC_008044	TGC	2	6	297238	297243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080131
6040	NC_008044	GC	4	8	297242	297249	0 %	0 %	50 %	50 %	99080131
6041	NC_008044	GGC	2	6	297329	297334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080131
6042	NC_008044	TGA	2	6	297367	297372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080131
6043	NC_008044	CAC	2	6	297392	297397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080131
6044	NC_008044	GCCCTT	2	12	297498	297509	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	99080131
6045	NC_008044	ATG	2	6	297513	297518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080131
6046	NC_008044	GCG	2	6	297543	297548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6047	NC_008044	GAC	2	6	297572	297577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080132
6048	NC_008044	GGC	2	6	297578	297583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6049	NC_008044	GCG	2	6	297604	297609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6050	NC_008044	GC	3	6	297767	297772	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6051	NC_008044	GAT	2	6	297802	297807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080132
6052	NC_008044	GAC	2	6	297830	297835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080132
6053	NC_008044	CAA	2	6	297850	297855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080132
6054	NC_008044	CCGG	2	8	297857	297864	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6055	NC_008044	GGC	2	6	297878	297883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6056	NC_008044	CAC	2	6	297889	297894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080132
6057	NC_008044	GC	3	6	297998	298003	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6058	NC_008044	GGC	2	6	298012	298017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6059	NC_008044	TGG	2	6	298074	298079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080132
6060	NC_008044	GAT	2	6	298165	298170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080132
6061	NC_008044	CG	3	6	298182	298187	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6062	NC_008044	GC	4	8	298213	298220	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6063	NC_008044	TAT	2	6	298226	298231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080132
6064	NC_008044	CACC	2	8	298294	298301	25 %	0 %	0 %	75 %	99080132
6065	NC_008044	TGCG	2	8	298305	298312	0 %	25 %	50 %	25 %	99080132
6066	NC_008044	GGC	2	6	298358	298363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6067	NC_008044	GC	3	6	298395	298400	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6068	NC_008044	CGG	2	6	298405	298410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080132
6069	NC_008044	GAA	2	6	298420	298425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080132
6070	NC_008044	GC	3	6	298439	298444	0 %	0 %	50 %	50 %	99080132
6071	NC_008044	GTG	2	6	298478	298483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080132
6072	NC_008044	AG	3	6	298516	298521	50 %	0 %	50 %	0 %	99080132
6073	NC_008044	GCC	2	6	298553	298558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080132
6074	NC_008044	GAC	2	6	298559	298564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080132
6075	NC_008044	TGG	2	6	298628	298633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080133
6076	NC_008044	GCG	2	6	298705	298710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080133
6077	NC_008044	GCA	2	6	298843	298848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080133
6078	NC_008044	CGC	2	6	298853	298858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080133
6079	NC_008044	GC	3	6	298870	298875	0 %	0 %	50 %	50 %	99080133
6080	NC_008044	CAC	2	6	299008	299013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080133
6081	NC_008044	GAT	2	6	299034	299039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080133
6082	NC_008044	TGA	2	6	299084	299089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080133
6083	NC_008044	CGC	2	6	299124	299129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080133
6084	NC_008044	GC	3	6	299181	299186	0 %	0 %	50 %	50 %	99080133
6085	NC_008044	CTG	2	6	299224	299229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080133
6086	NC_008044	GAA	2	6	299300	299305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_008044	GAG	2	6	299363	299368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080134
6088	NC_008044	GAC	2	6	299369	299374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080134
6089	NC_008044	GCG	2	6	299401	299406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080134
6090	NC_008044	CG	4	8	299445	299452	0 %	0 %	50 %	50 %	99080134
6091	NC_008044	CGC	2	6	299467	299472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080134
6092	NC_008044	AGG	2	6	299487	299492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080134
6093	NC_008044	TGT	2	6	299610	299615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080134
6094	NC_008044	TGG	2	6	299643	299648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080134
6095	NC_008044	GC	3	6	299694	299699	0 %	0 %	50 %	50 %	99080134
6096	NC_008044	TGCA	2	8	299733	299740	25 %	25 %	25 %	25 %	99080134
6097	NC_008044	TGG	2	6	299823	299828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080134
6098	NC_008044	GC	3	6	299875	299880	0 %	0 %	50 %	50 %	99080134
6099	NC_008044	TGA	2	6	299911	299916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080134
6100	NC_008044	AAG	2	6	299925	299930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080134
6101	NC_008044	A	6	6	299975	299980	100 %	0 %	0 %	0 %	99080134
6102	NC_008044	CG	3	6	300025	300030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_008044	GGC	2	6	300073	300078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_008044	CG	3	6	300107	300112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_008044	A	6	6	300140	300145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_008044	ACGT	2	8	300204	300211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_008044	TGA	2	6	300212	300217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_008044	GGGT	2	8	300281	300288	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_008044	ACC	2	6	300297	300302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_008044	GC	3	6	300357	300362	0 %	0 %	50 %	50 %	99080135
6111	NC_008044	GCAGCC	2	12	300389	300400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	99080135
6112	NC_008044	GAC	2	6	300410	300415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
6113	NC_008044	AACTG	2	10	300432	300441	40 %	20 %	20 %	20 %	99080135
6114	NC_008044	CGAACG	2	12	300477	300488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
6115	NC_008044	TGC	2	6	300529	300534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080135
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6118	NC_008044	ACT	2	6	300693	300698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080135
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6121	NC_008044	ACC	3	9	300788	300796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080135
6122	NC_008044	CTT	2	6	300814	300819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080135
6123	NC_008044	CAA	2	6	300826	300831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080135
6124	NC_008044	GC	3	6	300872	300877	0 %	0 %	50 %	50 %	99080135
6125	NC_008044	CAG	2	6	300878	300883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
6126	NC_008044	ACC	2	6	300911	300916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080135
6127	NC_008044	GGC	2	6	300931	300936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080135
6128	NC_008044	CG	3	6	300941	300946	0 %	0 %	50 %	50 %	99080135
6129	NC_008044	GAC	2	6	300953	300958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
6130	NC_008044	GCA	2	6	300959	300964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080135
6131	NC_008044	ATC	2	6	300986	300991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080135
6132	NC_008044	GGC	2	6	301229	301234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080135
6133	NC_008044	TGG	2	6	301318	301323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080135
6134	NC_008044	CCG	2	6	301337	301342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080135
6135	NC_008044	CTT	2	6	301392	301397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6136	NC_008044	GAA	2	6	301442	301447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_008044	GGA	2	6	301456	301461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_008044	TGAC	2	8	301503	301510	25 %	25 %	25 %	25 %	99080136
6139	NC_008044	CCG	2	6	301511	301516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080136
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6143	NC_008044	ATC	2	6	301826	301831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080136
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6148	NC_008044	G	6	6	301977	301982	0 %	0 %	100 %	0 %	99080136
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6151	NC_008044	TGC	2	6	302274	302279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080136
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6153	NC_008044	CAGA	2	8	302450	302457	50 %	0 %	25 %	25 %	99080136
6154	NC_008044	GGC	2	6	302458	302463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080136
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6166	NC_008044	GTGTC	2	10	302978	302987	0 %	40 %	40 %	20 %	99080137
6167	NC_008044	CTG	2	6	303029	303034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080137
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6237	NC_008044	AGA	2	6	306885	306890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6238	NC_008044	GC	3	6	306918	306923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6239	NC_008044	ATC	2	6	307017	307022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080142
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6241	NC_008044	GC	3	6	307095	307100	0 %	0 %	50 %	50 %	99080142
6242	NC_008044	CGC	2	6	307105	307110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080142
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6248	NC_008044	CGG	2	6	307189	307194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080142
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6372	NC_008044	GAT	2	6	312777	312782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080148
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